Biostatistika: uvodna razmatranja listopad, 2004. Biostatistika: uvodna razmatranja poslijediplomski studij “Medicinska biokemija” Farmaceutsko-biokemijski fakultet u Zagrebu Prof. dr. sc. Mladen Petrovečki Katedra za informatiku Medicinski fakultet, Rijeka Zavod za laboratorijsku dijagnostiku KB Dubrava, Zagreb

Ovo predavanje... MS PowerPoint 500 KB listopad 2004. – pps na adresi: mi.medri.hr (E-prilozi  predavanja)

Program MedCalc computer program for statistic in biomedicine Copyright, 1993-1996 Medcalc Software Mariakerke, Belgija

Program – postavljanje: otvoriti mapu “C:\MCWin” preslikavanje svih podataka sa diskete u zadanu mapu otvoriti mapu pokrenuti program “Install” po završetku pokrenuti program “MedCalc”

Program www.medcalc.be

Nastava dan datum vrijeme šk. sati ponedjeljak 25.10. 1500 – 1715 h 3 P – utorak 26.10. 1500 – 1830 h 4 P 30 četvrtak 28.10. 1500 – 1830 h 4 P 30 petak 29.10. 1300 – 1630 h 4 P 30 ukupno 15

Raspored Dan Tema 1. dan uvod, znanstveno istraživanje, MedCalc, unos podataka 2. dan prikaz podataka, odnos dvaju obilježja 3. dan usporedbe prosjeka 4. dan ROC, multivarijatni postupci

Literatura B. Petz. Osnovne statističke metode za nematematičare. III. dopunjeno izd. Naklada Slap, Jastrebarsko, 1997. (novo izd.) B. Dawson-Saunders, R. G. Trapp. Basic & Clinical Biostatistics. Prentice-Hall Int. Inc., London, 2000. A. Petrie, C. Sabin. Medical statistics at a glance. Blackwell Science, Oxford, 2000. D. Ivanković i sur. Osnovne statističke analize za medicinare. Udžbenici i priručnici Medicinskog fakulteta u Sveučilišta u Zagrebu, 1988. M. Marušić i sur. Uvod u znanstveni rad u medicini. III. obnov. izd. Medicinska naklada, 2004.

Literatura

Ispit kritička raščlamba statističkih postupaka objavljenog znanstvenog rada pismeno poslati 10 dana prije usmene obrane časopis – citiran u Current Contents rad: cjelokupno istraživanje (ne osvrt na drugi objavljeni rad!) najmanje dva priloga (tablica, slika) jasan opis statističkih postupaka

Nastavak...

? nesreća… sreća… svaki puta… desetak puta… nemoguće… nevjerojatno…

Pregled metodologija znanstvenog istraživanja postupci istraživanja neznanstveni i znanstveni postupci

Metodologija znanstvenog istraživanja znanost kao način razmišljanja znanstveno djelovanje privremeno tumačenje hipoteza zaključak provjerljivost postavke ® činjenice ® znanje TVRDNJA OBRAZLOŽENJE PROVJERA

Neznanstveni postupci istraživanja ustrajnost (navika, stav, vjerovanje, inercija) autoritet intuicija (očiglednost)

Pokus pokus – istraživanje / dio istraživanja planiranje pokusa maskiranje randomizacija

Randomizacija RND (MedCalc) funkcija slučajnog broja (uniformna raspodjela) “RND(x) returns a computer-generated random number: when x <= 1 then the result is a number between 0 and 1, or when x > 1 then the result is a number between 1 and x.” (usp. funkcija RNDNORM)

Randomizacija datoteka “FBF kardio” otvoriti pokazatelj “slucajan” definirati tri skupine ispitanika po slučajnosti

Istraživačka logika deterministički model sustava probabilistički model sustava vjerojatnost događaja – p(D) 0  p(D)  1

Uzorak i populacija populacija mjereno obilježje SPOZNAJA O POPULACIJI populacija mjereno obilježje uzorak statistička obrada podataka UZORKOVANJE PROCJENA SPOZNAJA O UZORKU

Mjerno obilježje Mjerne ljestvice NOMINALNA ORDINALNA INTERVALNA OMJERNA

Jednostavni i složeni podaci visina bolesnika 175 cm pH krvi 7,42 sistolički tlak 85 mmHg razina glukoze u krvi 5,14 mmol/L brojnost CFU-GM u koštanoj srži 65 kolonija/105 stanica s jezgrom količina citostatika 250 mg/m2 površine tijela

Uzorak reprezentativan mjerljiv ostvariv PROBABILISTIČKI SLUČAJAN SUSTAVAN STRATIFICIRAN

Uzorak – zavisnost ZAVISNI NEZAVISNI

Hipoteza znanstvena hipoteza statistička hipoteza

Statistička hipoteza elementarna tvrdnja točna (istinita) ili netočna (neistinita) provjera hipoteze = traženje istine istina – stvarno, objektivno stanje probabilistički sustav: istina  vjerojatnost značajno – ono što se ostvaruje na svaki drugi način osim slučajno iskaz vjerojatnosti  razina značajnosti

Dokazivanje statističke hipteze CD Kontrolna Ispitanici s Statistika skupina PTSD H p CD3 39,0 (15,1 – 61,1) 44 (32,3 – 57,7) 0,59 0,442 CD4 3,5 (2,1 – 5,8) 10,3 (6,5 – 17,4) 15,9 0,018 Razlikuje li se razina CD4 u ispitanika u istraživanju? Škarpa I et al. Croat Med J 2001;42:551-5.

1. postavljanje hipoteze nulta – H0-hipoteza: razlike nema! “Nema razlike u razinama CD4.” suprotna – H1-hipoteza: razlike ima! “Razine CD se razlikuju.” samo jedna može biti istinita samo jedna može biti prihvaćena, dok će ona druga biti odbačena

2. Odabir testa testovi dokazivanja statističkih hipoteza ovisnost osobine obilježja - mjerne ljestvice osobine uzoraka veličina povezanost osobine raspodjele parametrijski neparametrijski broj obilježja - uni/bi/multivarijatni testovi

(nastavak) Ljestvica Jedan uzorak Dva uzorka Tri i više uzoraka Ovisni Neovisni Ovisni Neovisni Nominalna binomni test McNemara Cohran hi-kvadrat Fisher hi-kvad hi-kvadrat/ Ordinalna Kol/Smir. Wilcoxon Friedman homologni MW p/medijan Moses KW Intervalna Omjerna . . .

3. Određivanje razine značajnosti p a ako se p određuje prije izračunavanja a – vjerojatnost odbacivanja H0 kad je ona stvarno točna i istinita tzv. a-pogrješka (pogrješka I. vrste) što manja! uobičajene vrijednosti, npr. p<0,05

(nastavak) zašto upravo to: p<0,05? POKUS bacanje novčića: pismo/glava 2x isto uzastopce = 0,5 3x = 0,25 4x = 0,125 5x = 0,0625 ... zašto upravo to: p<0,05?

4. Izračunavanje matematički račun primjer: razlikuje li se dob ispitanika između skupina po vrsti operacije (normotermija i hipotermija) MedCalc, “FBF Kardio.mc1”

5. Zaključivanje mala vrijednost “p” = mala vjerojatnost da ne prihvaćama ono što je istinito zaključivanje: p < a vjerojatnost istinitosti H0 je mala odbacujemo (ne prihvaćamo) nultu hipotezu prihvaćamo alternativnu, H1 potvrdimo je, iskažemo, uz p=...

(nastavak – zaključak) CD Kontrolna Ispitanici s Statistika skupina PTSD H p CD3 39,0 (15,1 – 61,1) 44 (32,3 – 57,7) 0,59 0,442 CD4 3,5 (2,1 – 5,8) 10,3 (6,5 – 17,4) 15,9 0,018 Razlikuje li se razina CD4 u ispitanika u istraživanju? Škarpa I et al. Croat Med J 2001;42:551-5.

Pogrješke testiranja hipoteze PRAVO STANJE ZAKLJUČENO RAZLIKA RAZLIKA POSTOJI (H1) NE POSTOJI (H0) ISPRAVAN a pogrješka RAZLIKA ZAKLJUČAK (I. vrste) POSTOJI (H0 odbac.) b pogrješka ISPRAVAN RAZLIKE (II. vrste) ZAKLJUČAK NEMA (H0 prihvat.)

Uzorak (nastavak) – veličina uzorkovanje - MedCalc (engl. sampling) primjer: sampling simple mean ...

Priopćavanje E-pošta: mp@kbd.hr Klinička bolnica Dubrava Zavod za laboratorijsku dijagnostiku Avenija G. Šuška 6, 10000 Zagreb (01 290 3379) Katedra za informatiku Medicinski fakultet Sveučilišta u Rijeci Ulica braće Branchetta 20, 51000 Rijeka (051 651 255)