Molecular Typing of Salmonella enterica Serovars using Two PFGE Systems Geraldine Doran Martin Cormican Interim Salmonella Reference Laboratory Ireland
Serovars S. Kedougou S. Bredeney Systems Pharmacia Gene Navigator Bio-Rad CHEF Mapper (PulseNet) Molecular Typing of S.enterica Serovars using two PFGE Systems
Pharmacia: 4 Subtypes CHEF Mapper:7 Subtypes S. Kedougou Results
Molecular Typing of S.enterica Serovars using two PFGE Systems Comparison of 2 Systems TimePharmacia6 Days CHEF Mapper4 Days (3) ReproducibilityBoth reproducible Result QualityCHEF MapperEasier to intrepret Standardised
PFGE of S. Kedougou using Pharmacia λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ ? A4 A4 A1 λ kb
PFGE of S. Kedougou using CHEF Mapper λ A1 A6 A2 λ A3 A3 A5 A4 λ A5 A5 A7 A1 λ kb
PFGE of S. Kedougou CHEF MapperPharmacia kb Λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ A4 A4 A4 A1 λ λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ A4 A4 A4 A1 λ
S Kedougou Pharmacia Reproducibility λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ ? A4 A4 A1 λ λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ A4 A4 A4 A1 λ Run 1Run kb
PFGE of S. Bredeney kb λ A A2 A3 λ B C D E λ F G λ A A2 A3 B C D E F G λ CHEF MapperPharmacia
Dendogram of S. Kedougou using Bionumerics Software
CHEF MapperQuicker Easier to Intrepret More Reproducible Standardised (PulseNet) Conclusions