מיפוי המגוון הביולוגי באמצעות משתני סביבה לירון סטולר-כוורי ויוחאי כרמל היחידה להנדסת סביבה מים וחקלאות, הטכניון.

Slides:



Advertisements
Similar presentations
ממיבחניםC שאלות ++.
Advertisements

1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #4 Refinement in Z: data refinement; operations refinement; their combinations.
האוניברסיטה העברית בירושלים
©Silberschatz, Korth and Sudarshan4.1Database System Concepts סכימה לדוגמא.
לומדה לשימוש ב Google Scholar en&tab=ws.
הר הכרמל נמצא בחיפה וגובהו כ מטרים. הר הכרמל היא שלוחה צפונית מערבית של השומרון המשתרעת עד מפרץ חיפה. האקלים ברכס הכרמל הוא ים תיכוני ומועשר במשקעים.
Presentation by Dudu Yanay and Elior Malul 1.  מה משותף לכל אלגוריתם המשתמש ב -Bucket Elimination: ◦ נתון מודל הסתברותי ורשת ביסיאנית מתאימה. ◦ נתונה.
מתמטיקה בדידה תרגול 3.
תמחיר תהליך. מערכת תמחיר תהליך מערכת זו נועדה לספק מידע, כמו מערכת תמחיר הזמנה, על עלות המוצרים שיוצרו בתקופה ועל עלות המוצרים שבתהליך הייצור בסוף התקופה.
דוד שוורץ, עידן זק, נטע צור וחיה כהן. הפונקציונאליות : המשתמש יבחר קובץ שעליו הוא רוצה לבצע את האנליזה, וילחץ עליו עם כפתור ימני בעכבר. יפתח תפריט ובו.
אביב תשס " ה JCT תיכון תוכנה ד " ר ר ' גלנט / י ' לויאןכל הזכויות שמורות 1 פרק 10 Packages.
מסדי נתונים תשס " ג 1 תכנון סכמות (Design Theory) מסדי נתונים.
A. Frank File Organization קובץ ישיר מתקדם Advanced Direct File.
חורף - תשס " ג DBMS, Design1 שימור תלויות אינטואיציה : כל תלות פונקציונלית שהתקיימה בסכמה המקורית מתקיימת גם בסכמה המפורקת. מטרה : כאשר מעדכנים.
מריוס הרשקוביץ. תוכן רקע רקע שיטות ואלגוריתמים שיטות ואלגוריתמים תוצאות תוצאות.
Na+ P-. הפוטנציאל האלקטרוכימי אנרגיה חופשית ל - 1 mole חומר. מרכיב חשמלי מרכיב כימי מרכיבי הפוטנציאל האלקטרוכימי של חומר X: המרכיב הכימי : RTlnC x R –
שיטות מחקר בתקשורת שיעור מס' 3- מדידה. מדידה -הגדרה מדידה - מתן ערך של משתנה לכל תצפית. מדידה - מתן ערך של משתנה לכל תצפית. דוגמא: מספר עיתונים שקורא.
שאלות חזרה לבחינה. שאלה דיסקים אופטיים מסוג WORM (write-once-read-many) משמשים חברות לצורך איחסון כמויות גדולות של מידע באופן קבוע ומבלי שניתן לשנותו.
By Irina Polansky Deriving Mechanism Singularity Positions through the Graph Theory Duality Principle The Iby and Aladar Fleischman Faculty of Engineering.
RasMol workshop Protein Structure and Function A.
חורף - תשס " ג DBMS, צורות נורמליות 1 צורה נורמלית שלישית - 3NF הגדרה : תהי R סכמה רלציונית ותהי F קבוצת תלויות פונקציונליות מעל R. R היא ב -3NF.
1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #5 Refinement in Z: data refinement; operations refinement; their combinations.
אשכול - clustering Clustering הוא תחום הקשור לבינה מלאכותית, ותת תחום של למידה לא מבוקרת.
מדידת תנועת קרום כדור הארץ בשיטות שונות טקטוניקה - תרגול 6.
תרגול חזרה. מבנה האובייקט תאר את מבנה האובייקט כולל מבנה טבלאות הפונקציות הוירטואליות עבור התכנית הבאה struct A { int x; virtual void a() {}; }; struct.
Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #6 appendix Statecharts vs. Raphsody 7 (theory vs. practice)
דוד שוורץ, עידן זק, נטע צור וחיה כהן. הפונקציונאליות:  המשתמש בוחר קובץ שעליו הוא רוצה לבצע את האנליזה, ולוחץ עליו עם כפתור ימני בעכבר.  נפתח תפריט.
מטרה : ניבוי תחום התפוצה של מינים באמצעות מידע על הנישה האקולוגית שלהם מודלים מבוססי נישה כאמצעי לניבוי דגמי תפוצה הבעיה – מעבר ממידע נקודתי למפות תפוצה.
Questions are the Answer Penick&all H ISTORY R ELATIOINSHIPS A PPLICATION S PECULATION E XPLANATION.
Avinoam Danin © צורות-חיים של צמחים כדרך התאמה לאזור הגידול ( על פי ראונקייה ) כמפיטים – בני-שיח.
Motion planning via potential fields תומר באום Based on ch. 4 in “Principles of robot motion” By Choset et al. ב"הב"ה.
מבחן t למדגמים בלתי תלויים
כוחות משיכה בין מולקולריים כוחות חלשים כוחות וון דר וולס (Van der Vaals) בנוסף לכוחות החזקים שקיימים בקשרים הכימיים המחזיקים אטומים ביחד קיימים גם כוחות.
הקיבול איננו תלוי במטען ובפוטנציאל
1 Bond Price Volatility נובמבר שאלות 2 ו 4 נתונות שתי איגרות החוב הבאות :
הקדמה. תנועת גל בחומר. קריסת הגל. משוואת ברגר (Burgers’ equation) ופתרונה. גלי הלם. סיכום.
GAP analysis for Israel using vertebrate distributions Amit Dolev 1, Ayelet Sapir 1, Yohay Carmel 2 1 Society for protection of Nature in Iserael 2 The.
1 חקירת טרנזיסטור קוונטי הנשלט על ידי שינויי תדר Frequency Controlled Quantum Transistor מבצע : חן טרדונסקי מנחה : ד " ר אראל גרנות.
עקרון ההכלה וההדחה.
יחס סדר חלקי.
תכנות מונחה עצמים Object Oriented Programming (OOP) אתגר מחזור ב' Templates תבניות.
מדדי פיזור פיזור מצביע על מידת ההטרוגניות או ההומוגניות של ההתפלגות. פיזור הוא מדד יחסי, כיוון שאפשר לומר אם הפיזור בהתפלגות רחב או צר, רק ביחס לפיזור.
Markov Decision Processes (MDP) תומר באום Based on ch. 14 in “Probabilistic Robotics” By Thrun et al. ב"הב"ה.
עצים בינאריים - תזכורת דרגת צומת שורש עלה צומת פנימי מרחק בין 2 צמתים
Safari On-line books. מה זה ספארי ספארי זו ספריה וירטואלית בנושא מחשבים היא כוללת יותר מ כותרים כל הספרים הם בטקסט מלא ניתן לחפש ספר בנושא מסוים.
Points on a perimeter (Convex Hull) קורס – מבוא לעבוד מקבילי מבצעים – אריאל פנדלר יאיר ברעם.
11 Introduction to Programming in C - Fall 2010 – Erez Sharvit, Amir Menczel 1 Introduction to Programming in C תרגול
WEB OF SCIENCE. WEB OF SCIENCE  Science Citation Index ExpandedTM  Social Sciences Citation Index®  Art & Humanities Citation Index®
הפקולטה להנדסה אזרחית וסביבתית טכניון
פיתוח מערכות מידע Class diagrams Aggregation, Composition and Generalization.
Sense (Gene) Anti-sense Anti- sense.
מבוא למדעי המחשב לתעשייה וניהול הרצאה 7. סברוטינות subroutines.
Population genetics גנים באוכלוסיות a population is a localized group of individuals belonging to the same species.
1 ניתוח שונות: Post-hoc analysis ניתוח שונות חד-כיווני עם אפקטים קבועים: Post-hoc analysis ד"ר מרינה בוגומולוב מבוסס חלקית על ההרצאות של פרופ' יואב בנימיני.
קצת היסטוריה 1981דיווח ראשון על תסמונת כשל חיסוני נרכש בקרב מספר הומוסקסואלים. 1981דיווח על ביטויים שונים של איידס בקרב מזריקי סמים, חולי המופיליה, מקבלי.
מצגת סוף סמסטר מנחה: ד"ר גבי נקבלי מגיש: ויקטור מרגוליס
Human Wayfinding in Information Networks
SQL בסיסי – הגדרה אינדוקטיבית
שימוש בשיטה א-פרמטרית להשוואת תוחלות של שתי אוכלוסיות.
עבודה עם נתונים באמצעות ADO.NET
השוואת נתונים למודל הסתברותי - כללית
פרוקטוז, C6H12O6 , חד-סוכר מיוחד
מה קורה כאן?
מבחן t למדגמים בלתי תלויים
השפעת ויסות עצמי על למידת טקסטים המוצגים על מסך המחשב
השערות מחקר והשערות המבחן הסטטיסטי
זה המקום להגדיר את המונח מגוון ביולוגי זה המקום להגדיר את המונח מגוון ביולוגי. באופן פשטני, המגוון הביולוגי הוא השונות שבין כל היצורים החיים על פני.
מבחן t למדגם יחיד.
ניתוח מודלים היררכיים hlmעל ידי
מבוא לתכנות מונחה עצמים Object Oriented Programming
Presentation transcript:

מיפוי המגוון הביולוגי באמצעות משתני סביבה לירון סטולר-כוורי ויוחאי כרמל היחידה להנדסת סביבה מים וחקלאות, הטכניון

היעד הכולל: נוכח הקצב המואץ של היעלמות השטחים הפתוחים, ההגנה על מגוון החי דורשת תכנון אופטימלי של יתרת השטחים הפתוחים. תנאי מקדים לכך הוא מיפוי מלא של מגוון החי. הבעייה: הגישות המקובלות למיפוי המגוון הביולוגי לוקות בהטיה (bias), ויישומן איטי ויקר האתגר: פיתוח גישה בלתי מוטה למיפוי המגוון הביולוגי במרחב, שתהא כוללנית, מהירה, זולה, אמינה – ותשמש בסיס לתכנון.

Indicator group הגישות המקובלות למיפוי המגוון הביולוגי Indicator species

גישה זו מתבססת על תיאורית הנישה: תפוצתו של כל מין תלויה בסט של משתני הסביבה במרחב (קרקע, מיסלע, מיקרו-אקלים, טופוגרפיה). לסט נתון של משתני סביבה קיים הרכב מינים ייחודי שצפוי להופיע בו. לכל טיפוס-סביבה צפוי הרכב מינים ייחודי. על מנת לשמור על המגוון הביולוגי (הקשה למיפוי) – אפשר לשמור על מגוון טיפוסי-סביבה (נחשב קל יותר למיפוי). גישה חדשה (יחסית): ED/BD Environmental diversity for biodiversity מגוון סביבתי כמדד מקורב למגוון ביולוגי

Environmental diversity for biodiversity מגוון סביבתי כמדד מקורב למגוון ביולוגי Wessels et al 1999; Lenton et al 2000; Fairbanks 2000; Araujo et al 2001; Amarnath et al 2003 Belbin 1993; Faith and Walker 1996 יתרונות:  כלי תכנוני המציע הגנה על כלל המגוון במרחב, ולא רק על 'איזורים חמים'  שימוש במידע זמין  מיידיות  כלליות  ייצוגיות ?

מיפוי טיפוסי סביבה השיטה המקובלת: ידע מומחים /סיווג ידני (expert knowledge, manual classification מפת יחידות צומח (חווה להב, 1983 עבור רשה"ט) מפת יחידות נוף (מוטי קפלן, 1996, עבור המשרד לאיכה"ס)

ליצירת מפה של טיפוסי סביבה (land classes) ייחודיים סיווג ממוחשב של משתני הסביבה השיטה המוצעת כאן למיפוי טיפוסי סביבה:

Topographic data Soil data Veg. data Classification מפת טיפוסי הסביבה סכימת הייצור

מטרות המחקר: פיתוח שיטה למיפוי מהיר של מגוון טיפוסי הסביבה, כמדד עקיף למגוון החי. יישום השיטה לאזור הר הכרמל. בדיקת מהימנות השיטה מול מיפוי שדה של אלמנטים של מגוון החי

אקלים (טמפרטורות ממוצעות בינואר, באוגוסט, משקעים) שיקולים בבחירת גורמי הסביבה הרלונטים למגוון המינים בסקאלה מקומית: גורמי הסביבה המשפיעים על צומח ים תיכוני גורמי סביבה שמופו ברזולוציה גבוהה בישראל גורמי הסביבה שנבחרו במחקר זה: טופוגרפיה (גובה, מפנה, מדרון) קרקע (טרה רוסה, רנדזינה) צומח (כיסוי צומח מעוצה / עשבוני) אקלים (טמפרטורות ממוצעות בינואר, באוגוסט, משקעים)

צומח (מעוצה / עשבוני) קרקעות

מדרון גובה טופוגרפי

K-means Classification Environmental variable A Environmental variable B Environmental variable A Minimum distance decision rule

Environmental variable A Environmental variable B Environmental variable A K-means Classification

כל צבע במפה מייצג צירוף ייחודי של משתני סביבה דוגמא: הצבע הכתום מייצג שטחים במפנה צפון-מערבי על מדרון מתון, קרקע טרה-רוסה וכיסוי צומח נמוך עד בינוני. שלש קבוצות של טיפוסי סביבה: איזור הכרמל הגבוה (כתום, חום, כחול) איזור הכרמל הנמוך (אדום, ורוד, תכלת, ירוק) והמישורים. מפת טיפוסי-סביבה בכרמל: סיווג ממוחשב ל-11 טיפוסים

מפות טיפוסי-סביבה בכרמל: 20 טיפוסים 12 טיפוסים

המבחן האמיתי לטיב השיטה: השוואה למיפוי שדה של מגוון המינים 110 תחנות דיגום נבחרו באקראי על פני מרחב הכרמל. בכל תחנה שלש יחידות דיגום, במרחקים של 20 מ' נבדק מגוון המינים (presence/absence data) של שלש קבוצות ביולוגיות: חלזונות יבשה גיאופיטים (צמחי בצל ופקעת) צומח מעוצה ריבוע 1X1 מ' עיגול ברדיוס 5 מ'יחידת הדיגום סה"כ מינים בדיגום כרמל 4 ± ± ±5.9 ממוצע מינים ליחידת דיגום

המבחן הסטטיסטי להלימה בין הנתונים הביולוגיים לבין סיווג טיפוסי הסביבה מהשערת המחקר נובע: הדימיון הסביבתי בין אתרים – גם מרוחקים גיאוגרפית – ישקף דימיון ביולוגי ביניהם. ניתן לבחון את נכונות ההשערה בשיטה הבאה: זוג אתרים המשתייכים לאותו טיפוס סביבה יהיו דומים זה לזה יותר מאשר זוג אתרים מטיפוסים סביבתיים שונים

המבחן הסטטיסטי להלימה בין הנתונים הביולוגיים לבין סיווג טיפוסי הסביבה א' – חישוב מדדי דימיון : דימיון סביבתי: זוג אתרים המצויים באותו 'טיפוס-סביבה' קיבל את הערך 1, זוג אתרים המצויים בטיפוסי סביבה שונים קיבל את הערך 0. דמיון ביולוגי: השתמשנו במדד JACKARD ב. מבחן MANTEL להבדל בין מידת הדימיון של זוגות אתרים בתוך טיפוסי סביבה למידת הדימיון בין טיפוסי-סביבה שונים

הדימיון הביולוגי בין זוגות אתרים – מיני צומח מעוצה

חלזונות יבשה גיאופיטיםצמחים מעוצים NS 0.09*יחידות גיאוגרפיות NS0.074***0.226***יחידות צומח (חוה להב) 0.034***0.059***0.103****סיווג ממוחשב מידת המובהקות של מבחן MANTEL להשוואה בין הדימיון הביולוגי בין אתרים מאותו טיפוס סביבה לעומת הדימיון הביולוגי בין אתרים מטיפוסי סביבה שונים * p<0.05 ** p< 0.01 *** p< NS – not significant

חלזונות יבשה גיאופיטיםצמחים מעוצים NS ***0.28צמחים מעוצים NS גיאופיטים מבחן MANTEL לקורלציה בין הדימיון הביולוגי בין כל שתי קבוצות סיסטמטיות * p<0.05 ** p< 0.01 *** p< NS – not significant

צמחים מעוציםגיאופיטים חלזונות יבשה 0.103****0.041** 0.034*** טופוגרפיה, כיסוי צומח, קרקע 0.079****0.032*0.045** טופוגרפיה, כיסוי צומח, אקלים 0.079****0.04**NS טופוגרפיה, קרקע, אקלים 0.127**0.044**0.032* כיסוי צומח, קרקע, אקלים 0.079****0.045*0.049* כיסוי צומח, קרקע, אקלים, טופוגרפיה

ערכי קורלציה נמוכים, אך מובהקים, מדוע ?  אומדן חסר של מינים מייצגים לטיפוס סביבה.  הפער בין הנישה היסודית לנישה הריאלית של כל מין.  השייכות של שני פוליגונים לאותו טיפוס סביבתי אין משמעה זהות מוחלטת ביניהם.

תוצאות: הטיפוסים הסביבתיים, כפי שמופו במחקר זה בעזרת סיווג ממוחשב של נתוני סביבה זמינים, משקפים צירופי מינים ביולוגיים יחודיים. שיטת הסיווג K-means סיפקה תוצאות מובהקות גם כשבחרנו מספרים שונים של קטגוריות (טיפוסי סביבה) לסיווג, בין 8 ל-25. תופעה זו מובהקת בכל שלש הקבוצות הביולוגיות שנבדקו: צמחים מעוצים, גיאופיטים, וחלזונות יבשה.

תוצאות: מפת יחידות הנוף הראתה זיקה מסוימת למגוון המינים, פחותה מזו של מפת הסיווג הממוחשב ומפת יחידות הצומח (על סף המובהקות הסטטיסטית). מפת יחידות הצומח הראתה זיקה גבוהה ומובהקת למגוון מיני הגיאופיטים והצומח המעוצה. לא נמצאה זיקה מובהקת למיני החלזונות.

סיכום: לגישת המגוון הסביבתי ( EDBD ) יש פוטנציאל ממשי למיפוי מהיר וזול של שטחים בעלי הרכב ביולוגי ייחודי, ולשימוש ככלי לתכנון וממשק שטחים פתוחים.