Symbiotic Nitrogen Fixation by Rhizobium as an Example of Mutualism

Slides:



Advertisements
Similar presentations
Microbiology.
Advertisements

1. Takrif Biofertilizers Preparations containing LIVE or LATENT CELLS of EFFICIENT strains of N2 N2 N2 N2 FIXING, PHOSPHATE SOLUBILIZING or CELLULOLITIC.
BIOFERTILIZERS NITROGEN-FIXERS.
Effects of Herbivore Damage and Nitrogen Fertilizers on the Selective Benefits of the (Medicago truncatula) legumes — (Sinorhizobium meliloti) Rhizobia.
Soil Biogeochemical Cycles Carbon, Nitrogen, Phosphorus.
Use the left mouse button to move forward through the show Use the right mouse button to view the slides in normal view, edit or print the slides The following.
Chapter 17 (Part 1) Amino Acid Metabolism: Nitrogen Assimilation and Amino Acid Biosynthesis.
Chapter 17 - Amino Acid Metabolism
Nitrogen Cycle The nitrogen cycle is the movement of nitrogen through different environmental segments.
Learning outcomes Describe the cycle of carbon through the ecosystem Describe how humans have affected the carbon cycle.
Lecture 9b Nitrogen Cycle- N2 gas into NO3- Nitrogen in Atmosphere = 79% Problem is getting N 2 into a form that plants can use. Most N in soil used for.
Nitrogen Cycle Global Nitrogen Budget Nitrogen Transformations Denitrifying Bacteria Nitrifying Bacteria Nitrogen Fixation Rhizobium-Legume Symbiosis.
Enzyme catalyzing Nitrogen Fixation in Bacteria Root nodules on legumes.
NITROGEN METABOLISM FIXATION Submited by- Anjali Rai MSc (P) Biotechnology MSc (P) Biotechnology.
Assimilation of mineral nutrients (Chapter 12) Incorporation of inorganic forms of essential elements into organic compounds necessary for growth and development.
What to Know (protease lecture) Know the general mechanism of serine proteases – what imparts specificity? – how is the substrate stabilized? – how is.
MCB 306 MICROBIAL ECOLOGY LECTURERS Dr. Akintokun, A.K Dr. Balogun,S.O.
Applications of Biotechnological Processes Enhancing Nitrogen Fixing.
Check In HW and Set Up 5 Yeast Dilutions. Sentinel Species?
37.3 Plants Nutrition Often Involves Other Relationship with Other Organisms Farrah Younes Period 7 and 8 AP Biology.
Chapter 36: Plant Nutrition CHAPTER 36 Plant Nutrition.
ASSIMILATION OF MINERAL NUTRIENTS NUTRIENT ASSIMILATION: THE INCORPORATION OF MINERAL NUTRIENTS INTO ORGANIC COMPOUNDS. ASSIMILATION OF SOME NUTRIENTS—PARTICULARLY.
Chapter 17 (Part 1) Amino Acid Metabolism: Nitrogen Assimilation and Amino Acid Biosynthesis.
Rhizobium isolation and Trifolium inoculation Presented by Julia Coffey.
Symbiosis.
The miracle of N 2 ase: How does it do it? N2 bond energy = 945 kJ/mol!!!! :NN: N2 + 8H+ + 8 e MgATP  2 NH3 + H MgADP + 16 Pi.
Symbiotic associations I. Symbiosis A. Definition B. Types of symbiosis 1. commensalism 2. mutualism 3. competition 4. predation and parasitism II. Mycorrhiza.
Active Lecture Questions for BIOLOGY, Eighth Edition Neil Campbell & Jane Reece Questions prepared by Ruth Buskirk, University of Texas at Austin Copyright.
Skotomorphogenesis Seed germination Genes and enzymes Embryo and Seed development Photomorphogenesis Photoreceptors Phytochrome Cells and cell growth Phytochrome:
Conversion of dinitrogen gas (N 2 ) to ammonia (NH 3 ) Availability of fixed N often factor most limiting to plant growth N-fixation ability limited to.
SEMESTER /13 BIOLOGY PRESENTATION BY: HUI SAAN LIM.
Plant-associated Proteobacteria (and a few outsiders):
Isolation and characterization of strain Production of certified organism Production of commercial innoculant Innoculation Single innoculation Combined.
QUANTIFICATION OF SOYBEAN-ASSOCIATED SOIL RHIZOBIA WITH QUANTITATIVE POLYMERASE CHAIN REACTION Branden Furseth, Shawn Conley, Jean-Michel Ané Dept. of.
Getting an N Fix Energetics N  N Haber-Bosch ( atm, °C, 8,000 kcal kg -1 N) Nitrogenase (4,000 kcal kg -1 N)
Chapter 37 Plant Nutrition.
Nitrogen Fixation by Cyanobacteria
Plant Nutrition. What happens to the nutrients taken in by the plant?  90% of water is lost in transpiration; functions as a solvent; keeps cells turgid;
What Are and what do they do??? Survive without food?
GES 175, Science of Soils Lecture 6, Soil Biology.
INTRODUCTION Rhizobium, a root nodule bacterium, has the ability to fix atmospheric nitrogen in symbiotic association with host legumes. It was estimated.
Nitrogen.
Bacterial Survey – Gram negatives 2) Aerobic bacilli and cocci Pseudomonas Legionella Neisseria Rhizobium Agrobacterium Methanobacterium.
Plant Nutrition. Nutritional needs  Autotrophic does not mean autonomous…  plants need…  sun as an energy source  inorganic compounds as raw materials:
Figure 4.4 The Nitrogen Cycle. While N 2 is the ultimate source and sink of biospheric nitrogen, several oxidized and reduced forms occur in the environment.
PLANT NUTRITION You Are What You Eat!.
INTRODUCTION Rhizobium, has the ability to fix atmospheric nitrogen in symbiotic association with host legumes. Rhizobia invade the roots of legume plants.
The MYSTERY of the altered GENE Professor
A2 Biology NITROGEN CYCLE Unit 4
Nutrient Cycles. Learning Objectives Understand the role of organic breakdown in nutrient cycles Be able to draw a diagram of the carbon cycle Understand.
Nitrogen cycle Chien-Ming Li MD, Ph.D.. Nitrogen cycle 1.Nitrogen fixation 2.Ammonification 3.Nitrification 4.Assimilation 5.denitrification.
Nitrogen Cycle Oxidation states Why so important? Next to C cycle..
Chapter 21 Lecture Outline Microbial Ecology. Microbiology: An Evolving Science © 2009 W. W. Norton & Company, Inc. 2 Microbes in Ecosystems Microbes.
M.Prasad Naidu MSc Medical Biochemistry, Ph.D.Research Scholar.
Nitrogen Acquisition and Amino Acid Metabolism
Microbial symbioses Root-nodule symbiosis.
Chapter 37 Plant Nutrition.
Nitrogen Fixation Our goal is to learn how N2 an inert gas, becomes part of the structure of organic molecules Secondly, to study the function of nitrogen.
Plant Nutrition- Ch. 37 Stephanie Ellis.
Increasing Nitrogen Fixation and Seed Development in Soybean Requires Complex Adjustments of Nodule Nitrogen Metabolism and Partitioning Processes  Amanda M.
Stryer Short Course, Chapter 31
BIOCHEMISTRY QUIZ -NITROGEN CYCLE-.
3.13 Catabolic Diversity Chemolithotrophy
Sem.IV, Paper VII Nitrogen metabolism
PLANT NUTRITION.
Increasing Nitrogen Fixation and Seed Development in Soybean Requires Complex Adjustments of Nodule Nitrogen Metabolism and Partitioning Processes  Amanda M.
Microbial symbioses Root-nodule symbiosis.
3.13 Catabolic Diversity Chemolithotrophy
The Metabolism of Nitrogen
February 12, 2002 Chapter 26 Nitrogen Acquisition
Presentation transcript:

Symbiotic Nitrogen Fixation by Rhizobium as an Example of Mutualism دراسة مثال على أحد علاقات التكافل بين الكائنات الدقيقة والنبات مثل التثبيت الحيوي للنيتروجين الجوي تكافلياً Symbiotic Nitrogen Fixation by Rhizobium as an Example of Mutualism بكتيريا العقد الجذرية Rhizobium

التثبيت الحيوي للنيتروجين تكافلياَ Symbiotic Nitrogen Fixation الطرق الحيوية لتثبيت النيتروجين تعتمد على الكائنات الدقيقة وخاصة البكتريا فتستطيع بعض أنواع البكتريا تثبيت النيتروجين بطريقة "التكافل" الذى يحدث بالفعل المشترك بين : بكتريا العقد الجذرية و النباتات البقولية

تمثل علاقة تبادل المنفعة بين بكتيريا Rhizobium و النباتات البقولية : (مثل البرسيم والبسلة والفاصوليا والفول وفول الصويا ) أحد اشهر الأمثلة للعلاقات البيئية بين الميكروبات و بين الكائنات الراقية ، و في هذه العلاقة نجد أن كلا الكائنين يستفيد من الاخر - حيث يقوم النبات بإمداد البكتيريا بالمصدر الكربوني (السكر) ومصادر الطاقة و الاحماض العضوية وغير العضوية – فيما تقوم البكتيريا بعملية تثبيت النيتروجين الجوى و تحويلة الى صورة يمكن للنبات العائل ان يستفيد منه - كتحويله الى احماض امينية مثل الجلوتاميك Glutamic acidو الاسبراجين Asparagin.

تتبع بكتريا العقد الجذرية جنس Rhizobium وهي سالبة الجرام. بكتريا صغيرة عصوية الشكل حجمها 1.2-3μm × 0.5-0.9 μm. غير متجرثمة وخلاياها متحركة بسوط قطبي وحيد أو عدة أسواط محيطية. هوائية إجبارياً strict aerobes. قد تعيش حرة في التربة . وتحتوي انزيم Nitrogenase وتحاط بكبسولة من exopolysaccharide لتحميها من الجفاف وكذلك مساعدتها في الالتصاق بالشعيرات الجذرية والالتصاق بها خلال عدة مراحل من دورة حياته.

قادرة على إصابة نباتات بقولية معينة محدثة العقد الجذرية ، فلكل نبات بقولي أو مجموعة من النباتات البقولية نوع أو سلاسلة معينة من جنس Rhizobium التي تستطيع أن تكون عليها العقد ، بينما لاتستطيع ذلك سلالة أخرى . العلاقة عالية التخصص. تظهر المستعمرات بيضاء اللون ،دائرية الشكل ومحدبة ، وشبه شفافه ومخاطية. تحتوي جين لتثبيت النيتروجين يسمى (nif genes) في البلازميد الكبير بها. التفاعل المتبادل عالي التخصص ؛ أي أن كل نوع من البكتيريا يتخصص في علاقة تكافلية مع نوع من النباتات البقولية دون غيره. تتطور هذه العلاقة من خلال عدة خطوات ويؤدي الى تكوين العقد الجذرية أخيراً.

1- تعيش بكتيريا Rhizobium بصورة حرة في التربة ، عادة قريباً من جذور النباتات البقولية ، تقوم النباتات بافراز مواد مختلفة مثل Flavonoids ، هذه المواد تقوم بحث خلايا البكتيريا للاقتراب أكثر من جذور النبات و محاولة اختراق الجذور .

2- عندما تتم عملية الاختراق يتكون خيط الإصابة Infection thread وهو المسار الذي تسلكه خلايا البكتيريا للوصول إلى داخل الخلايا الموجودة في الجذر .

3- عندما تدخل البكتيريا داخل الخلايا النباتية تحاط بغشاء و تتحول بعد ذلك الخلية البكتيرية إلى طور يسمى Bacteroid  تأخذ أشكال TYLXV ( الحروف الصينيه ) ،وهو الطور الذي تستطيع البكتيريا من خلاله تثبيت النيتروجين لاحتوائها على انزيم النيتروجينيز المثبت لنيتروجين الهواء الجوي .

عزل بكتيريا العقد الجذرية الأدوات: بيئة Rhizobium صلبة في أطباق. إبرة تلقيح أدوات التعقيم عينة عقد جذرية طازجه من بادرات الفول. طريقة العمل: 1- تحت ظروف التعقيم، يتم نقل العقد الجذرية إلى أنبوبة ماء مقطر معقم 10 مل ونحصل على التركيز الأول (تنقل العقد إلى طبق معقم يحتوي على كمية قليلة من الماء وتطحن بخفة ثم ينقل المعلق إلى أنبوبة الماء مقطر معقم). 2-يتم عمل تخفيفات متتاليةserial dilution حتى التركيز 10 -3 3- يتم نقل ملء عقدة من اللقاح إلى طبق بيئة الرايزوبيم ويلقح بالتخطيط 4- يتم التحضين عن 37˚م لمدة 3 أيام . 5- تسجل المشاهدة والاستنتاج.

يتم الكشف عنها تحت المجهر بواسطة صبغ جرام طريقة العمل : تؤخذ قطرة من معلق الرايزوبيوم على الشريحة ونثبت الغشاء بتمريره خلال اللهب تغمر الشريحة بصبغة الكريستال البنفسجي وتترك لمدة دقيقتين ثم تغسل الشريحة بالماء تغمر الشريحة باليود وتترك لمدة دقيقة واحدة ثم تغسل بالماء تغسل الشريحة بالكحول لمدة 5 – 10 ثواني تغمر الشريحة بصبغة الصفرانين لمدة دقيقتين ثم تغسل الشريحة بالماء تجفف الشريحة بورق الترشيح توضع قطرة من زيت السيدر على الشريحة ثم تفحص الشريحة عند قوة 100 و تسجل النتائج