שימוש במגשרים כימיים ללימוד מרחקים בין הליקסים במשחלף NhaA דרור לנה סמולנסקי

Slides:



Advertisements
Similar presentations
תרגול 8 Skip Lists Hash Tables. Skip Lists Definition: – A skip list is a probabilistic data structure where elements are kept sorted by key. – It allows.
Advertisements

Present Progressive NEGATIVE. Good Night Mr. Cohen It is night. It’s eleven o’clock. Mr. Cohen is in bed. His eyes are closed. He is sleeping. He isn’t.
ממיבחניםC שאלות ++.
תוכנה 1 סמסטר א ' תשע " ב תרגול מס ' 7 * מנשקים, דיאגרמות וביטים * לא בהכרח בסדר הזה.
מבוא למדעי המחשב לתעשייה וניהול
1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #4 Refinement in Z: data refinement; operations refinement; their combinations.
Present Progressive Present Progressive הווה עכשווי / ממושך.
A) 80 b) 53 c) 13 d) x 2 = : 10 = 3, x 3 = 309.
Pointers הרצאה קריטית. השאלות הפתוחות מה זה ה- & שמופיע ב scanf מדוע כשמעבירים מחרוזת ל scanf אין צורך ב & האם ניתן להכריז על מערך שגדלו אינו ידוע בתחילת.
כתיבת עבודת גמר מבנה העבודה  מבחינה צורנית - יש להקפיד על אחידות בכתיבה  כותרות אחידות  רווחים זהים, פונט בגודל אחיד (12, רווח וחצי)  הצגת.
To Learn or to be Taught? Harnessing Technology to Enhance Self Regulated Learning.
1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #2 Z notation; Examples.
BLAST Tutorial 3 What is BLAST? Basic Local Alignment Search Tool Is a set of similarity search programs designed to explore sequence databases. What are.
אביב תשס " ה JCT תיכון תוכנה ד " ר ר ' גלנט / י ' לויאןכל הזכויות שמורות 1 פרק 10 Packages.
A. Frank File Organization קובץ ישיר מתקדם Advanced Direct File.
תאי דם אדומים בעלי מבנה דו קערורי גמיש המאפשר להם לחדור לתוך נימים דקים. חסרי גרעין ואורגנלות. " שק " של המוגלובין (Hb) מוקף ממברנה – ההמוגלובין מוביל.
1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #5 Refinement in Z: data refinement; operations refinement; their combinations.
לכל אחת מארבעת המעבדות יש להביא: 1)חלוק. 2)טושים לא מחיקים (פנטלים). 3)טבלאות עבודה, גרפים וכו' – ע''פ הנדרש יש להגיע מוכנים לבוחן קצר שיערך לפני תחילת.
שאילת שאלות שאלת חקר המפתח למנעול 1. שאילת שאלות – שאלת חקר מה ניתן לשנות ? :  בתנאים : טמפ ' או לחץ או הכלים, או הציוד  בחומרים : איכות או כמות או.
Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #6 appendix Statecharts vs. Raphsody 7 (theory vs. practice)
תכנות תרגול 6 שבוע : תרגיל שורש של מספר מחושב לפי הסדרה הבאה : root 0 = 1 root n = root n-1 + a / root n-1 2 כאשר האיבר ה n של הסדרה הוא קירוב.
1 Formal Specifications for Complex Systems (236368) Tutorial #1 Course site : T.A. :Emilia Katz.
משחק מכף לכף כבסיס לסיעור מוחין משותף אביגיל אורן תמי זייפרט דוד מיודוסר
השוואה בין מערכות למסדי נתונים בשקפים אלו נשווה בין מסד הנתונים של רכבת ישראל למסד של רכבת גרמניה. בהרבה מקרים, המסד של מערכת הרכבות הישראלית לא יכול למצוא.
ערכים עצמיים בשיטות נומריות. משוואה אופינית X מציין וקטור עצמי מציינת ערך עצמי תואם לוקטור.
Golan H מערכת הדם שעור 2 - קבוצות דם. ד " ר חוה גולן.
טיב פני שטח (טפ"ש) טיב פני שטח- רמת החלקות של המשטח.
מעבדה מס' 2 קביעת כמות חלבון
Markov Decision Processes (MDP) תומר באום Based on ch. 14 in “Probabilistic Robotics” By Thrun et al. ב"הב"ה.
Global Motion Estimation קורס : מבוא לעיבוד מקבילי מרצה: דר' גיא תל צור מגישים: גלעד נרקיס אייר רום אייר רום קבוצה: pp3.
Safari On-line books. מה זה ספארי ספארי זו ספריה וירטואלית בנושא מחשבים היא כוללת יותר מ כותרים כל הספרים הם בטקסט מלא ניתן לחפש ספר בנושא מסוים.
אביב תשס " ה JCT תיכון תוכנה ד " ר ר ' גלנט / י ' לויאןכל הזכויות שמורות 1 פרק 7 ISP דוגמא נוספת.
Text to speech In Mobile Phones איתי לוי. הקדמה שימוש בהודעות טקסט על המכשירים הסלולארים היא דרך תקשורת מאוד פופולארית בימינו אשר משתמשים בה למטרות רבות,
דגמי שימוש ושיתופיות בסביבת ויקי בקורסים אקדמיים חגית מישר-טל ועדנה טל-אלחסיד.
WEB OF SCIENCE. WEB OF SCIENCE  Science Citation Index ExpandedTM  Social Sciences Citation Index®  Art & Humanities Citation Index®
Supplemental Figure 1 Chlorophyll fluorescence (rel) 1 min pgr5 pgr5 + NEM (0.5mM) Supplemental Figure 1: In vivo detection of the NDH-dependent electron.
Kashrut is a mitzvah in the Torah and has been passed on through generations. Kashrut is a chok. this means that we don’t know why we do it but we.
אתרי מתמטיקה באינטרנט לפניכם מספר אתרים מעניינים ללימוד מתמטיקה תוך כדי משחק ותרגול. אנו מניחים שמצגת זו מביאה מספר קטן מן האתרים הקיימים ברשת. אין ספק.
Sense (Gene) Anti-sense Anti- sense.
Wallwisher Writing in the Present Progressive. Task 1 Enter our site. Click on Wallwisher. Click on “Describing Pictures”. – Post one sticky note for.
Prelesson first question Lots of Potential Energy Not a lot of Potential Energy קובץ זה נועד אך ורק לשימושם האישי של מורי הפיזיקה ולהוראה בכיתותיהם. אין.
המחסום הברירני מבחין בין מעבר של חומרים שונים מולקולות הידרופוביות מגיעות מהר מאוד לשיווי משקל. מולקולות הידרופוביות מגיעות מהר מאוד לשיווי משקל. מולקולות.
Chapter 18 Electric Energy and Capacitance demonstrations קובץ זה נועד אך ורק לשימושם האישי של מורי הפיזיקה ולהוראה בכיתותיהם. אין לעשות שימוש כלשהו בקובץ.
מצאו את ההבדלים מסע בזמן במתחם התרבות תל אביב, ישראל מאי 2007 – ינואר 2008 מצאו את ההבדלים מסע בזמן במתחם התרבות תל אביב, ישראל מאי 2007 – ינואר 2008 Find.
2003B Q5 Suppliers(sid, sname, city) Select sid from suppliers where city=‘jerusalem’ or sname like ‘%Smith’ Select sid from suppliers where city=‘jerusalem’
ENGLISH MUSIC FESTIVAL DAY ABBA By Maya, Daniel, Rimon and Lihi ה 3.
1 מבוא לתכנות – תוכנה פונקציות. 2 משחק החיים של Conway The Game of life סימולצית פעילות מערכת תאים שפותחה על ידי המתמטיקאי הבריטי ג'ון הורטון קונווי בשנת.
Combo Box שלושה סוגים של Combo Box: Style 0 (default) - drop-down combo box המשתמש יכול להוסיף אפשרויות לרשימה או ללחוץ על החץ לבחירה מרשימת האפשרויות.
שיתוף PDT בין חוטים PDT Thread A Process Descriptor File Object 1 File Object 2 File 1 File 2 pthread_create Thread B Process Descriptor ה PDT משותף לכל.
Clicker Questions for Forces 1D Activity 2 קובץ זה נועד אך ורק לשימושם האישי של מורי הפיזיקה ולהוראה בכיתותיהם. אין לעשות שימוש כלשהו בקובץ זה לכל מטרה.
קשר לוגי : סיבה ותוצאה. במשפט – דוגמות קלות בגלל הגשם החלטנו לא לנסוע לטיול לחיפה. הרצון שלי להצליח הניע אותי להשקיע בלימודים. ציפורים נודדות בין יבשות.
קצת היסטוריה 1981דיווח ראשון על תסמונת כשל חיסוני נרכש בקרב מספר הומוסקסואלים. 1981דיווח על ביטויים שונים של איידס בקרב מזריקי סמים, חולי המופיליה, מקבלי.
מספרים אקראיים ניתן לייצר מספרים אקראיים ע"י הפונקציה int rand(void);
Sparse RNA Folding: Time and Space Efficient algorithms
Clicker questions for Forces 1D Activity 1
Comp. Genomics Recitation 11 SCFG.
תרגום מחומצות גרעין לחלבונים מצגת זו היא תוצר העבודה שלי אבל גם תוצר של הערות בונות של המורים. אשמח לקבל הערות ותיקונים כדי להמשיך ולשפר אותה. תודה !
SQL בסיסי – הגדרה אינדוקטיבית
JOHN LENNON ( ) The Beatles
בעזרת microplate reader
פרוקטוז, C6H12O6 , חד-סוכר מיוחד
ממשקים - interfaces איך לאפשר "הורשה מרובה".
מה קורה כאן?
למה רמת פרמי צריכה להיות קבועה בחומר שנמצא בשווי משקל?
מבחן t למדגם יחיד.
תזכורת על מה דיברנו שיעור שעבר? בנינו אתר אינטרנט עם כותרות
עבודה מול שרת המצגות – Win XP
Shell Scripts בסביבת UNIX
Cyclic electron flow in hpr1 mutants.
Modulation of Hh signaling modifies doxorubicin incorporation in leukemia cells. Modulation of Hh signaling modifies doxorubicin incorporation in leukemia.
Presentation transcript:

שימוש במגשרים כימיים ללימוד מרחקים בין הליקסים במשחלף NhaA דרור לנה סמולנסקי

o-PDM BMH MTS 9.39 Å Å

-tryp +trypBMH +tryp o-PDM +tryp MTS +tryp INHIBITOR

Mutant protein Activity ממברנות הפוכות T132C / G338C - אין פעילות AO+ רמת פלואורסנציה בסיסית H+H+ ATP H+H+ H+H+ H+H+ H+H+ H+H+ H+H+ H+H+ H+H+ AO quenching AO+ AO H+H+ H+H+ Na+ / Li+ Na + H+H+ AO+ H+H+ dequenching AO

Mutant protein ActivityNaCl treatment No treatment o - PDM BMH

Mutant protein ActivityLiCl treatment No treatment o-PDM BMH

גילוי שיירים חשופים לתמיסה IPTG NEM סימון ציסטאינים חשופים לתמיסה Sonication FL- NEM סימון ציסטאינים שאינם חשופים לתמיסה

Fluorescent picture 1sec exposure Coomassie dye גילוי שיירים חשופים לתמיסה יש חלבון בכל הבאריותהשירים חשופים לתמיסה T132CG338C +NEM -NEM

מסקנות הליקסים 4 ו – 11 קרובים זה לזה במבנה השלישוני של החלבון. 2.מגשרים יכולים לשחזר את פעילות החלבון המוטאנט, ולאפשר לו להעביר H + ו Li +. הדבר מלמד על הצורך בקרבה בין ההליקסים 4 ו 11על מנת לאפשר את פעילות NhaA. 3.T132 ו – G338 ככל הנראה חשופים לתמיסה בממברנת התא. 4.יתכן ו - NEM יכול לחדור למרווח הממברנלי ולסמן את T132 ו G338 בממברנת התא.