E XPLOITING R ANDOM F OREST TO P REDICT S ULFATED T YROSINE 971416 宋孟純 971431 洪敏華 973347 洪瑜珊.

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E XPLOITING R ANDOM F OREST TO P REDICT S ULFATED T YROSINE 宋孟純洪敏華洪瑜珊

目的與動機 Human Genome Project 完成後生物資訊可與醫學結合利用生物屬性及工具預測特殊蛋白質的位置

T YROSINE S ULFATION Tyrosine sulfation 是一種很重要的蛋白質轉譯後修飾

P OST - TRANSLATIONAL MODIFICATION 當 mRNA 轉譯成蛋白質後，會經過一連串很重要的化學修飾蛋白質與其他官能團結合，改變蛋白質的功能和結構 HAPPENS HERE!!

T YROSINE S ULFATION Tyrosine sulfation 是一種很重要的蛋白質轉譯後修飾跟免疫反應、白血球凝著、止血和蛋白質間傳輸等有關 PTM 大多作用於蛋白質表面，但硫酸鹽化反應不穩定，發生的位置很模稜兩可

相關資訊 1.Datasets 的來源 : UniProtKB/Swiss-Port 2.Window Size: 9 3. 使用的 feature: 4. 使用的 tool: SVM 、 WEKA 、 QuickRBF AA+B62 AA+AAPC AA+PWM B62+PWM B62+AAPC AAPC+PWM

四、結論預測 SULFATED TYROSINE 由左圖得知，使用 Weka 的 Random Forest 方法來執行，並將資料加成 AAPC+PWM 的屬性所預測出 sulfated tyrosine 的 accuracy 為最高 (93.6%) 。

五、成果 AAPC 這個屬性是較新被提出的演算法，尚未被多數論文使用在專題過程中，各種工具與屬性的利用，採用 Weka 的 Random Forest 來執行 AAPC+PWM 作為預測 sulfated tyrosine 的位置，其值為高

報告到此結束謝謝聆聽