Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот.. Ревертаза. РНК-зависимая ДНК- полимераза (ревертаза) способна катализировать синтез ДНК-копии (кДНК) на РНК-матрице.

Slides:

Advertisements

Similar presentations

TAG- QUESTIONS. What are their types? What are differences between them?

Advertisements

Филогенетические деревья Что это такое Общий план действий Программы, которые строят деревья The time will come, I believe, though I shall not live to.

Биоинформатика Исследование информационных процессов в биологических системах (клетках, органах, организме, популяции). Изучение и внедрение в компьютерную.

Деревья (trees) «…великое Дерево Жизни заполняет земную кору своими мертвыми и сломанными ветвями и покрывает поверхность вечно ветвящимися и прекрасными.

Российская Гильдия риэлтеров По теме «Контрактная природа фирмы»

Поиск функциональных различий геномов человека и шимпанзе, связанных с инсерционным мутагенезом мобильных элементов Группа геномного анализа сигнальных.

Вычисления с использованием ДНК Ростислав Чутков, гр. 244 Александр Петров, гр. 244.

IV семестр «Функция и эволюция» БЛОК 1 «Эволюция» – 4 занятия Молекулярная филогенетика. Задачи и подходы. Лекция- семинар, (АБР) Реконструкция.

Глава 1 Принципы экономики 4. Кривая производственных возможностей.

Системы отбора. Условные обозначения (1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) Математическое моделирование процессов отбора2.

Генная инженерия.

Веремьёва Е. И.. Радиобиология — это самостоятельная комплексная, фундаментальная наука, состоящая из многих научных направлений, изучающая действие ионизирующих.

R1R2R3R4R5R6R7R1R2R3R4R5R6R7. Аксиома R 1. В пространстве существуют плоскости. В каждой плоскости пространства выполняются все аксиомы планиметрии.

Астащенко Александр, 445 группа Научный руководитель: В.Г.Шистеров.

Рекламные технологии будущего уже здесь Как доказать соответствие Dentsu Way российскому рынку. Dentsu Group Russia Москва, Декабрь

Стресс и здоровье Презентация Нефёдовой Евгении Николаевны, классного руководителя 9 «Б» класса МОУ СОШ № 30 города Энгельса Саратовской области 2010 год.

Блоги библиотек и библиотекарей Дискуссионная группа на Международной конференции «КРЫМ-2011»

Александр Тышковский, факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ, 2011.

Геном человека. ПРОГРАММА «ГЕНОМ ЧЕЛОВЕКА» Начата в 1998 году К 2000 году геном человека был прочтен с точностью в 10 раз ниже необходимой ( не более.

Функции II. Классификация. Зачем? А.Б.Рахманинова (6 марта 2006 г.)

Обзор последних достижений биометрических методов аутентификации РусКрипто 2005.

Генетическая инженерия и современные стратегии создания антибиотиков

Анализ аминокислотной последовательности: паттерны, домены, семейства … или что, где и как искать?

To the Solution of a Bilinear Optimal Control Problem with State Constrains by the Doubled-Variations Method E.A. Rovenskaya Lomonosov Moscow State University,

Решение задач на движение

Номинация «Лучшее предложение по развитию массового спорта» «Строительство Роллердрома в городе Челябинск» Предложение подготовлено: Бобковой Екатериной.

BLAST Что такое выравнивание Выравнивание 2х последовательностей

Разработка методики анализа репертуара B – клеточных рецепторов методом массированного секвенирования при рассеянном склерозе Ученица 11 класса «Б» В.И.

Введение в параллельные вычисления. Технология программирования MPI (день третий) Антонов Александр Сергеевич, к.ф.-м.н., н.с. лаборатории Параллельных.

Структура белка Как предсказать вторичную структуру белка? Как найти и анализировать пространственную структуру, если она известна? Что можно делать, если.

"The European Molecular Biology Open Software Suite"

Что можно делать с одиночной последовательностью ДНК? Как исключить векторные фланки? Рестрикционная карта Вашей последовательности Дизайн праймеров Анализ.

Учебная презентация. Список упражнений Перед вами небольшой список упражнений по Microsoft Power Point: Для начала потренируйтесь создавать новые слайды,

Деревья и их представление в STL Презентацию подготовила Чиркова Ольга, 2 подгруппа, группа 271ПИ.

3. Сравнение пространственных структур белков. Выравнивание последовательностей гомеодоменов Пример 1: гомеодомены.

Gtcactaaatactttaaccaatataggcatagcgcacagacagataaaaattacagagtacacaacatccatgaaacgcattagcaccaccattaccaccaccatcaccattacca gcttttcattctgactgcaacgggcaatatgtctctgtgtggattaaaaaaagagtgtctgatagcagcttctgaactggttacctgccgtgagtaaattaaaattttattgactta.

Нахождение ориджинов в последовательности нуклеотидов Выполнил: Ромашкин Амир, 445 гр. Руководитель: Профессор АФТУ, Порозов Юрий.

День Святого Валентина в США

Реализация наследственной информации (транскрипция и трансляция).

Swiss-Prot – одна из первых баз данных белковых последовательностей, “gold standard” белковой аннотации. Аннотация выполнена вручную группой профессиональных.

Gtcactaaatactttaaccaatataggcatagcgcacagacagataaaaattacagagtacacaacatccatgaaacgcattagcaccaccattaccaccaccatcaccattacca gcttttcattctgactgcaacgggcaatatgtctctgtgtggattaaaaaaagagtgtctgatagcagcttctgaactggttacctgccgtgagtaaattaaaattttattgactta.

Методы анализа данных. Статистическая проверка гипотез.

Деревья (trees) «…великое Дерево Жизни заполняет земную кору своими мертвыми и сломанными ветвями и покрывает поверхность вечно ветвящимися и прекрасными.

Учитель биологии ГОУ ЦО №1470 Селезнёва И.Г.. « Рост, размножение, подвижность, возбудимость, способность реагировать на изменения внешней среды – все.

Как найти последовательность, кодирующую Ваш белок? Как найти последовательность ДНК, кодирующую Ваш белок: – Ссылки из белковых баз данных – Прямой поиск.

Cравнение биологических последовательностей А.Б.Рахманинова, 2008.

Молекулярная биология Транскрипция

Сохранение и модификация ДНК:

Анализ аминокислотной последовательности: паттерны, домены, семейства … или что, где и как искать?

Классификация, кластеризация и поиск изображений на основе низкоуровневых характеристик Наталья Васильева Руководитель: Новиков Б. А.

Instability: Mutation and DNA repair Mutations DNA repair.

Тема: Молекулярные основы наследственности

Alu Polymorphysims as Identity Markers Using PCR and Gel Electrophoresis.

Молекулярная биология Репликация ДНК

Мобильные элементы и эволюция генома М.Б. Евгеньев, Е.С. Зеленцова, Н.Г. Шостак, Е.Н. Мяснянкина, О.Г. Зацепина, Д.Г. Гарбуз, Шилова В. Ю. и М.И. Соколова.

АННА ФРЕЙД ( ). Анна Фрейд Анна Фрейд — британский психолог и психоаналитик австрийского происхождения, младшая дочь основателя психоанализа Зигмунда.

Gtcactaaatactttaaccaatataggcatagcgcacagacagataaaaattacagagtacacaacatccatgaaacgcattagcaccaccattaccaccaccatcaccattacca gcttttcattctgactgcaacgggcaatatgtctctgtgtggattaaaaaaagagtgtctgatagcagcttctgaactggttacctgccgtgagtaaattaaaattttattgactta.

ТЕНДЕНЦИИ КАТЕГОРИИ «СНЕКИ» Товарная категория «снеки» для нашей страны довольно новое явление, особенно по сравнению с западными странами. Тем не менее,

‘For and Against’ Essays Useful tips. Plan Introduction - Paragraph 1 (state topic – summary of the topic without giving your opinion) Main Body – Paragraph.

Опыт Технопарка БНТУ по разработке проектной заявки Что скрывает CBHE? Томашевич Наталия Юрьевна Руководитель Центра МНТС Научно-технологический парк БНТУ.

Биомасса микробов составляет составляет 90% всей биомассы Земли – бактерии на суше и в почвах, планктон и бактерии океана, симбиотические.

Mechanical Properties of DNA Local Structure: Ultrasound Studies Dmitry Yu. Nechipurenko, Mikhail V. Golovkin, Sergej L. Grokhovsky, Irina А. Il'icheva,

: 1.C- парадокс 2.Эгоистичные гены и эгоистичная ДНК 3.Транспазоны в геноме человека 4.Функция мусорной ДНК.

Дробление. Дробление – ряд быстрых митотических делений зиготы Основной механизм – деление клеток Клетки не растут, в митотическом цикле периоды G1 и.

Gtcactaaatactttaaccaatataggcatagcgcacagacagataaaaattacagagtacacaacatccatgaaacgcattagcaccaccattaccaccaccatcaccattacca gcttttcattctgactgcaacgggcaatatgtctctgtgtggattaaaaaaagagtgtctgatagcagcttctgaactggttacctgccgtgagtaaattaaaattttattgactta.

Общая характеристика семейства Семейство Крестоцветные включает около 4 тысяч видов. По-другому семейство Крестоцветные называют семейством Капустные.

Instability: Mutation and DNA repair

November CTP Андрей Коршиков MCP-клуб, Краснодар Декабрь 2009.

Решение типовых расчетных задач по формулам. Определение массовой доли элементов Массовая доля элемента ω(Э) % - это отношение массы данного элемента.

Presentation transcript:

Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот.

Ревертаза. РНК-зависимая ДНК- полимераза (ревертаза) способна катализировать синтез ДНК-копии (кДНК) на РНК-матрице.

Мобильные Ретроэлементы эукариот LTR-содержащие Ретротранспозоны Ретровирусы экзогенные эндогенные не LTR-содержащие LINE ( long interspersed elements) SINE ( short interspersed elements)

Не LTR-содержащие

LINE (long interspersed elements) Структура мРНК  кодирующие  характерна усечённость копий с 5’-конца  нумерация нуклеотидов в последовательности LINE принято вести с 3’-конца и выражать в отрицательных числах

Схема жизненного цикла L1.

TPRT – реакция. (target-primed reverse transcription)  в ДНК-мишень вносится одноцепочечный разрыв  3’-конец одной из цепей используется в качестве затравки для синтеза кДНК  разрезание второй цепи ДНК-мишени [там же]  далее in vivo происходит: лигирование цепей ДНК разрушение РНК в составе гетеродуплекса репаративный синтез второй цепи ДНК

SINE (short interspersed elements)  не содержат кодирующих последовательностей  при транспозициях используют обратную транскриптазу из других источников  в качестве таких «доноров» выступают LINE  заканчивается олиго(А)-трактом  гомогенны по длине внутри одного семейства  не содержат 5’-концевых делеций  нумерацию нуклеотидов ведут с 5’-конца

Происхождение.  Из 7SL РНК с внутренней делецией - B1 грызунов, Alu приматов.  “tRNA-derived SINE” - в 5’-части есть высокая гомология с последовательностями определённых тРНК - В2 грызунов, TS табака, MIR всех млекопитающих. В то же время их 3’-концевой домен является АТ-богатым и происходит, по-видимому, из 3’-конца LINE-элементов.  Известны случаи происхождения SINE из генов малых ядерных РНК - Bm1 B. mori – из U1.  SINE-R из генома человека обязан своим происхождением длинному концевому повтору эндогенного ретровируса семейства HERV-K

LTR-содержащие

Структура LTR-содержащих элементов на примере ретровирусов.

Механизм обратной транскрипции.

Возможная эволюция LTR-ретротранспозоны Ретровирусы Эндогенные ретровирусы