Д.А. Равчеев (14 апреля 2009 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Трансмембранные белки

АТФ-синтетаза Ацетилхолиновый рецептор

Объекты

 -баррель  -спирали

V.W.X.Y.Z

В чем проблема? От 15% до 30% от общего числа белков — белки с хотя бы одной трансмембранной спиралью Всего  белковых структур. Мембранных — 191 (0.6% )

В чем проблема?

von Heijne “the positive-inside rule”

К ак оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?

Ошибки…… Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она потверждается. Ошибки второго рода (FN): принимается нулевая гипотеза, а она не потверждается. Ошибки третьего рода: справедливо отвергнута нулевая гипотеза на основе неверных соображений.