נסיונות הדחה לאפיון קישור של אגוניסטים ואנטגוניסטים לרצפטור 2 α אדרנרגי צורת עקומת ההדחה 50% IC 50 % קישור הרדיוליגנד [I] ריכוז מדיח 50% % קישור הרדיוליגנד.

Slides:



Advertisements
Similar presentations
Completeness and Expressiveness. תזכורת למערכת ההוכחה של לוגיקה מסדר ראשון : אקסיומות 1. ) ) (( 2. )) ) (( )) ( ) ((( 3. ))) F( F( ( 4. ) v) ( ) v ((
Advertisements

©Silberschatz, Korth and Sudarshan4.1Database System Concepts סכימה לדוגמא.
מה קורה בתא הפוסט - סינפטי עקב הפעלת סינפסה כימית ?
פונקציונל פונקציה מספר פונקציונל דוגמאות לא פונקציונל פונקציונל.
לומדה לשימוש ב Google Scholar en&tab=ws.
חורף - תשס " ג DBMS, Design1 שימור תלויות אינטואיציה : כל תלות פונקציונלית שהתקיימה בסכמה המקורית מתקיימת גם בסכמה המפורקת. מטרה : כאשר מעדכנים.
Na+ P-. הפוטנציאל האלקטרוכימי אנרגיה חופשית ל - 1 mole חומר. מרכיב חשמלי מרכיב כימי מרכיבי הפוטנציאל האלקטרוכימי של חומר X: המרכיב הכימי : RTlnC x R –
שאלות חזרה לבחינה. שאלה דיסקים אופטיים מסוג WORM (write-once-read-many) משמשים חברות לצורך איחסון כמויות גדולות של מידע באופן קבוע ומבלי שניתן לשנותו.
מה החומר למבחן ? כל החומר שנלמד בהרצאות ובתרגולים. לגבי backtracking: לא תידרשו לממש אלגוריתם, אך כן להבין או להשלים מימוש נתון. אחת משאלות המבחן מבוססת.
1 שיפור עקיבה אחר מטרה בשיטת קורלציה ומרכז כובד בשילוב אלגוריתם IMM מגיש: שישלניקוב דניס מנחה: דר' גבי דוידוב הטכניון - מכון טכנולוגי לישראל TECHNION -
The Solar Wind And its consequences. dx dA משוואות בסיסיות בהידרו דינמיקה הכח הפועל כתוצאה מגרדיאנט בלחץ על אלמנט מסה - dm.
מבוא להנדסת חשמל מעגל מסדר שני.
Map-Reduce Input: a collection of scientific articles on different topics, each marked with a field of science –Mathematics, Computer Science, Biology,
A. Frank File Organization Indexed-Sequential File Introduction Thanks to Tamar Barnes.
לכל אחת מארבעת המעבדות יש להביא: 1)חלוק. 2)טושים לא מחיקים (פנטלים). 3)טבלאות עבודה, גרפים וכו' – ע''פ הנדרש יש להגיע מוכנים לבוחן קצר שיערך לפני תחילת.
מסדי נתונים תשס " ג 1 תכנון סכמות – אלגוריתם פירוק לתבניות בצורת BCNF מסדי נתונים.
שאילת שאלות שאלת חקר המפתח למנעול 1. שאילת שאלות – שאלת חקר מה ניתן לשנות ? :  בתנאים : טמפ ' או לחץ או הכלים, או הציוד  בחומרים : איכות או כמות או.
א " ב, מילים, ושפות הפקולטה למדעי המחשב אוטומטים ושפות פורמליות ( ) תרגיל מספר 1.
א " ב, מילים, ושפות הפקולטה למדעי המחשב אוטומטים ושפות פורמליות ( ) תרגיל מספר 1.
קינטיקה כימית ישנן תגובות שמתרחשות תוך שניות, בעוד שאחרות יכולות לארוך שעות, ימים ואף חודשים. גם כאשר תגובה היא ספונטאנית, לא תמיד היא מתרחשת מעצמה – קצב.
משטר סטטי שערים לוגיים Wired Drives – © Dima Elenbogen 2009, Moshe Malka :29.
Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #6 appendix Statecharts vs. Raphsody 7 (theory vs. practice)
Questions are the Answer Penick&all H ISTORY R ELATIOINSHIPS A PPLICATION S PECULATION E XPLANATION.
א " ב, מילים, ושפות הפקולטה למדעי המחשב אוטומטים ושפות פורמליות ( ) תרגיל מספר 1.
IN מעגל חשמלי אנלוגי לדנדריט הפוסט-סינפטי: מה קורה בתא הפוסט סינפטי עקב הפעלת סינפסה כימית ?
תרגיל מס' 1: חומצות אמיניות וחלבונים
ערכים עצמיים בשיטות נומריות. משוואה אופינית X מציין וקטור עצמי מציינת ערך עצמי תואם לוקטור.
תרמודינמיקה השפעת טמפרטורה על GG בקרה קינטית ובקרה תרמודינמית רים נאוה ארנה.
הקיבול איננו תלוי במטען ובפוטנציאל
1 Bond Price Volatility נובמבר שאלות 2 ו 4 נתונות שתי איגרות החוב הבאות :
טיב פני שטח (טפ"ש) טיב פני שטח- רמת החלקות של המשטח.
הקדמה. תנועת גל בחומר. קריסת הגל. משוואת ברגר (Burgers’ equation) ופתרונה. גלי הלם. סיכום.
Data Structures, CS, TAU, Perfect Hashing 1 Perfect Hashing בעיה : נתונה קבוצה S של n מפתחות מתחום U השוואה ל - Hash : * טבלה קבועה (Hash רגיל - דינאמי.
מעבדה מס' 2 קביעת כמות חלבון
1 Data Structures, CS, TAU, Perfect Hashing בעיה: נתונה קבוצה S של n מפתחות מתחום U השוואה ל- Hash : * טבלה קבועה (Hash רגיל - דינאמי) * רוצים זמן קבוע.
רגרסיה קו רגרסיה הוא קו תיאורטי המאפשר לנו לבחון את השפעתו של משתנה מנבא אחד (או יותר) על המשתנה התלוי: במילים אחרות, מודל רגרסיה עוזר לנו לנבא על פי משתנה.
מערכים עד היום כדי לייצג 20 סטודנטים נאלצנו להגדיר עד היום כדי לייצג 20 סטודנטים נאלצנו להגדיר int grade1, grade2, …, grade20; int grade1, grade2, …, grade20;
מודל הלמידה מדוגמאות Learning from Examples קלט: אוסף של דוגמאות פלט: קונסיסטנטי עם פונקציה f ב- C ז"א קונסיסטנטי עם S ז"א מודל הלמידה מדוגמאות Learning.
עקרון ההכלה וההדחה.
יחס סדר חלקי.
by Sagiv Frankel & Ayana Wiener, Advised by Dr. Chen Keasar Advised by Dr. Chen Keasar & Mr. Ran Yahalom & Mr. Ran Yahalom.
תחשיב היחסים (הפרדיקטים)
Markov Decision Processes (MDP) תומר באום Based on ch. 14 in “Probabilistic Robotics” By Thrun et al. ב"הב"ה.
תרגיל 2 הרצפטור והמתווך - GPCR and G proteins. Tyrosine Hydroxylase Dopa decarboxylase Dopamine-  -hydroxylase Norepinephrine- transmethylase Pathway.
תעלות, נשאים ואינטגרציה ביניהם
תרגיל 1 פרופ' אלכס לויצקי. בקרה אנזימטית  אינטראקציות אלוסטריות  מודיפיקציות קובלנטיות הפיכות  אקטיבציה על ידי פרוטאוליזה.
A. Frank File Organization Hardware Size Parameters.
1 מבוא למדעי המחשב סיבוכיות. 2 סיבוכיות - מוטיבציה סידרת פיבונאצ'י: long fibonacci (int n) { if (n == 1 || n == 2) return 1; else return (fibonacci(n-1)
ניתוח בחינת הבגרות במכניקה ומעבר..... מכניקה – שאלה 3.
Safari On-line books. מה זה ספארי ספארי זו ספריה וירטואלית בנושא מחשבים היא כוללת יותר מ כותרים כל הספרים הם בטקסט מלא ניתן לחפש ספר בנושא מסוים.
Points on a perimeter (Convex Hull) קורס – מבוא לעבוד מקבילי מבצעים – אריאל פנדלר יאיר ברעם.
1 גילוי מידע וזיהוי תבניות תרגול מס. 3 התפלגות נורמלית רב - מימדית Kullback-Leibler Divergence - משפט קמירות - נגזרת שנייה משפט Log sum inequality משפט.
Interpolation Functions in Matlab By Dmitriy Katsif.
- אמיר רובינשטיין מיונים - Sorting משפט : חסם תחתון על מיון ( המבוסס על השוואות בלבד ) של n מפתחות הינו Ω(nlogn) במקרה הגרוע ובממוצע. ניתן לפעמים.
1 מבוא למדעי המחשב רקורסיה. 2 רקורסיה היא שיטה לפתרון בעיות המבוססת על העיקרון העומד ביסוד אינדוקציה מתמטית: אם ידועה הדרך לפתור בעיה עבור המקרים הבסיסיים.
פיתוח מערכות מידע Class diagrams Aggregation, Composition and Generalization.
Sense (Gene) Anti-sense Anti- sense.
 Client, Supplier ומה שביניהם ( ADT!).  שאלה 1: יצירת ADT עבור מעגל במישור נניח שלקוח מעוניין בפעולות הבאות : הזזת מעגל וחישוב שטח מעגל. הספק יספק ללקוח.
המחסום הברירני מבחין בין מעבר של חומרים שונים מולקולות הידרופוביות מגיעות מהר מאוד לשיווי משקל. מולקולות הידרופוביות מגיעות מהר מאוד לשיווי משקל. מולקולות.
קשר לוגי : סיבה ותוצאה. במשפט – דוגמות קלות בגלל הגשם החלטנו לא לנסוע לטיול לחיפה. הרצון שלי להצליח הניע אותי להשקיע בלימודים. ציפורים נודדות בין יבשות.
מבוא למדעי המחשב סיבוכיות.
ניתוח זמן ריצה (על קצה המזלג)
תקשורת ומחשוב תרגול 1 IP, Classes and Masks.
SQL בסיסי – הגדרה אינדוקטיבית
פרוקטוז, C6H12O6 , חד-סוכר מיוחד
ניתוח זמן ריצה (על קצה המזלג)
משימת חקר מכוון ללמידה משמעותית
ניתוח זמן ריצה (על קצה המזלג)
הנעה חשמלית.
בחירת חומר גלם כתב: עמרי שרון.
Presentation transcript:

נסיונות הדחה לאפיון קישור של אגוניסטים ואנטגוניסטים לרצפטור 2 α אדרנרגי צורת עקומת ההדחה 50% IC 50 % קישור הרדיוליגנד [I] ריכוז מדיח 50% % קישור הרדיוליגנד קישור ספציפי קישור לא ספציפי Total בעקומת log רואים בבירור את ה- 100% ו -0% IC 50 – ריכוז המדיח עבורו מתקבל 50% קישור. משמעות הדבר אינה שחצי מסה"כ הרצפטורים תפוסים אלא ש50% מהרצפטורים הנקשרים לרדיוליגנד ( קלונידין במקרה שלנו) בריכוזו הנתון ובהעדר מדיח- תפוסים. ערך זה תלוי בכמות הליגנד המסומן Log[I] 0.5 [I] log

יתרונות שיטת ההדחה על פני שיטת הקישור הישיר בקביעת Kd ( Ki) : 1.מציאת Kd עבור ליגנדים רבים ( אגוניסטים ואנטגוניסטים) ללא צורך לסמנם 2.באמצעות הדחה מבודדים את הקישור הלא ספציפי 3.ניתן לקבוע Kd גם לליגנדים עם Kd גבוה הגורם לפירוק הקומפלקס 4.ניתן לקבוע Kd של ליגנדים בעלי ספציפיות קישור לאתרים נוספים מעבר ל- 2α אדרנרגי * שאלה 1 לדו"ח: למה בניסיונות ההדחה שלנו נעשה שימוש בקלונידין חם (חומר סינטטי) ולא נוראדרנלין (חומר טבעי)?

פיתוח נוסחת ההדחה של Cheng and Prusoff משוואת מיכאליס מנטן : B = המשוואה בעיכוב תחרותי : Bi = Kd הולך ועולה עם עליה בריכוז המדיח, B max לא משתנה B - רצפטור קשור - Bmaxמקסימום רצפטורים L - ריכוז ליגנד חופשי Kd - קבוע פירוק הרדיוליגנד בש"מ Ki - קבוע פירוק המדיח בש"מ Bi - רצפטור קשור בנוכחות מדיח I - ריכוז המדיח

חישוב Ki (Kd של המדיח) IC 50 – שמתקבל מעקומת ההדחה [Radioligand] - שאיתו עבדנו בניסוי Kd – שקבענו בניסיונות קישור בנוכחות המדיח ב- IC 50 נבודד את Ki בעיכוב תחרותי - Bmax לא משתנה ו- Kd הולך ועולה עם עליה בריכוז המדיח ככל ש [L] יעלה כך IC 50 יעלה פקטור המגדיל את Kd

ריכוז הקלונידין במעבדות שלנו קרוב ל- Kd אם נעבוד בריכוזי רוויה של קלונידין - נקבל קריאות גבוהות ומדויקות יותר אך מצד שני נקבל קישור לא ספציפי גבוה. אם נעבוד בריכוזים נמוכים - נקבל קישור לא ספציפי נמוך אבל יתקבלו קריאות נמוכות וערכו היחסי של הרעש יעלה בריכוז של קלונידין סביב ה- Kd עקום הקישור כמעט לינארי ולכן כל שינוי בריכוז הקלונידין משנה את B. יש צורך לדייק בפיפטציה! קישור L]] Kd * שאלה 2 לדו"ח הסבר את ההבדלים א. בין Kd ו- IC 50 ב. בין Bmax ו- 100% קישור בניסוי שלנו איזה יחס יתקבל בין 100% לבין Bmax?

מדידת % הקישור 50% Log[I] 0.5 % קישור הרדיוליגנד [I] log 100% 100% קישור = קלונידין ללא מדיח 0% קישור = קישור לא ספציפי – קלונידין עם אפינפרין בריכוז גבוה Total = פילטרים ספוגים בקלונידין מהו תפקיד ה- Total? * בדו"ח: לא לחבר בין הנקודות אלא להעביר את הקו הידני הטוב ביותר

עקומת Scatchard לא לינארית: B/F B שיפוע העקומה קובע את Kd כל שינוי ב – Kd במהלך הניסוי יצור כמה עקומות לינאריות – אך ויזואלית נקבל עקומה אחת לא לינארית B/F B B קעורה קמורה

עקומת Scatchard לא לינארית: 1. אוכלוסיה הטרוגנית של הרצפטורים 2. ראקצית קישור בת מספר שלבים או מספר מרכיבים 3. קואופרטיביות חיובית או שלילית בין אתרי קישור 4. בריכוזים נמוכים של ליגנד הראקציה לא מגיעה לשווי משקל ( Kd כביכול גבוה) * שאלה 3 לדו"ח : ציין בכל אחד מהמקרים איזו עקומה תתקבל ולמה

ליגנד * שאלה 4 לדו"ח : הציעו ניסוי בו תוכלו להבדיל בין אגוניסט לאנטגוניסט לרצפטור שחוצה 7 פעמים את הממברנה ומצומד לחלבון G מבלי לבדוק פעילות. ציירו את עקומות הקישור המתקבלות בניסוי. חלבון G הקשור לרצפטור מחזק את האפיניות של הרצפטור לליגנד (אגוניסט) קישור GTP גורם להפרדת חלבון G ולהעלאת ה- Kd. Kd של אנטגוניסט לא משתנה בעקבות קישורו של GTP, כי חלבון G לא נקשר לרצפטור. ליגנד cpm ]אגוניסט / אנטגוניסט]