Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas tēmu pasniegšanas metodika skolā.

Slides:



Advertisements
Similar presentations
1 Windows 7 pazemināšanas pamācība /Windows 7 downgrade/
Advertisements

Ti plasmid derived vector system
Sociālās stereotipizācijas izziņas teorija Viktorija Moskina „Teorētiskā bāze maģistra darba izstrādei” Prāga Cognitive Theory of Social Stereotyping.
Latvijas iedzīvotāju attieksme pret balsošanu internetā Latvijas iedzīvotāju aptauju rezultāti gada 8. jūnijā Pētījumu centra SKDS projektu direktore.
Globālo zināšanu sakārtošanas metateorija TOGA Dace Ūdre Zviedrijas bibliotēku un informācijas zinātnes skola Burosas universitāte (Burosa, Zviedrija)
MCB 720: Molecular Biology Eukaryotic gene organization Restriction enzymes Cloning vectors.
Sociālā darba un sociālās pedagoģijas augstskola “Attīstība” Krīze laulības dzīvē Psihosociālais darbs ar ģimeni Lektore: K. Dūdiņa Darbu sagatavoja: I.
Sistēmu analīze un zināšanu iegūšana
Cienot pagātni, Domājot par nākotni, Čakli strādājot šodienai ! Mērsragā, 2013.gada 6.aprīlī.
TOPICS IN (NANO) BIOTECHNOLOGY Lecture 6 30th October, 2006 PhD Course.
BIOTEHNOLOĢIJA III : REKOMBINANTU BIOTEHNOLOĢIJA JAUNĀ BIOTEHNOLOĢIJA I. Muižnieks, g.
Restriction Enzyme Ms. Sreylen MEAS Mr. Channratha PRUM Mr. Boonkird Choksukchalalai Mr. Thoranin Intarajakra.
BIOTEHNOLOĢIJA III : REKOMBINANTU BIOTEHNOLOĢIJA JAUNĀ BIOTEHNOLOĢIJA I. Muižnieks, g. pavasaris.
Apslēptās patiesības meklējumos LU 67. konference. Teoloģija. Zinātnes un reliģijas dialogs, Dace Apšvalka RTU, DITF, LDI, Sistēmu teorijas.
BIOTEHNOLOĢIJA III : REKOMBINANTU BIOTEHNOLOĢIJA JAUNĀ BIOTEHNOLOĢIJA I. Muižnieks, g.
BIOTEHNOLOĢIJA III : REKOMBINANTU BIOTEHNOLOĢIJA
2 Izstrādātājs : Zhuhai Fohow Health Research Institute Ražotājs : Huaxian Huayue Biotechnology Co., Ltd. Product Standart No. GB derīgums 2 gadi.
Anjonu paketes Fohow Anjonu paketes Fohow. Vai Jūs zināt, ka..... Vai Jūs zināt, ka.....  Savas dzīves 30 – 40 gadu periodā sieviete izlieto vidēji 15.
Music: Nightengale Serenade Friendship Bouquet Draudzibas bukete.
Lekcija.
Mikrofilamenti.
Drošība un veselība darbā skar ikvienu no mums. Ieguvums jums. Ieguvums jūsu uzņēmumam. Viseiropas sabiedriskās domas aptauja par darba drošību un veselību.
Profesors Ivars Brīvers, Rīga - Ventspils, Latvija
E-risinājumi pašvaldībām Pašvaldības budžeta plānošanas un finanšu vadības risinājums Romāns Kairovs, FMS Kaspars Vitenbergs, Ventspils pilsētas Dome Baltic.
CLONING VECTORS Shumaila Azam. IMPORTANT CLONING VECTORS.
VĪRUSU UN ĀRPUSHROMOSOMU ELEMENTU GRUPAS Retrovīrusi un Hepadnavīrusi
Nukleīnskābju un proteīnu sekvenču līdzības pamatprincipi Nukleīnskābju un proteīnu sekvenču daudzkārtējs salīdzinājums.
Ģenētiski modificēto organismu (ĢMO) izmantošanas ētiskās problēmas
ŠŪNAS BIOLOĢIJA I DZĪVĪBAS ĶĪMIJA II ŠŪNAS UZBŪVE Indriķis Muižnieks
(VĪRUSI UN ĀRPUSHROMOSOMU ĢENĒTISKIE ELEMENTI)
Molekulārā bioloģija un vēža diagnostikas jautājumi
ĢENĒTISKI MODIFICĒTĀ PĀRTIKA
Asins šūnas un imunitāte
DABASZINĀTŅU STUDENTIEM
Windows Live Movie Maker iespējas
ĢENĒTISKI MODIFICĒTĀ PĀRTIKA
4.lekcija BAROTŅU PIEDEVAS AUGU AUDU KULTŪRĀS
Vīrusu attīstības cikls
Kopīpašums.
Organiskās saules šūnas
Dr. Pharm. Maija Dambrova
LU 71. zinātniska konference
Latvijas un Ukrainas sadarbības programma zinātnē un tehnoloģijā
2013./2014. mācību gada 2. semestris
Natalija Pavlovska BEMA, Projects Department
TRANSGĒNU DZĪVNIEKU IEGŪŠANA UN IZMANTOŠANA BIOTEHNOLOĢIJĀ
Metabolisma pamatprincipi
1.seminārs “Pētījuma stratēģija un problēmas identificēšana”
Kortikosteroīdu lietošana antenatālājā periodā
Mikroorganismu gēnu inženierija
Hermeneitikas teorijas pielietošanas iecere maģistra darbā
(VĪRUSI UN ĀRPUSHROMOSOMU ĢENĒTISKIE ELEMENTI)
Atvērtā koda programmatūra
Jaunās biotehnoloģijas izmantošanas ētiskās problēmas
THE BEST OF THIS YEAR VOTED THE BEST OF THIS YEAR (labākā e-vēstule ‘2007)
Indriķis Muižnieks VISPĀRĪGĀ BIOLOĢIJA ORGANISMU DAUDZVEIDĪBA.
Galvenais audu saderības komplekss
ĢENĒTISKI MODIFICĒTĀ PĀRTIKA
LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra
Ģenētikas molekulārie pamati.
Darbinieku nosūtīšanas tiesiskie un praktiskie aspekti.
NETO ALGAS APRĒĶINS PĒC NODOKĻU REFORMAS UN DARBA SPĒKA NODOKĻU SLOGS
Dalībnieku iepazīšanās – leduslaušanas un iespēja iepazīt vienam otru
VĪRUSU UN ĀRPUSHROMOSOMU ELEMENTU GRUPAS Transpozoni un plazmīdas
Programmēšanas valodas Valoda C++
Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas tēmu pasniegšanas metodika skolā.
DNS TEKSTI UN VIRSTEKSTI
Cilvēka genoma uzbūve.
ĀTRUMS Ātrums – pārvietojums laika (t) vienībā Kurš ātrāk?
Presentation transcript:

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas tēmu pasniegšanas metodika skolā. 9. lekcija 2016./2017. mācību gada 2. semestris 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Gēnu inženierija (Rekombinantās DNS tehnoloģija)  Gēnu inženierija (Rekombinantās DNS tehnoloģija) DNS fragmentu mākslīga pārnese - starp jebkuriem organismiem, nosakot pārneses sākumu un beigas, arī pievienojot sintētiskus DNS fragmentus vai posmus. Parasti ietver NS izdalīšanu un apstrādi in vitro apstākļos. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML  Gēnu inženierija Attīstības priekšnosacījumi: ģenētisko un molekulāro mehānismu pakāpeniska izzināšana. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML  Gēnu inženierija Molekulāro mehānismu universālums visā dzīvajā dabā: - Ģenētisko informāciju kodē nukleīnskābes, - Ģenētiskā koda principu vienveidība, - Visi proteīni veidoti no vienām un tām pašām 20 -aminoskābēm, - Līdzība ģenētiskā materiāla darbības pamatme- hānismos - replikācijā, transkripcijā, translācijā. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Ar GI metodēm tiek veidoti ģenētiski modificēti organismi (ĢMO) (Biotech organisms) ĢMO ir organisms, kurā tā ģenētiskais materiāls ir izmainīts veidā, kas nevar notikt dabiskās vairošanās, krustošanās un rekombinācijas rezultātā. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML ĢMO Ģenētiska modificēšana notiek: - izmantojot rekombinato DNS tehnoloģiju, - izmantojot ārpus organisma sagatavota iedzimtības materiāla ievadīšanu organismā, - izmantojot noteiktas šūnu sapludināšanas metodes. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML GI eksperimentu shēma GI eksperimentos nepieciešams: - ievietojamā (pārnesamā) DNS; - DNS vektors (pārnesējs), kurā ievietot; - saimniekšūna (organisms), kurā ievadīt un pavairot rekombinanto DNS molekulu. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML GI eksperimentu shēma Ievietojamā DNS (gēns) parasti nav spējīga sevi reproducēt, tādēļ tai nepieciešams vektors: - neatkarīgi replicēties spējīga molekula (replikons) un - saimniekšūna, kurā notiek attiecīgā vektora replikācija; vai arī komplicētāka vektorsistēma, lai DNS fragmentu nogādātu līdz organisma hromosomai. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML GI eksperimentu shēma Vispārīgā gadījumā ar vektoru apzīmē ievietotā DNS fragmenta nesēju. Eikariotu GI gadījumā tas var būt rekombinants vīruss ar visiem apvalku slāņiem, virsmas receptoriem, lipīdu daļiņas (liposomas) u.c. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Vektora izvēle un sagatavošana Insertējamās DNS ieguve un sagatavošana 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

+ Rekombinantās DNS ievadīšana šūnās Inserta un vektora apvienošana Transformēto šūnu analīze un koloniju atlase 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

GI iespējas un ierobežojumi GI eksperimentos vienmēr tiek pārnesta DNS. GI manipulācijas var veikt gan ar prokariotu gan eikariotu, gan vīrusu ģenētisko materiālu (DNS un par DNS pārkopētu RNS). GI manipulācijas parasti veic mikroorganismos (baktērijās, raugos), jo tie ir viegli un ātri pavairojami. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Nukleāzes Nukleāzes ir enzīmi, kas katalizē fosfodiestersaišu hidrolīzi (šķeļšanu) starp blakus esošiem nukleotīdiem DNS un RNS molekulās. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Nukleāzes Nukleāzes grupē pēc to substrāta: - ribo-nukleāzes (RN-āzes) - iedarbojas uz RNS un - dezoksiribonukleāzes (DN-āzes) - iedarbojas uz DNS. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Nukleāzes Nukleāzes grupē - pēc iedarbības vietas nukleīnskābes molekulā: - endonukleāzes (polimēra iekšienē), - eksonukleāzes (no molekulas gala); - pēc iedarbības specifiskuma: - sekcences (saitu) specifiskas, - nespecifiskas. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Nukleāzes Viens no gēnu inženierijas pamata instrumentiem ir saitu specifiskās proteīnu dabas endo - dezoksiribonukleāzes. Tās sauc arī par restriktāzēm, restrikcijas enzīmiem. Ar šiem enzīmiem paredzamā vietā var katalizēt divpavedienu DNS molekulu hidrolīzi un iegūt noteiktus DNS fragmentus. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas - modifikācijas sistēmas Restrikcijas endonukleāzes galvenokārt sastopamas baktērijās un kopā ar atbilstošām DNS metiltransferāzēm veido baktēriju restrikcijas - modifikācijas sistēmas. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas - modifikācijas sistēmas Salīdzinot bakteriofāgu (baktēriju vīrusu) infekcijas efektivitātes starp dažādām E. coli līnijām. Noskaidrojās, ka vieni un tie paši bakteriofāgi dažādu E. coli līniju šūnas inficē atšķirīgi. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Bakteriofāgu infekcijas efektivitāte. 1/1 = 1 vīruss => 1 inficēta baktērija E.coli K E.coli B 1/1 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Bakteriofāgu infekcijas efektivitāte. 1/10 000 E.coli B E.coli K 1/1 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Bakteriofāgu infekcijas efektivitāte. E.coli K E.coli B 1/1 1/10 000 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Bakteriofāgu infekcijas efektivitāte. E.coli K E.coli B 1/1 1/10 000 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Bakteriofāgu infekcijas efektivitāte. E.coli K E.coli B 1/10 000 1/1 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Bakteriofāgu infekcijas efektivitāte. 1/10 000 E.coli B E.coli K 1/1 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Restriktāzes 60-to gadu sākumā Werner Arber postulēja, ka saimnieka šūnās darbojas mehānismi, kuri bakteriofāgus modificē un nemodificētais DNS materiāls tiek noārdīts. izdalīja pirmo restrikcijas enzīmu – EcoBI Restrikcija = ierobežošana E.coli B 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Bakteriofāgu infekcijas efektivitāte. modificēts atbilstoši B līnijai E.coli B Nukleāze EcoBI 1/1 nemodificēts vai citādi modificēts 1/10 000 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma 1. Mikroorganismus no svešas DNS sargā restrikcijas endonukleāzes, 2. Paša DNS no endonukleāzēm tiek pasargāta ar specifisku metilēšanas sistēmu, kura metilē attiecīgās endonukleāzes apdraudēto vietu DNS molekulā. 3. Metilēto (modificēto) DNS attiecīgā endonukleāze par substrātu nevar izmantot. 4. Dažādiem mikroorganismus celmiem ir atšķirīgas restrikcijas-modifikācijas sistēmas. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Restrikcijas modifikācijas sistēma Nils Rostoks Restrikcijas modifikācijas sistēma Nozīme dabā: - Pasargā baktērijas no svešas DNS (vīrusu infekcijas); - Ierobežo baktēriju iespējas savstarpēji krustoties (nodrošina labāku sugu un līniju pastāvēšanu); - [+/-] nosaka baktēriju “dzimumu”. Uba - Unidentified bacteria. Restrikcijas - modifikācijas sistēma ir zināme, bet baktērija pati nav noteikta. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Restrikcijas enzīmi Hamilton O. Smith 1970. gadā apraksta pirmo restrikcijas enzīmu no Haemophilus influenzae - Hind II un tā saitspecifiskumu. Hind II katalizē DNS hidrolīzi saistoties ar nukleotīdu secību GTPy*PuAC Mertz un Davis 1972. gadā raksturo restrikcijas enzīmu no Escherichia coli celma R, kuru nosauc par EcoRI. Tas pazīst secību GAATTC un katalizē DNS hidrolīzi veidojot 4 nukleotīdu pārkares. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Restrikcijas enzīmi 1978. gada Nobela prēmija fizioloģijā un medicīnā. 1978 Werner Arber Hamilton Smith Daniel Nathans 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Restriktāzes Pēc enzimātiskās apstrādes iegūstamie DNS gali var būt: - strupi 5'- ….. CAG-OH OP- CTG….. -3' 3'- ….. GTC -PO HO-GAC….. -5' PvuII 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Restriktāzes Pēc enzimātiskās apstrādes iegūstamie DNS gali var būt: - lipīgi - ar 3' pārkari 5'- ….. GGTAC-OH OP- C….. -3' 3'- ….. C -PO HO-CATGG….. -5' KpnI 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Restriktāzes Pēc enzimātiskās apstrādes iegūstamie DNS gali var būt: - lipīgi - ar 5' pārkari 5'- ….. G-OH OP- AATCC….. -3' 3'- ….. CTTAA -PO HO-G….. -5' EcoRI 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

DNS fragmentu apvienošana, (inserta un vektora apvienošana) + DNS ligāzes DNS fragmentu apvienošana, (inserta un vektora apvienošana) 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ligāzes Enzīmi, kas katalizē pārrautu fosfo-diestersaišu atjaunošanu nukleīnskābju molekulās. - brīva 3’ hidroksilgrupa tiek savienota ar - 5’ fosfātgrupu citā DNS fragmentā. Ligāzes ir sastopamas gan prokariotos, gan eikariotos un to galvenās funkcijas ir piedalīties DNS replikācijā, rekombinācijā, kļūdu labošanā. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML DNS Ligāzes T4 DNS ligāze + ATP 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML DNS Ligāzes + 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML DNS Ligāzes T4 DNS ligāze AMP 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

DNS klonēšanas vektori DNS klonēšanas vektoru grupas: pēc vektora izcelsmes - plazmīdu, - bakteriofāgu, - citu vīrusu vektori, - mākslīgās hromosomas. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Plazmīdu vektori Plazmīdu vektori ir izveidoti uz dabisko baktēriju plazmīdu bāzes, tās pielāgojot noteiktām gēnu inženierijas eksperimentu vajadzībām. Dabiskās plazmīdas - ekstrahromosomālas, nelielas DNS molekulas, kuras saimniekam piešķir jaunas, izdevīgas fenotipiskas pārmaiņas, piemēram, rezistenci pret antibiotiskām vielām. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Dabīgās plazmīdas Dabīgās E. coli plazmīdu grupas: - F plazmīdas (fertiliātes faktors), - R plazmīdas (antibiotiku, citu toksīnu rezisence), - Col (kolicīnu) plazmīdas, - D plazmīdas (biodegradācijas faktoru plazmīdas) - nes gēnu komplektu kāda neraksturīga savienojuma izmantošanai katabolismā, - Virulences plazmīdas - nes virulences faktoru kopu, - Kriptiskās plazmīdas - fenotipā to klātbūtne neizpaužas. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Plazmīdu vektori Pirmā plazmīdu vektoru paaudze - eksperimenti ar dabā sastopamajām plazmīdām. Tiek izmantota tetraciklīna rezistences gēnu nesoša plazmīda no Salmonella typhymurium (E. coli). 1973. gads - pirmais klonēšanas vektors. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Plazmīdu vektori Herbert Boyer, University of California at San Francisco Stanley Cohen, Stanford University 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Plazmīdu vektori pSC101 vektors tika apstrādāts ar EcoRI restriktāzi, tam tika pievienoti ar EcoRI palīdzību iegūti Xenopus laevis genomiskās DNS fragmenti, DNS molekulas tika apvienotas ar DNS ligāzes palīdzību. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Pirmie panākumi Cohen, S. N., A. C. Y. Chang, H. W. Boyer, and R. B. Helling. 1973. Construction of biologically functional bacterial plasmids in vitro. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 70: 3240-3244. Morrow, J. F., Cohen, S. N., Chang, A. C., Boyer, H. W., Goodman, H. M., & Helling, R. B. (1974). Replication and Transcription of Eukaryotic DNA in Esherichia coli. Proceedings of the National Academy of Sciences, 71(5), 1743-1747. 1973. gads 1974. gads 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Pirmie panākumi Pirmais gēnu inženierijas eksperiments tika veikts 1972. gadā. Paul Berg (1926 - ) apvienoja SV40 un l bakteriofāga geno- mus, izmantojot: - endonukleāzes, - terminālo transferāzi un - DNS ligāzi. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Pirmie panākumi Drošības apsvērumu dēļ, izveidotie vīrusu himēri baktērijās vai citos organismos netika ievadīti. 1980. ķīmijā 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

+ Rekombinantās DNS ievadīšana šūnās Inserta un vektora apvienošana Transformēto šūnu analīze un koloniju atlase 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML ĢMO (augu) iegūšana ĢM vīrusa vektors ĢMO augs ĢM šūna Klonēšana Kalluss 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Dažreiz uz augu stumbriem pēc ievainojuma attīstās augonis - vainaga panga (Crown gall). 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Vainaga panga uz rozes un tomāta. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Šo audzēju veidošanās saistīta ar vairāku sugu Agrobacterium infekciju ievainojuma vietā. Agrobacter tumefaciens uz apses saknes. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Vainaga pangas šūnas ieguvušas spēju nekontrolēti augt un dalīties. Šī spēja saglabājas arī kultūrā, - neatkarīgi no augu hormoniem, - bez Agrobacterium klātbūtnes. Tas liecina par augu šūnu ģenētisku transformāciju (pārveidi, modifikāciju). 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Tumorus inducējošais aģents ir Agrobacterium šūnās esoša plazmīda - Ti (tumorus inducējoša). Tā pielāgojusies daļu no savas DNS (T fragmentu) integrēt saimniek-auga genomiskajā DNS. Ti plazmīdas ir 200 kb lielas, cirkulāras dp DNS molekulas, kuras sastopamas un spēj autonomi replicēties Agrobacterium šūnās. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Ti plazmīdu T fragmentā atrodas vairāki gēni, kuri kodē netipisku aminoskābju (opīnu) sintēzei nepieciešamus enzīmus. Augu šūna opīnus nespēj izmantot. Baktēriju Ti plazmīda kodē opīnu konversijai nepieciešamos enzīmus, kas katalizē to pārveidi par parastām aminoskābēm. Tādejādi Ti plazmīda dod iespēju Agrobacterium šūnām opīnus izmantot. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Cita gēnu grupa T fragmentā nodrošina transformēto šūnu nekontrolētu augšanu. Šie gēni kodē enzīmus, kuri nepieciešami augu augšanas hormonu - auksīnu sintēzei. Šo fitohormonu iedarbībā tiek stimulēta transformēto un tām apkārtējo šūnu augšana un vairošanās. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Audzēju radīšanā iesaistītas 3 gēnu sistēmas: - T fragments, kurš kā mobilais insercijas elements spēj iekļauties auga genomā, - vir (virulences) gēni no Ti plazmīdas nodrošina T fragmenta pārnesi uz auga genomu, - vairāki Agrobacterium genoma gēni nepieciešami, lai baktērijas varētu saistīties ar auga audiem. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Ievainotas augu šūnas izdalītie hormoni aktivē vir klastera gēnu ekspresiju. T-DNS vir gēni 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Inducētie vir proteīni veic viena DNS pavediena šķēlumu abos T-DNS galos un nodrošina atdalītā DNS posma transportu uz auga šūnu. T-DNS vir gēni 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas T-DNS integrējas auga hromosomās, parasti vairāku kopiju veidā, un replikācijas sistēma atjauno Ti plazmīdas vienpavediena posmu. T-DNS vir gēni 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Tuvāk iepazīstot Ti plazmīdas, noskaidrojās, ka T-DNS posma integrācijai auga genomā būtiskas ir 25 bp sekvences abos T-DNS galos, bet fitohormonu sintēzes gēnus var aizstāt ar citiem gēniem: - marķiergēniem rekombinanto augu atlasei un - gēnu sveša proteīna vai RNS ekspresijai. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdu izmantošanai augu transformēšanas vajadzībām izstrādāts vairākas atšķirīgas stratēģijas. Piemēram, tas notiek ar dabīgās Ti plazmīdas līdzību. E. coli šūnās sagatavoto kointegrācijas konstrukciju ievada Agrobacterium šūnās, kurās atrodas dabīgā Ti plazmīda. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Tika pārveidotas un pielāgotas augu gēnu inženierijas vajadzībām, veidojot kointegrācijas vektorus. Kan (kanamicīna) rezistence T- DNS sekvence Agrobacterium marķieris pBR322, Ap (ampicilīna) rezistence 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Izmantojot T-DNS posmu homoloģiju, notiek homologā rekombinācija un abas plazmīdas apvienojas. Rekombinants kointegrācijas vektors Ti plazmīda Agrobacterium šūnā 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas Kointegrācijas vektors pats Agrobacterium nespēj autonomi replicēties, jo tam nav šīm baktērijām piemērotas ORI sekvences. Augu šūnas transformē ar modificēto Agrobacterium palīdzību. Transformētās augu šūnas atlasa pēc kan rezistences, kuras gēns nācis no kointegrācijas vektora. 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML Ti plazmīdas 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML ĢMO 27.04.2017. Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML