strokovni obisk učnih laboratorijev v Veliki Britaniji Marko Dolinar, marec 2002 namen: spoznati potek vaj iz tehnologije rDNA videti opremljenost učnih laboratorijev ugotoviti tematski koncept vaj preveriti obseg pisnih gradiv za študente spoznati način ocenjevanja praktičnega pouka obiska: Univ. of Newcastle (R. Pain / R. Virden) Univ. of Manchester (K. Elliott) praktični vaji: Analiza izolatov HIV: ugotavljanje izvora infekcije (predmet Filogenija in evolucija) Izolacija ssDNA vektorja M13; analiza PCR (predmet Genetsko inženirstvo)

University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics študijske smeri: biokemija genetika molekularna biologija humana genetika biokemija z imunologijo biokemija z biotehnologijo vpisani študenti: biokemija ~50 v 3 letnikih genetika ~90 v 3 letnikih Molekularna biologija: 2. letnik, 30 kreditnih točk Genetsko inženirstvo: ni posebnega predmeta osnove predavajo pri predmetu Genetika v 1. letniku, več pa pri predmetu Molekularna biologija v 2. letniku (14 predavanj od 30)

University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics V začetku vsakega semestra študenti dobijo brošuro z opisi predavanj, vsemi navodili za vaje in splošnimi informacijami. Poglavja v brošuri: predmetnik cilji študija po letnikih navodila in pravila - roki za oddajo pisnih gradiv - naslovnice za pisna poročila in eseje - navodila za pripravo poročil z vaj - kriteriji za ocenjevanje esejev študijski koledar študijsko gradivo po predmetih Ob vpisu v prvi letnik dobijo še: Študijski priročnik (pravila in navodila za vsa 3 leta študija) priročnik Študijske veščine brošuro Informacije o laboratorijih in varnosti

University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics biokemija -1. letnik - 6 dvojnih modulov: biokemija delovanje celice biološke molekule in celična biologija genetika mikrobiologija fiziologija ali farmakologija biokemija -2. letnik: molekularna biologija (nukl. kisline, genetsko inženirstvo, zgradba proteinov, laboratorijska in računalniška orodja) celična organizacija (proteini in encimi, razmeščanje proteinov, biološke membrane) bioenergetika in fotosinteza kontrolni mehanizmi v celici (30 t.) osnove imunologije ali sinteza in popravljanje DNA vsi: + veščine (10 t. v 2 semestrih): 1. letnik: informacijske tehnologije (e-mail, Word, internet, knjižnice) 2. letnik: biokemijsko računstvo, tabele in statistika, ustno poročanje, delo v skupini

University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics biokemija -3. letnik: proteinsko inženirstvo (10 t.) združena biokemija (20 t.) raziskovalni projekt (30 t.) mehanizmi kataliznega delovanja encimov (10 t.) +5 izbirnih predmetov izmed: kontrolne poti v celici; (2002/3) biokemija bolezni interakcije med proteini in DNA molekularna biologija virusov imunsko prepoznavanje biotehnologija rak in genska terapija ‘raziskovalni projekt’ ~ diplomsko delo skupaj formalno obremenitev, ki ustreza 30 delovnim dnem; običajno 8 tednov v laboratoriju ali po zahtevnosti ustrezno teoretično raziskovalno delo opravljajo večinoma v raziskovalnih laboratorijih na oddelku v februarju in marcu, pišejo med velikonočnimi počitnicami in takoj oddajo

University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics Molekularna biologija (2. letnik): teoretični del: 30 predavanj (posamezni predavatelj 1-10) seminarji: 4 problemska naloga z ustno predstavitvijo (skupine po 4, predstavitve po 15 minut, 5% končne ocene) 2 testa za utrjevanje snovi (vsak 5% končne ocene) vaje (6 x 6 ur, poročila skupaj 15% ocene) Seminarji, praktično delo in testi skupaj prispevajo 30% končne ocene iz predmeta. Laboratorijske vaje: - ekstrakcija kromosomske DNA iz rastlin - analiza rekombinantnega plazmida - PCR - sekvenciranje DNA - transkripcijski faktorji in regulacija genov - bioinformatika Problemska naloga: Iskanje novega senzorja za kovine pri modri algi Synechocystis na osnovi določenega nukleotidnega zaporedja genoma Seminarji: - uvod v spletne vire za praktično delo - uvod v temo problemske naloge - diskusijski seminar v zvezi s problemsko nalogo - kloniranje

University of Manchester School of Biological Sciences študijske smeri (20): biokemija genetika molekularna biologija humana genetika biokemija z biotehnologijo, znanosti o življenju, medicinska biokemija, biomedicina anatomija, biologija, celična biologija, mikrobiologija, nevrologija, farmakologija, fiziologija, botanika, zoologija,... vpisani študenti: skupaj ~2000 v 3 letnikih Molekularna biologija: obvezni predmet 1. letnika za vse smeri (10 kred. točk) Genetsko inženirstvo: obvezni predmet v 2. letniku za 4 smeri, za biokemijo eden od izbirnih obveznih (10 kred. točk)

University of Manchester School of Biological Sciences Ob vpisu v vsak letnik študenti dobijo brošuro s splošnimi informacijami. Za vsak predmet dobijo še brošuro z opisom predmeta in brošuro z navodili za praktično delo, seminarje, ipd. Poglavja v vpisni brošuri: vpis šolska uprava cilji študija vodje študijev in mentorji (z zemljevidom stavbe) študentska pisarna komisije, odbori in ocenjevanje učiteljev pravila - prisotnost in delo - izpiti in ocenjevanje - postopki pri boleznih - varnost in zdravje - službe in nagrade - knjižnica - študentska združenja in pomoč študentom študijski koledar predmetnik po smereh pogoji za vpis predmetov višjih letnikov vsebina posameznih predmetov (po 1 stran)

University of Manchester School of Biological Sciences biokemija -1. letnik : molekularna biologija genetika anorganska in fizikalna kemija organska kemija biokemija celica praktična biomatematika fizikalna kemija + izbirni predmeti (skupaj 4 izmed 10) + mentorski seminar: osnove računalništva in informacijskih tehnologij; pisanje esejev, reševanje problemov, diskusijske skupine, ustno poročanje, skupinsko delo praviloma 1 predmet = 10 kreditnih točk (100 ur študija) 1 letnik = 120 kreditnih točk (ustreza 30 tednom s po 5x8 h dela) 1 predmet = 24 predavanj po 50 min. + 5 vaj po 3 h povprečna obremenitev s predavanji: 10 h/teden povprečna obremenitev z vajami: do 9 h/teden 1 semester = 12 tednov; vaj ni 1. in 12. teden izpitna obdobja: zimski semester 3. in 4. teden januarja poletni semester: zadnji 3 tedni v maju popravljalni termin: zadnji teden avgusta, 1. teden septembra

University of Manchester School of Biological Sciences biokemija - 2. letnik : biosinteza, pretvorbe in kontrola metabolizma biofizikalna karakterizacija makromolekul membrane, transport in bioenergetika 2 od naslednjih: ohranjanje in mobilnost genov izražanje genov genetsko inženirstvo + izbirni predmeti (skupaj 5 izmed 9 priporočenih) + mentorski seminar: pisanje esejev, reševanje problemov, diskusijske skupine, ustno poročanje, svetovanje o zaposlitvi, priprava življenjepisa biokemija - 3. letnik : 3 od naslednjih: zgradba in delovanje bioloških makromolekul znotrajcelično sortiranje proteinov in biogeneza organel celično signaliziranje bioinformatika in zgradba/delovanje proteinov glikobiologija molekularna biologija raka + izbirni predmeti (skupaj 3 izmed 17 priporočenih) + biokemijski praktikum (10 vaj) + dizertacija iz literature (3000-5000 besed; 10 kred. točk) + projektna naloga (30 dni; 7500 besed)

University of Manchester School of Biological Sciences Molekularna biologija (1. letnik): teoretični del: 24 predavanj (3 predavatelji) vaje (4 x 6 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene) - transformacija E. coli - fagna restrikcija pri E. coli - laktozni operon - restrikcijsko mapiranje plazmidov Izražanje genov (2. letnik): teoretični del: 24 predavanj (2 predavatelja) - laktozni operon - namestitev nukleosoma na evkariontski DNA - izolacija in analiza RNA (2 vaji) Ohranjanje in mobilnost genov (2. letnik): teoretični del: 24 predavanj (1 predavatelj) - določanje biosintezne poti Trp pri S. typhimurium z uporabo mutant - testi reverzne mutacije in delecijsko mapiranje mutant His- pri S. typhimurium - transformacija Streptococcus gordonii za uvedbo rezistence na antibiotik in določanje genske povezanosti - prenos konjugativnih plazmidov in mobilizacija nekonjugativnih plazmidov pri E. coli

University of Manchester School of Biological Sciences Genetsko inženirstvo (2. letnik): teoretični del: 24 predavanj (2 predavatelja): - klonirni vektorji in življenjski cikli - PCR - priprava in presejanje knjižnic - mutageneza in vitro - kloniranje v glivah in rastlinah - genomski projekti - multigenske okvare - elektroforeza v utripajočem polju - kloniranje preko lokusov in identifikacija genov - prenos genov pri živalih - gensko ciljanje pri živalih - genska terapija vaje: 4 x 5 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene - mestno-specifična mutageneza - PCR - življenjski cikel faga M13 - sekvenciranje DNA Vaje se delno prekrivajo po dnevih. 3. dan: izolacija ssDNA (M13) analiza PCR s prejšnje vaje (elektroforeza) teoretična naloga: načrtovanje začetnih oligonukleotidov za detekcijo genskih napak pred vajo: infekcija bakterij s fagom

Gradiva, ki sem jih prinesel: Newcastle: Informacije o laboratorijih in varnosti Brošura za 3. semester študija biokemije kopije prosojnic Genetsko inženirstvo (1. let., Genetika) navodila za vajo Newickova formula: distančne in diskretne metode (2. let., Filogenija in evolucija) Manchester: vpisne brošure za 1., 2. in 3. letnik skripta za predmet Ohranjanje in mobilnost genov skripta za vaje iz Ohranjanja in mobilnosti genov skripta za vaje iz Genetskega inženirstva skripta za vaje iz Molekularne biologije skripta za vaje iz Genskega izražanja

Opažanja in predlogi: Na voljo je samo po en izpitni rok pri vsakem predmetu z možnostjo popravljanja v jesenskem roku. Varnost je poudarjena v skriptah in v praksi, čeprav npr. zaščitna očala uporabljajo samo takrat, ko delajo z nevarnimi snovmi, ki lahko poškodujejo oči. Halje se zapenjajo s pritiskači in imajo elastično manšeto. V laboratorijih je ob umivalniku posoda z absorpcijskimi zrni za primer razlitja. Pipo odpiramo z nogo, ne z roko. Vsak laboratorij ima več izhodov. Vsa študijska gradiva so brezplačna. Intranet ima veliko podatkov, ki pomagajo k bolj učinkovitemu študiju. Računalniških delovnih mest za študente je proporcionalno mnogo več kot na FKKT. Vaje se ocenjujejo na osnovi poročil ALI kolokvija. Vsak predmet ima samo eno oceno (vaje + predavanja). Predmet je opravljen s 40% znanjem, za najvišjo oceno zadošča 70% znanje; kriteriji so vnaprej znani, med predmeti izenačeni in objavljeni. Čas med vajami, ko tečejo analize ali inkubacije, zapolnijo z reševanjem nalog; reagentov praviloma ne pripravljajo študenti. Pričakovana prisotnost študentov v predavalnici/vajalnici je 2 x 12 x 18 h = 430 h v enem letu (FKKT: do 750 h), študij je za 2 leti krajši. Vaje so manj obsežne in večinoma dobro delujejo kljub velikim skupinam študentov.