על איזה חלבון גלובולרי נלמד ? הוא חשוב הוא מוכר הוא מורכב הוא מוכשר.

Slides:

Advertisements

Similar presentations

Proteins: Structure reflects function….. Fig. 5-UN1 Amino group Carboxyl group carbon.

Advertisements

Supplementary Figure 1A

Completeness and Expressiveness. תזכורת למערכת ההוכחה של לוגיקה מסדר ראשון : אקסיומות 1. ) ) (( 2. )) ) (( )) ( ) ((( 3. ))) F( F( ( 4. ) v) ( ) v ((

1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #4 Refinement in Z: data refinement; operations refinement; their combinations.

חיפוש בינה מלאכותית אבי רוזנפלד. סוגי חיפוש כלליים UNINFORMED SEARCH -- חיפושים לא מיודעים במרחי מצבים – BFS – DFS INFORMED SEARCH – חיפושים מיודעים –

Adjectives - Comparisons

(Paradigm=Example) Artist unknown A group of scientists placed 5 monkeys in a cage and in the middle, a ladder with bananas on the top. קבוצת מדענים.

מטרות בבניית התנורמטרות בבניית התנור שהתנור יהיה כמה שיותר קרוב לעיגול, אך שיהיה נוח לבנות אותו. לא נאבד את החום בפינות התנור לא לאבד חום בדפנות התנור.

מצגת מיקמק מבית nolamik הפקות.

Presentation by Dudu Yanay and Elior Malul 1.  מה משותף לכל אלגוריתם המשתמש ב -Bucket Elimination: ◦ נתון מודל הסתברותי ורשת ביסיאנית מתאימה. ◦ נתונה.

תמחיר תהליך. מערכת תמחיר תהליך מערכת זו נועדה לספק מידע, כמו מערכת תמחיר הזמנה, על עלות המוצרים שיוצרו בתקופה ועל עלות המוצרים שבתהליך הייצור בסוף התקופה.

אביב תשס " ה JCT תיכון תוכנה ד " ר ר ' גלנט / י ' לויאןכל הזכויות שמורות 1 פרק 10 Packages.

Na+ P-. הפוטנציאל האלקטרוכימי אנרגיה חופשית ל - 1 mole חומר. מרכיב חשמלי מרכיב כימי מרכיבי הפוטנציאל האלקטרוכימי של חומר X: המרכיב הכימי : RTlnC x R –

מה החומר למבחן ? כל החומר שנלמד בהרצאות ובתרגולים. לגבי backtracking: לא תידרשו לממש אלגוריתם, אך כן להבין או להשלים מימוש נתון. אחת משאלות המבחן מבוססת.

RasMol workshop Protein Structure and Function A.

הכנת המצגת: מוטי בן ארי ומיכל סמואל המחלקה להוראת המדעים, מכון ויצמן למדע ©

מבנה כללי של דוח הסיור. רקע כללי והצגת מטרות העבודה ושאלת המחקר.

1 Data Structures, CS, TAU, Splay Tree Splay Tree  מימוש של עץ חיפוש בינארי  מטרה לדאוג ל- Amortized Time  פעולה בודדת יכולה לקחת O(N)  אבל כל רצף.

1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #5 Refinement in Z: data refinement; operations refinement; their combinations.

שאילת שאלות שאלת חקר המפתח למנעול 1. שאילת שאלות – שאלת חקר מה ניתן לשנות ? :  בתנאים : טמפ ' או לחץ או הכלים, או הציוד  בחומרים : איכות או כמות או.

משטר סטטי שערים לוגיים Wired Drives – © Dima Elenbogen 2009, Moshe Malka :29.

Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #6 appendix Statecharts vs. Raphsody 7 (theory vs. practice)

תכנות תרגול 6 שבוע : תרגיל שורש של מספר מחושב לפי הסדרה הבאה : root 0 = 1 root n = root n-1 + a / root n-1 2 כאשר האיבר ה n של הסדרה הוא קירוב.

ידידה גוטליב ביה"ס בליך רמת גן מדריכת כימיה מחוז תל אביב

Questions are the Answer Penick&all H ISTORY R ELATIOINSHIPS A PPLICATION S PECULATION E XPLANATION.

תחשיב הפסוקים חלק ג'. צורות נורמליות א. DF – Disjunctive Form – סכום של מכפלות. דוגמא: (P  ~Q  R)  (R  P)  (R  ~Q  ~P) הגדרה: נוסחה השקולה לנוסחה.

The Inferior Olive נוירוביולוגיה ומדעי המוח 2009.

תרגיל מס' 1: חומצות אמיניות וחלבונים

כוחות משיכה בין מולקולריים כוחות חלשים כוחות וון דר וולס (Van der Vaals) בנוסף לכוחות החזקים שקיימים בקשרים הכימיים המחזיקים אטומים ביחד קיימים גם כוחות.

תרמודינמיקה השפעת טמפרטורה על GG בקרה קינטית ובקרה תרמודינמית רים נאוה ארנה.

Golan H Neural Development. Golan H Neural Development 1.General trends in Neurogenesis: Example from the development of the cerebral cortex:

טיב פני שטח (טפ"ש) טיב פני שטח- רמת החלקות של המשטח.

רגרסיה קו רגרסיה הוא קו תיאורטי המאפשר לנו לבחון את השפעתו של משתנה מנבא אחד (או יותר) על המשתנה התלוי: במילים אחרות, מודל רגרסיה עוזר לנו לנבא על פי משתנה.

עקרון ההכלה וההדחה.

by Sagiv Frankel & Ayana Wiener, Advised by Dr. Chen Keasar Advised by Dr. Chen Keasar & Mr. Ran Yahalom & Mr. Ran Yahalom.

מבוא למדעי המחשב, סמסטר א ', תשע " א תרגול מס ' 1 נושאים  הכרת הקורס  פסאודו - קוד / אלגוריתם 1.

Data Structures, CS, TAU, RB-Tree 1 עץ אדום-שחור - עץ חיפוש בינארי - בכל צומת ביט אינפורמציה נוסף - צבע « עץ “ כמעט מאוזן ” « (O(log n במקרה גרוע ביותר.

תעלות, נשאים ואינטגרציה ביניהם

A. Frank File Organization Hardware Size Parameters.

ניתוח בחינת הבגרות במכניקה ומעבר..... מכניקה – שאלה 3.

Safari On-line books. מה זה ספארי ספארי זו ספריה וירטואלית בנושא מחשבים היא כוללת יותר מ כותרים כל הספרים הם בטקסט מלא ניתן לחפש ספר בנושא מסוים.

The relative orientation observed for  helices packed on ß sheets.

מעגלים אלקטרוניים לינאריים סמסטר אביב תשס"ב

תכונותיהן של החומצות האמיניות חומצות אמיניות הידרופוביות A, Ala, alanine Alanine Valine Phenylalanine Proline Methionine Leucine Isoleucine אלנין ואלין.

Learning Targets “I Can...” -State how many nucleotides make up a codon. -Use a codon chart to find the corresponding amino acid.

פיתוח מערכות מידע Class diagrams Aggregation, Composition and Generalization.

1. Association Association JM Last: A dictionary of epidemiology 2 Statistical dependence between 2 or more events, characteristics, or other variables.

המחסום הברירני מבחין בין מעבר של חומרים שונים מולקולות הידרופוביות מגיעות מהר מאוד לשיווי משקל. מולקולות הידרופוביות מגיעות מהר מאוד לשיווי משקל. מולקולות.

Costs and Filters Dr. Avi Rosenfeld Department of Industrial Engineering Jerusalem College of Technology

Population genetics גנים באוכלוסיות a population is a localized group of individuals belonging to the same species.

הממברנה הציטופלסמטית הקדמה מפרידה בין התא החי לבין סביבתו. מפרידה בין התא החי לבין סביבתו. 8 nm עובי. מבקרת את התנועה לתוך ומחוץ לתא. 8 nm עובי. מבקרת.

Chapter 17 How to read a table of codons. These are two forms in which you might see a table of codons.

1 מערכת הנשימה מבנה ותפקוד מבנה מנגנון הנשימה חילופי הגזים הובלת הגזים בדם The respiratory system is the system of the body that deals with breathing.

1 ניתוח שונות: Post-hoc analysis ניתוח שונות חד-כיווני עם אפקטים קבועים: Post-hoc analysis ד"ר מרינה בוגומולוב מבוסס חלקית על ההרצאות של פרופ' יואב בנימיני.

קשר לוגי : סיבה ותוצאה. במשפט – דוגמות קלות בגלל הגשם החלטנו לא לנסוע לטיול לחיפה. הרצון שלי להצליח הניע אותי להשקיע בלימודים. ציפורים נודדות בין יבשות.

פס על כל העיר נורית זרחי.

או: למה ואיך לשווק ולמתג את הקורס שלכם

מספרים אקראיים ניתן לייצר מספרים אקראיים ע"י הפונקציה int rand(void);

Sparse RNA Folding: Time and Space Efficient algorithms

מחומצות גרעין לחלבונים:

תרגום מחומצות גרעין לחלבונים מצגת זו היא תוצר העבודה שלי אבל גם תוצר של הערות בונות של המורים. אשמח לקבל הערות ותיקונים כדי להמשיך ולשפר אותה. תודה !

SQL בסיסי – הגדרה אינדוקטיבית

ריאקצית קונדנסציה (דחיסה)

פרוקטוז, C6H12O6 , חד-סוכר מיוחד

קשרים בין מולקולריים והשפעתם על מסיסות החומר בממסים שונים

המוגלובין – מבנה וגורמים אלוסטריים

הנעה חשמלית.

בחירת חומר גלם כתב: עמרי שרון.

שמנים ושומנים מה במצגת? במצגת יש קישורים

How to Test an Assertion

Presentation transcript:

על איזה חלבון גלובולרי נלמד ? הוא חשוב הוא מוכר הוא מורכב הוא מוכשר

6. מולקולה מוכרת ואחראית לצבע האדום בדם 7. מולקולה שמאפשרת ליצור " עץ אבולוציוני " 8. ניסיון נוסף להראות שעישון מזיק למה המוגלובין ? 1. הבנת הקשר בין מבנה ותפקוד ברמה המולקולרית 1962 Perutz & Kendrew 2. חלבון ראשון שגובש חלבון ראשון שהוגדר מבחינת התפקוד הפיזיולוגי לראשונה הוצג " פסל מולקולרי " של חלבון גלובולרי על סמך מחקר בקרני X ע " י Kendrew הכרת המודל האלוסטרי " הסוד השני של החיים “ 1965 Monod

תפקיד ההמוגלובין להגדיל את מסיסות החמצן מסיסות החמצן במים = 3.5 x10 -5 M מסיסות החמצן בדם = 7-9 x10 -3 M( פי 100 גדולה יותר ) 0.2 מול 25 ליטר = 8 x10 -3 M כמו ריכוז החמצן באוויר !! לקשור הרבה חמצן בתנאים בהם ריכוזו גדול ולספק חמצן בתנאים בהם ריכוז החמצן נמוך לקשור פחות חזק את החמצן מאשר מיוגלובין (K) לשחרר יותר חמצן בשריר פעיל מאשר בשריר במנוחה להוביל חלק מה - CO 2 מהגוף לריאות להיות מוכן לספק חמצן בתנאים קיצוניים של חוסר חמצן שמירה על pH קבוע בכדורית הדם

איך הוא עושה את כל זה ? ואו !!

מבנה המיוגלובין מבנה ראשוני - שרשרת הבנויה מ חומצות אמיניות מבנה שניוני - מ - 8 סלילי אלפא (A,B,C,D,E,F,G) המיוצב ע " י קשרי מימן בתוך שלד השרשרת מבנה שלישוני – גלובולרי המעוצב ע " י ההצמדה ההידרופובית. מיוצב ע " י קשרי מימן, קשרים יוניים וקשרי ודומבנה זה יוצר " כיס הידרופובית " לקבוצת ההם קבוצה בה נקשרת מולקולת חמצן ליון 2+ Fe מבנה ההמוגלובין 4 יחידות דומות מאוד למיוגלובין עם קבוצת ההם כ " א 2 שרשראות אלפא 141 חומצות אמיניות כ " א 2 שרשראות בתא 146 חומצות אמיניות כ " א מסה מולרית גרם \ מול

Arg His Ala Val Leu Ile Phe

Asp COO - 22 + HN 11 COO - His Asp Lys 22 NH 3 + COO - Cl - Arg COO - NH 2 + NH 3 + H-OSer Lys 11 11 11 " צעד קטן לקבוצת ההם – צעד גדול להמוגלובין " DPG מצב T

מצב T מיוצב כאשר : ריכוז החמצן נמוך ( עשון, גובה, פעילות ) ה - pH נמוך ( ריכוז גבוה של חומצה לקטית ) ריכוז גבוה של CO 2

Asp COO - 22 + HN 11 COO - His Asp Lys 22 NH 3 + COO - Cl - Arg COO - NH 2 + NH 3 + H-OSer Lys 11 11 11 אילו קבוצות " רגישות " בתחום ה pH- הפיזיולוגי ? DPG מצב T

Asp COO - 22 + HN 11 His NH 3 + H-OSer 11 11 מצב R מצב T HbH + + O 2 +H 2 O Hb O 2 + H 3 O + HN N 11 His H3O+H3O+ Cl - NH 2 H-OSer 11 11 H3O+H3O+

Cl - NHCOO - NH 2 + Arg 11 11 מצב R Hb-NHCOO - + H 3 O + Hb -NH 2 + CO 2 +H 2 O NH 2 H-OSer 11 11 Cl - מצב T

ייצוב מצב R ריכוז חמצן נמוך ריכוז H 3 O + גבוה ריכוז CO 2 גבוה ריכוז DPG גבוה ייצוב מצב T ככל שיש יותר מולקולות חמצן קשורות ל - Hb נדרשת פחות אנרגיה לניתוק הקשרים המייצבים את מצב T K 1 =2.7x10 -3 K 2 =4.9x10 -3 K 3 =2.4x10 -2 K 4 =2.18 K 1 =365 K 2 =202 K 3 =40.9 K 4 =0.458

הכל בגלל חמצן קטן !! שמשך את יון הברזל שמשך את ההסטידין ששינה את הקונפורמציה של שרשרת אלפא 1 ששינה את הקונפורמציה של שרשרת אלפא 2 ששינה את הקונפורמציה של שרשרת בתא 1 ששינה את הקונפורמציה של שרשרת בתא 2 ששבר את הקשרים היוניים עם ה DNP שמקל על קשירת מולקולת חמצן נוספת …X 4 וכל זה קורה באלפי תאים, הרבה מאוד פעמים בשניה במשך כל רגע בחיינו !!