Ravivahetuse vajaduse prognoosimine klassifikatsioonipuu abil

Slides:



Advertisements
Similar presentations
Intensiivravi limiteerimine Mari-Liis Ilmoja SA Tallinna Lastehaigla Pärnu, 2007.
Advertisements

AB 11 22 33 44 55 66 77 88 99 10  20  19  18  17  16  15  14  13  12  11  21  22  23  24  25  26  27  28.
Enquiry of Employers Oct/Nov 2007 Jüri Kiho University of Tartu Institutue of Computer Science.
1 Käsmu 2006 Õhus on äikest ja elektrit ehk tuli meie lähitaevas
1 Sideseadmed (IRT0040) loeng 3/2010 Avo
Piima tootmise hügieeninõuded Kursus 2: Keskkonna ja loomade vastastikused mõjutused Teema 1: Kunstliku keskkonna mõju koduloomadele: lahendust vajavad.
BIOTEHNOLOOGIABIOTEHNOLOOGIA. Mis on biotehnoloogia? Biotehnoloogia on rakendusbioloogia haruteadus, mis kasutab organismide elutegevusel tuginevaid protsesse.
Mitmene testimine ülegenoomsetes uuringutes
Kiire automaatse nimetamise (KAN) oskus
Kodutöö esmaspäeva, 30. okt. hommikuks, Paberkujul.
Kirurgiakonverents 11. ja 12. novembril 2016
Pätris Halapuu Tartu Ülikool 2013
Supporting youth in Estonian Unemployment Insurance Fund
Söömishäired lastel ja noortel
Õpiobjekt: ÕPIME KELLA
Kombinatoorsete süsteemide disain
Veehaldjad eesti mütoloogias
Üsasisese infektsiooni diagnoosimine laboriarsti vaatenurgast.
Eesti Perinatoloogia Seltsi konverents detsember 2010, Tartu
Model View Controller disainimuster
Tehniline analüüs Veebruar 2012 Risto Sverdlik.
Katseandmete analüüs II
Üleeuroopaline töötervishoiu ja tööohutuse alane arvamusküsitlus
Case Study 3 Deregulation of the Intrastate Trucking Industry.
Süsteemprogrammeerimine keeles C ja C#
Sissejuhatus masinõppesse
Krooniline viirushepatiit. Probleemid sünnitusabis.
Katseandmete analüüs I osa
Keskkonnaministeeriumi Info- ja Tehnokeskus
Head tavad ja ühtsed kriteeriumid perinataalmeditsiinis
Immuniseerimiskava tulevikust
تحليل الحساسية Sensitive Analysis.
Sünnitusviisi valik alla 1500g lapsele
1. rühm (106): 2. rühm (134): E E (106) K K R R 14.15
Rahvusvahelised projektid perinataalmeditsiinis SA TÜK
PMen Import failidest.
TTÜ, ETA uurija-proffessor
Pandeemiline (H1N1) 2009 gripp
Praktiline Infotehnoloogia
Alumiste hammaste sensoorne innervatsioon Nervus mylohyoideus’ega
Meetodite erinevuse hindamised
Avo Ots telekommunikatsiooni õppetool,
Paketi sisu Avo Ots, Marika Kulmar.
Juhendajaga praktikumid 2015
Struktuurivõrrandite mudelid 8. loeng Rakendusnäiteid
Immuunsüsteemi seos reproduktsiooniga
Tehniline analüüs November 2012 Risto Sverdlik.
برنامج قواعد البيانات (مايكروسوفت أوفيس اكسس (Microsoft Office Access
Põhjuslikkus ja statistika
Alvar Soesoo TTÜ professor
Grupp B beetahemolüütiline streptokokk infektsioon vastsündinul
Helena Lemmats Stom II kursus, II rühm 2014
Vastsündinu hemolüütiline tõbi
Lapse psühhosotsiaalne areng
C keel AVR mikrokontrolleril
NSO8055 Okeanograafiline prognoos
Esmane analüüs Kordamine.
Andmeladu ja Mitmemõõtmeline vaade andmetele
Suuhügieeni teavitustöö lasteaedades
Katseandmete analüüs II
Rapid antibiotic-resistance predictions from genome sequence data for Staphylococcus aureus and Mycobacterium tuberculosis ehk Mykrobe predictor Phelim.
Width vs. Area for Sample Squares
Stressivaba elu – on see võimalik?
C keel AVR mikrokontrolleril
H2020 taotluste hindamise põhimõtted
Lineaarvõrrandite ja võrratuste ning lineaarsete võrrandisüsteemide lahendamise harjutamise programmide kasutajaliides Marina Issakova.
AATOM. AATOMI EHITUS. Õpik lk
Pole Position Student Points Time
A B C D.
Presentation transcript:

Ravivahetuse vajaduse prognoosimine klassifikatsioonipuu abil Tuuli Metsvaht, Heti Pisarev, Mari-Liis Ilmoja, Mirjam Merila, Irja Lutsar 14. aprill 2010

Tuuli Metsvaht TÜ Kliinikumi lasteintensiivravi osakond Heti Pisarev TÜ tervishoiu inistituut Mari-Liis Ilmoja Tallinna Lastehaigla lasteintensiivravi osakond Mirjam Merila TÜ Kliinikumi pediaatria osakond Irja Lutsar TÜ mikrobioloogia instituut

Taust ~4% vastsündinutest vajavad varase sepsise kahtluse korral antibakteriaalset ravi Tavapärane esmavaliku ravi: ampitsilliin+gentamütsiin või penitisilliin+gentamütsiin kombineeritud ravi 10-20% juhtudest on nakkuse tekitaja AMP/PEN ravile mittealluv ja ravi on vaja vahetada laiematoimelise AB vastu Nakkuse tekitaja määramine võtab aega 24-48h ja alati polegi määratav

Eesmärk leida algoritm primaarse ravi vahetuse prognoosimiseks kliiniliste ja sümptomaatiliste näitude põhjal.

Ristkatse PEN ja AMP võrdlemiseks Aug 2006 – nov 2007 Keskused SA Tartu Ülikooli Kliinikumi Anestesioloogia ja Intensiivravi Kliiniku lasteintensiivravi osakond SA Tallinna Lastehaigla intensiivravi osakond Uuringualused: intensiivravi osakonda sattunud antibakteriaalset ravi vajavad alla 72-tunni vanused vastsündinud välja jääjad: seisund vajas muud AB, osakonnast lahkumine 24h jooksul 2 võimalikku primaarset raviskeemi ampitsilliin + gentamütsiin penitsilliin + gentamütsiin

Ristkatse PEN ja AMP võrdlemiseks Ampitsilliin Penitsilliin 1. poolaasta 2. poolaasta Tallinn n=71 Tartu n=70

Ristkatse PEN ja AMP võrdlemiseks Jälgimisaeg: osakonda saabumine kuni ravi ebaõnnestumine (ka surm) või osakonnast lahkumine Kogutavad andmed: vereproovid põletikunäitajate määrmaiseks, ema tervisekäitumine, raseduse, sünnituse kulg jne Esmane väljundtulemus: hinnatakse primaarse ravi vahetust vajanute hulka Järeldus: AMP ja PEN ravi pole erinevad

Logistiline regressioon Primaarse ravi vahetusega (168h jooksul) statistiliselt olulises seoses olevad tunnused (p<0.1) esimene rasedus/sünnitus, lootekestade põletik, suitsetamine raseduse ajal, positiivne bakterikülv sünnitusteedest, platsentast või uriinist; 1-minuti apgar, sünnikaal, gestatsiooniaeg, IRO-sse jõudmise vanus, vasoaktiivsete ravimite arv, suukaudne toitmine, veresuhkur, c-reaktiivne valk, hemoglobiin, leukotsüüdid, albumiin, uurea, bilirubiin …

Mitmesed logistilised mudelid

Klassifikatsiooni- ja regressioonipuu ehk otsusepuu meetod Otsusepuu meetodit kasutatakse prognoosimiseks. Klassifitseerimisülesanded (kategooriline sõltuv tunnus) Binaarne (nt on/ei ole dgn) Järjestatav (nt dgn raskusaste) Mittejärjestav (nt dgn1 vs dgn2 vs dgn3) Regressioonülesanded (pidev sõltuv tunnus) Tulemuste interpretatsioon on lihtne ja selge Mudeli parameetrite asemel antakse täpsed otsustuste reeglid

24-tunni mudel

72-tunni mudel

Logistilise mudeli ja otsusepuu võrdlus Mitmene log. regression Otsusepuu 24 h model 72 h model Sensitivity (%) 61 80 75 81 Specificity (%) 90 78 89 88* Positive predictive value (%) 48 33 46 Negative predictive value (%) 94 97

Tulemuste kitsendused Kuna andmestik oli väike (n=283), siis mudeli lõplikuks valideerimiseks tuleb veel andmeid koguda.