1. עולם הנגיפים
פרופ' אלכסנדר בולשוי

2. מהם הנגיפים (וירוסים) ?
הנגיפים מוגדרים כאורגניזמים אלתאיים שהגנום שלהם מורכב מחומצות גרעין ושהם מתרבים רק בתאים מאכסנים (תאים פונדקאיים) ומשתמשים בחילוף החומרים של התא המאכסן בכדי ליצור חלקיקים הנקראים ויריונים המגינים על החומר התורשתי ומאפשרים להעביר אותו לתא אחר.

3. השוואה בין וירוסים לחיידקים
חיידקים (Bacteria)
וירוסים (Viruses)
מאפיינים
קיים (דנ"א)
קיים (דנ"א/ רנ"א)
חומר תורשתי
2-0.5 מיקרומטר
(ניתן לראותם במיקרוסקופ אור)
ננומטר
(לא ניתן לראותם במיקרוסקופ אור)
גודל
קיימת
לא קיימת
גדילה
(חלוקת תא לשניים)
(שכפול החומר התורשתי ועטיפתו בקופסית) *
התרבות
טפילים חלקיים
טפילים מוחלטים
עצמאות
* ההתרבות מתקיימת אך ורך בתוך תא חי (תא מאכסן- תא פונדקאי)

4. השוואה בין וירוסים לחיידקים (המשך)
חיידקים (Bacteria)
וירוסים (Viruses)
מאפיינים
קיים
ייצור חלבונים
קיימת
לא קיימת
תנועה
לפי הסיסטמטיקה הקלאסית
לפי התא המאכסן
מיון
על ידי אנטיביוטיקה
חיסון מונע או חיזוק מערכת החיסון
דרכי טיפול במחלה

5. שלבים בהדבקת תא בנגיף מסלול ליטי (הוירוס אלים)
הוירוס נספח לתא
החומר התורשתי של הוירוס חודר לתא
החומר התורשתי משוכפל וגורם לתא המאכסן לייצר חלבונים לוירוס
החומר התורשתי והחלבונים מתחברים לוירוסים שלמים
התא המאכסן מומס והוירוסים פורצים מתוכו
תא המאכסן נהרס
מסלול ליזוגני (הוירוס מתון)
הוירוס נספח לתא
החומר התורשתי של הוירוס חודר לתא
החומר הגנטי משתלב בגנום התא
התא אינו נהרס
הוירוס המתון מסוגל להפוך לאלים

6. מבוא לביולוגיה מולקולרית

7. יצורים פרוקריוטים אאוקריוטים ווירוסים
מאפיין
לא קיים
קיים
חילוף חומרים
שימוש באנרגיה של התא המאכסן
קיימת
יצירה ושימוש באנרגיה
אלתאי acellular
חד /רב תאי
חד-תאי
יצור רב- תאי/
חומר תורשתי
גרעין
קופסית ובחלקם גם מעטפת
ממברנה ובחלקם גם דופן קשיחה
ממברנה ודופן קשיחה
גבול התא
ריבוי מיני
ניתן לחלק את היצורים החיים גם לפי פרוקריוטים, אאוקריוטים ווירוסים. המשותף לכולם הוא הקיום של החומר התורשתי- עליו נלמד כעת.בנוסף, לתת דוגמא של פרוקריוטים שכבר ידועה- חיידקים ואאוקריוטים- צמחים, בע"ח ואף אצות חד-תאיות.

8. הדנ"א DNA
הדנ"א מכיל אינפורמציה שעוברת בתורשה. אפשר לומר שדנ"א הנו שרשרת של אבני בניין (בסיסים)
Base - בסיס או אבן בניין
4 סוגי הבסיסים מרכיבים את הדנ"א: {A,C,G,T}.
Sequence – רצף בסיסים
דוגמא לחלק משרשרת דנ"א (הנקראת רצף בסיסים): TTACCCGGGA…..
Gene – גן.
גן באדם מורכב מכ ,000בסיסים

9. הרנ"א RNA
רנ"א- חומצת גרעין, הנבנית על גבי תבנית של דנ"א ומהווה תעתיק שלו.
הרנ"א, כמו הדנ"א, הנה שרשרת של אבני בניין (בסיסים)
הבסיסים המרכיבים את הרנ"א: {A,C,G,U}.
דוגמא לחלק משרשרת רנ"א (הנקראת רצף בסיסים): UUACCCGGGA…..
הרנ"א הנה שרשרת חד גדילית

11. The Central Dogma

13. חוקי זיווג הבסיסים בדנ"א
ישנם 4 סוגי בסיסים )נוקלאוטידים( והם:
Adenine (A) , Cytyosine (C) , Guanine (G) , Thymine (T)
T יכול להתחבר רק עם A  T : A בקשר כימי 
C יכול להתחבר רק עם C  G : G בקשר כימי

14. דנ"א פולימראז (DNA Polymerase)
אנזים המזרז את היצירה של דנ"א מאבני הבניין
(G, C, A, T) על פי תבנית של DNA
דנ"א פולימראז נצמד לאזור מוצא השכפול בדנ"א שבו נמצא התחל (Primer)
דנ"א פולימראז מאריך את שרשרת הדנ"א החדשה מכיוון '5 ל- '3
אם ישאלו לגבי הלופ בתמונה, אז אולי להכנס לבעיתיות של סינתזת הגדיל השני שהפיתרון שלה הוא יצירת לופים בדנ"א, סינתוז מקטעים מקטעים ואיחוי על ידי האנזים ליגאז.

15. מדנ"א לחלבון
שכפול
חלבון
תרגום
רנ"א
תעתוק
דנ"א

17. Codons - קודונים

18. שלושה סוגי רנ"א משתתפים בתרגום
רנ"א שליח (Messenger RNA)- מכיל את המידע לבניית החלבונים
רנ"א מוביל (Transfer RNA) - נקרא גם רנ"א מתאם - נושא את החומצה האמינית לאתר היצירה של הקשר הכימי ובכך מתאם בין שפת אבני הבניין לבין שפת החומצות האמיניות
רנ"א ריבוזומלי (Ribosomal RNA)- מעורב בהרכבת תצמיד התרגום בקצה '5 של הרנ"א השליח וכן פועל כריבוזום ליצירת הקשר הכימי בין חומצות האימנו
רנ"א שליח הוא גנום מתווך בין גן לבין תוצר סופי חלבון
רנ"א מוביל ורנ"א שליח הם תוצרים סופיים של הגנים שמהם תועתקו. כלומר הגנום לרנ"א מוביל ולרנ"א ריבוזומלי אינם מקודדים לחלבון, אלה למולקולת רנ"א

19. סיכום- דנ"א ורנ"א רנ"א דנ"א מאפיינים G, C, A, U G, C, A, T אבני הבניין
חד-גדילי
דו-גדילי
גדילים
שלושה סוגים
(שליח, מוביל, ריבוזומי)
סוג אחד
סוגים
שליח- גרעין +
מוביל
ריבוזומי
גרעין
מיקום
לא יציב
(במיוחד רנ"א שליח)
יציב מאוד
יציבות
מחוץ לגרעין

20. חלבונים Proteins חלבונים הם שרשראות ארוכות של חומצות אמינו
חומצות אמינו (Amino Acid)- אבני הבניין של השרשרת החלבונית
קיימות 20 חומצות אמינו אשר לכולן מבנה בסיסי משותף, אליו מחוברת תוספת (שייר) ייחודית היוצרת את השוני ביניהן.

22. המגוון הרחב במבנה החלבונים הנו היסוד לטווח הרחב של תפקידיהם:
תפקידי החלבונים
המגוון הרחב במבנה החלבונים הנו היסוד לטווח הרחב של תפקידיהם:
אנזימים- זרזים ביולוגיים- רוב התגובות הכימיות (בניה ופירוק) המתרחשות במערכות ביולוגיות מוזורזות על ידי אנזימים, אשר הם חלבונים.
האנזימים מזרזים את התגובות הכימיות לפחות פי מיליון.
חלבונים מבניים- חלבונים הממלאים תפקידים מבניים בתא.
חלבונים מווסתים- חלבונים בעלי פעילות של בקרה על ביטויים של גנים
חלבוני הובלה (transporters)- חלבונים המסיעים בהעברת חומרים ממקום למקום (הובלה בכלי דם, הובלת חומרים מחוץ לתא ולתוך התא...).
דוגמאות: אנזימים- דנ"א פולימראז ורנ"א פולימראז, מבניים- היסטונים, חלבונים מווסתים- אינסולין מווסת את רמת הסוכר בדם (האינסולין מיוצר בלבלב); חלבונים להובלה: המוגלובין מוביל חמצן.לגבי מערכת החיסון יוקדש שיעור מיוחד בהמשך.
םיעיפשמה םירמוח םה הלא ,עוגנה אתה םתוא רציימ - ןורפרטניא - םיניקוטיצ 'םיתתואמ' הלא םירמוח .םיפיגנה דגנ ףוגה לש תינוסיחה הבוגתה תרקב לע םירצוע םה ךכו ,םהלש תוינוסיחה תויוליעפה תא ריבגהל םיכומסה םיאתל םוח תאלעהל םורגל םילגוסמ םימיוסמ םיניקוטיצ .םהילא םג םיפיגנ תרידח םיפיגנה לופכשב עוגפל היושע ההובג ףוג תרוטרפמט ,עגפנה לש ףוגה .ףוגב םתוטשפתהבו

23. תפקידי החלבונים (המשך)
נוגדנים- חלבונים המסייעים למערכת החיסון להתגונן בפני פולשים זרים כגון, חיידקים ווירוסים.
שליחים- חלבונים המעורבים בתקשורת בין תאים או בין יצורים חיים שונים. למשל, הורמונים ופרומונים.
דוגמאות: חלבוני שליחים- פרומונים (חלבונים בעלי ריח מיוחד המוכר לאותו מין, לדוגמא- נמלה מפיצה ריח שהיא מוצאת אוכל. משיכה בין המינים.

24. טעות, מוטציה, באחד מהשלבים- שכפול, תעתוק או תרגום עלולה לגרום לשיבוש במבנהו ובתפקודו של של התוצר הסופי- החלבון

25. סווג הנגיפים לפי מגוון הגנומים ומחזור החיים שלהם

26. טקסונומיה של נגיפים בהווה
עם פיתוח המיקרוסקופ האלקטרוני, שיטות ביוכימיות ושיטות מולקולריות, נמצאה דרך פשוטה ומדויקת לסווג הנגיפים
סווג הנגיפים מבוסס כיום על קריטריונים של:
סוג חומצת הגרעין (דנ"א/רנ"א, חד-גדילי/דו-גדילי...)
צורת הקופסית (סלילונית, איקוזהדרית....)
נוכחות או העדר מעטפת
עיקר הסווג של הנגיפים הוא לפי סוג חומצת הגרעין
עם פיתוח המיקרוסקופ האלקטרוני, שיטות ביוכימיות וביולוגיה מולקולרית נמצאה דרך פוטה יותר לסווג הנגיפים- לפי מבנה וסוג חומצת הגרעין

27. באקטריופאז’ T-even bacteriophage
וירוס מורכב
קופסית חלבונית (ראש)
צוואר
זנב
לוחית בסיס
סיסי זנב
דנ”א דו-גדילי
מדביק חיידקים

28. הדבקת החיידק בפאז'

29. The Baltimore Classification Scheme
DNA -> mRNA -> proteins
All viruses must direct the synthesis of mRNA
David Baltimore proposed the classification based on the generic system of each virus
The system describes the obligatory relationship between the viral genome and its mRNA

30. The Baltimore Taxonomy
By the MB convention, mRNA is defined as a positive [(+)] strand because it contains immediately translatable information.
In the Baltimore taxonomy, a strand of DNA that is of equivalent polarity is also designated a (+) strand.
The complements of (+) strands are designated negative [(+)] strands.

31. The Baltimore Classification Scheme - Figure
According to mRNA

32. Genome Replication and mRNA production by RNA Viruses
A configuration of the genome of the RNA virus may be
Unimolecular or segmented
Single stranded of
(+) polarity or
(-) polarity
Double stranded
Circular or linear

33. Representative RNA viruses
Poliovirus ss
(+)
linear
Reovirus ds
Linear, segments
Sundbis virus
Influenza
(-)
Linear, 7-8 segments
Vesicular stomatitis
Linear
Arenavirus
Hepatitis delta
Circular

34. מחזור החיים/ההתרבות של הוירוסים

35. מחזור החיים/ההתרבות של הוירוסים
ניתן לחלק את מחזור ההתרבות של הוירוסים לחמישה שלבים:
1) ספיחה של הנגיף לשטח הפנים של התא המאכסן.
2) חדירה של הנגיף לתא. חדירה של הגנום בלבד תוך כדי השלת הקופסית/ חדירה עם הקופסית וללא המעטפת והשלת הקופסית בתא.
3) סינתזה- בניה של מרכיבי הנגיף. מורכב משני שלבים: א. שכפול הגנום הנגיפי. ב. התבטאות הגנום - תעתוק וסינתזה של חלבונים.
4) הבשלה- הרכבת הוויריונים מהגנום והחלבונים. הרכבת הקופסית החלבונית מן החלבונים הבודדים וצירוף חומצת הגרעין, הגנום.
5) שחרור הוויריונים מתא המאכסן. לעתים קרובות מלווה שחרור הוויריונים בהרס של תא המאכסן.

36. אנדוציטוזה מרבית החיידקים חודרים לתא בשיטה זו.
התקשרות הנגיף לקולטן על פני שטח התא.
ממברנת התא יוצרת גומה לשם נכנס הנגיף.
הגומה מצפה את הנגיף ומתקפלת פנימה לתוך התא.
הגומה המצופה, השלפוחית, משחררת את הנגיף בתוך התא.

37. איחוי (fusion) המעטפת של הנגיף מתאחה עם ממברנת התא המותקף.
הנוקליאופלסמיד (חומצת הגרעין עטופה בקופסית) משתחרר לתא.

38. הדבקות, מחלה וריפוי

39. דרכי חדירת הנגיפים דרכי נשימה עור עור עיניים מההורה לצאצא דרכי עיכול
דרכי הרביה והשתן

40. התפשטות הנגיף בגוף הדבקה מערכתית הדבקה מקומית הדבקה באתר חדירת הנגיף
הרס הרקמה במקום ההתרבות וברקמות באברים אחרים בגוף
הנגיפים מתפשטים לאברים נוספים בגוף באמצעות כלי הדם והלימפה
הדבקה מקומית
ההדבקה באתר חדירת הנגיף
הרס הרקמה במקום ההתרבות הוא הגורם לסימני המחלה
בהדבקה מקומית המחלה מוגבלת לאיבר מסוים
הדבקה מערכתית: דרך כלי הדם- דרך זרם הדם או ספיחת הנגיף לתא דם אדום או לבן או הדבקה של תא דם
אבעבועות שחורות סימפטומים- מרגע שמגיע הנגיף לעור (תקופת הדגירה) יש פריחה, חום כאבי ראש וחולשה כללית קשה.

41. התפשטות הנגיף בגוף הדבקה מערכתית
לדוגמא: באבעבועות שחורות הנגיף חודר דרך הפה/האף, מגיע לזרם הדם ולאיברים פנימיים (כבד טחול וריאות) ומשם לכלי הדם ולעור
הרשת המסועפת של תאי העצב גם כן משמשת להתפשטות הנגיף
לדוגמא: נגיף הכלבת מגיע ממקום הנשיכה אל מערכת העצבים
הדבקה מקומית
לדוגמא: נגיפי הנזלת פוגעים ברירית האף, נגיפי השפעת פוגעים בקנה הנשימה, נגיפי המעיים פוגעים בחלל המעי
הדבקה מערכתית: דרך כלי הדם- דרך זרם הדם או ספיחת הנגיף לתא דם אדום או לבן או הדבקה של תא דם
אבעבועות שחורות סימפטומים- מרגע שמגיע הנגיף לעור (תקופת הדגירה) יש פריחה, חום כאבי ראש וחולשה כללית קשה.

42. דרכי נשימה
יציבות הנגיף בתרסיס תלויה ביכולתו לשמור על כושר ההדבקה הפוריה (תנאי סביבה- לחות, טמפ' וכדו')

43. דם
שכבת העור העליונה – האפידרמיס, אין בה כלי דם ועצבים ולכן ההדבקה שלא דרך חרקים הנה מקומית בלבד.
מלריה

44. מחלות ויראליות באדם ובבע"ח

45. מחלות ויראליות שפעת חזרת כלבת חצבת אדמת אבעבועות רוח
שיתוק ילדים (פוליו)
שעלת
הרפס
צהבת ויראלית
איידס
קדחת צהובה

46. חזרת Mumps Virus נגיף החזרת שייך לנגיפי מערכת העיכול
מועבר דרך הרוק והפרשות של מערכת הנשימה
הנגיף עובר דרך הדם לבלוטות הרוק ומתרבה שם
הסימפטומים: קושי בבליעה, נפיחות הבלוטות המתבטאת בנפיחות בפנים, חום
ריפוי: המחלה חולפת לאחר זמן מה והגוף מחוסן לכל החיים
סיבוכים: דלקת בשחלות, דלקת באשכים (בזכרים אחרי גיל ההתבגרות) ודלקת קרום המוח
חיסון: נגיף חי מוחלש. במסגרת חיסון משולש: חזרת-חצבת-אדמת
מחלת ילדים

47. הרפס סימפלקס-1 Herpes Simplex Virus 1 (HSV-1)
נגיף ההרפס מסוג 1 שייך לנגיפי העור
ההדבקות הראשונית בנגיף מתרחשת בדר”כ בילדות במגע עורי
ב- %15 ממקרי ההדבקות מתפתחת מחלה הידועה כפצעי קור או אבעבועות חום
סימפטומים: הפצעים/אבעבועות מתפתחים בדר”כ בשפתיים ועוברים כאשר הזיהום עובר
90% מתושבי ארה"ב נדבקו ב- HSV1
תרופה: זובירקס

48. הרפס סימפלקס-1 Herpes Simplex Virus 1 (HSV-1)
הנגיף נשאר רדום בתאי העצב המקשרים בין הפנים למערכת העצבים
הנגיף חוזר בעקבות חשיפה יתרה לקרני UV של השמש, במצבי לחץ או בעקבות שינוי הורמונלי
סיבוכים: Herpetic Keraitis - הזדהמות של קרנית העין בנגיף. במקרים נדירים הוירוס מגיע למוח וגורם שם לדלקת Herpes Encephalitis
90% מתושבי ארה"ב נדבקו ב- HSV1
תרופה: זובירקס

49. Life cycle of HSV-1 (productive infection)
Entry by fusion
Immediate-early genes transcription
Early genes transcription
Late gene expression
Budding from nucleus
Exocytosis

50. Epstein Barr Virus Infection is widespread.
Most people have antibodies by the time they reach adulthood.
Following primary infection, the virus persists in a latent form in the B-lymphocytes of the host.

51. B Cell Latency
EBV infects B-lymphocytes and establishes a latent infection.
The viral genome enters the nucleus and persists.
Six viral genes, termed EBNA 1-6 are expressed during this stage.

52. B Cell Latency
They transform the B cell into an immortal, continuously dividing cell.
A small number of these "EBV-transformed" B cells circulate in the blood of healthy carriers.
Their numbers are kept in check by the host's immune response.

53. מערכת החיסון

54. התגוננות הגוף בפני פולשים
מחסומים פיסיקליים וכימיים: אנזימים מפרקים, חומציות בקיבה, שכבת ריסים בקנה הנשימה...
הגנה בלתי ספציפית: תאים בולעניים
הגנה ספציפית: פעילות מערכת החיסון

55. פגוציטוזה
תהליך שבו תאים בולעים תאים אחרים או חלקיקי תאים או מיקרואורגמיזמים. רק תאים מסוימים בגוף מסוגלים לבצע פגוציטוזה: נויטרופילים, מונוציטים ומקרופאגים.
שלבים בפגוציטוזה:
חדירת החיידק לגוף
יצירת קשר בין החיידק לתא
החיידק מוקף על ידי התא
נוצרת בועית סביב החיידק
ליזוזומים (בועות שומן) מתאחים עם הבועית
עיכול החיידק השלם

56. מערכת הגנה ספציפית
מערכת החיסון מגיבה ספציפית נגד החומרים המפעילים אותה
חומרים המפעילים את תגובת מערכת החיסון נקראים אנטיגנים (חיידקים, נגיפים, ארס נחשים, ארס דבורים וחומרים סינטטיים רבים)
מערכת החיסון כוללת תאי דם לבנים, מערכת לימפתית (טחול, תימוס, מח עצם)

57. תאי B תת אוכלוסייה של לימפוציטים מוצאם מתאי גזע המוח במח העצם
מוצאם מתאי גזע המוח במח העצם
בתגובה לקישור אנטיגן לקולטן ספציפי המצוי בקרום התא שלהם, עוברים תהליך ריבוי והתמיינות
בסופו של תהליך זה מתקבלים תאי זיכרון ספציפיים לאנטיגן ותאי פלזמה (תאי פלזמה מייצרים נוגדנים)

58. תאי T מסיימים תהליך התמיינות בתימוס
האוכלוסייה איננה אחידה ונחלקת לשתי קבוצות Tc (תא ציטוטוקסי) ו- Th (תא מסייע)

59. המערכת הליפואידית
תפקידיה של המערכת הלימפואידית הם ייצור לימפוציטים, ספיגת שומנים ממערכת העיכול וסינון חלקיקים מיותרים, כולל חיידקים
המערכת הלימפואידית כוללת : תימוס, טחול, מח עצם פוליפים "שקדים", כלי לימפה: נוזל לימפה וקשרי לימפה

60. אנטיגן
חומרים המפעילים את תגובת מערכת החיסון נקראים אנטיגנים: חיידקים, נגיפים, ארס נחשים, ארס דבורים וחומרים סינטטיים רבים.

61. נוגדנים Antibodies חלבונים שנוצרים בתגובה לפלישת אנטיגן
פועלים בעיקר על אנטיגנים שנמצאים בנוזל הדם (כגון חיידקים, נגיפים בשלב חייהם החוץ תאי ורעלנים) בתגובת חיסון הומולרלית.

62. יחסי הגומלין בין אנטיגן מקרופאג ולימפוציטים
מקרופאג מרכז סביבו אנטיגנים
תאי T ותאי B קולטים את האנטיגנים
Th נצמד לתא B וגורם לשפעולו
תא B מייצר נוגדנים
סילוק האנטיגן על ידי הנוגדנים

63. סיכום

64. מניעה וריפוי
חסינות - מצב שבו אדם רוכש הגנה מיוחדת כלפי גורם מדבק מסוים - חיידק או נגיף.
חסינות זו תלויה בעיקר בגופיפים מיוחדים - נוגדנים המתגלים בדם לאחר הידבקות.
חסינות מלידה.

65. סוגי חיסונים חיסון פעיל.
מתן הנגיף (מוחלש או מומת) כדי לעורר את מערכת החיסון של האדם שאינו מחוסן ע”י מתן אנטיגן .
החיסון ניתן כשיש חשש שבעתיד יחשפו לנגיף - מונע מחלה .
יתרונות :
הגנה לטווח ארוך .
ניתן כנגד מחלות המהוות סכנת חיים .
חיסון סביל.
מתן נוגדנים מאדם מחוסן לאדם שאינו מחוסן .
החיסון ניתן לאדם שחלה ונתון בסכנה .
יתרונות :
הגנה מידית .
אין סכנה שיכיל מוטנטים אלימים .
ניתן כשיש חשש שיחשפו בעתיד , ואין חיסון פעיל יעיל (מזרח רחוק,צבא).

66. השוואה בין נגיף חי מוחלש לנגיף מומת
נגיף מומת.
מטפלים בנגיף בחומרים הפוגעים בכושרו של הנגיף להתרבות בגוף הפונדקאי .
הטיפול לא פוגע באותם חלבונים שמערכת החיסון מזהה , כלומר -נוצרים נוגדנים . יתרונות :
אין סכנה במוטנט אלים . חסרונות :
לא גורם לחיסון סביבתי של האוכלוסייה .
לא תמיד עובד , לא מעורר מספיק (פחות סיכויים למחלה להתפתח ).
ניתן באמצעות זריקה .
נגיף חי מוחלש.
איבד את כושרו לגרום למחלה .
מסוגל להדביק את הפונדקי ,להתרבות וליצור נוגדנים המגיבים .
במהלך ההתרבות מופרשים נגיפים בצואה .יתרונות :
גורם לחיסון סביבתי של האוכלוסייה .
יש סכנה במוטנט אלים .
ניתן דרך הפה .

67. השוואה בין נגיף חי מוחלש לנגיף מומת
נגיף מומת.
מטפלים בנגיף בחומרים הפוגעים בכושרו של הנגיף להתרבות בגוף הפונדקאי .
הטיפול לא פוגע באותם חלבונים שמערכת החיסון מזהה , כלומר -נוצרים נוגדנים . יתרונות :
אין סכנה במוטנט אלים . חסרונות :
לא גורם לחיסון סביבתי של האוכלוסייה .
לא תמיד עובד , לא מעורר מספיק (פחות סיכויים למחלה להתפתח ).
ניתן באמצעות זריקה .
נגיף חי מוחלש.
איבד את כושרו לגרום למחלה .
מסוגל להדביק את הפונדקי ,להתרבות וליצור נוגדנים המגיבים .
במהלך ההתרבות מופרשים נגיפים בצואה .יתרונות :
גורם לחיסון סביבתי של האוכלוסייה .
יש סכנה במוטנט אלים .
ניתן דרך הפה .

68. Endocytosis

69. Koch Postulates
Epidemiological association: the suspected cause must be strongly associated with the disease.
2. Isolation: the suspected pathogen can be isolated - and propagated - outside the host.
3. Transmission pathogenesis: transfer of the suspected pathogen to an uninfected host, man or animal, produces the disease in that host.

70. שלבים בהדבקת תא בנגיף HIV
מסלול ליזוגני (הוירוס מתון)
הוירוס נספח לתאי לרצפטור CD4 על גבי תאי Th
החומר התורשתי של הוירוס חודר לתא באנדוציטוזה
החומר הגנטי משתלב בגנום התא
התא אינו נהרס
הוירוס המתון מסוגל להפוך לאלים

71. 3 דרכי הדבקה ב-AIDS
מגע מיני
דרך הדם
מאם לילוד

72. וירמיה חדירה הדבקה של מספר מועט של לימפוציטים מסוג 4CD
תוך מספר שבועות – שכפול נגיפי עצום! (וירמיה)
באותו זמן – הרגשה רעה. וירמיה קשה ~6 שבועות
דעיכת וירמיה במשך 4-6 שבועות; זריעת ;HIV תגובה חיסונית
Latent period (חביון קליני)

73. השלבים הקליניים של זיהום

74. מגפות לאורך ההיסטוריה

75. עוצמת המגיפה והתפשטותה
מספר הנשאים
כמות הנשאים הפוטנציאלים שלא נדבקו
המהירות בה המחלה עוברת מנשא לאדם בריא (תלוי בעיקר בנגיף אך גם בתנאים סניטריים, מזג אוויר...)
ניידותם של הנשאים ממקום למקום (אל מול צפיפות האוכלוסים)
מספר המתים מהמחלה
כמות האנשים ששורדים את הזיהום ומתחסנים (אל מול מוטציות גנטיות של גורם המחלה)

76. מונחי יסוד
מונח אפידמיה (מגפה) מציין שכיחות גבוהה מן הרגיל של המחלה המסוימת.
מחלה אנדמית (endemic disease) היא מחלה שיש בה שכיחות גבוהה ומתמדת בחבל ארץ מסוים.
מחלה פנדמית (pandemic disease) היא מגפה בקנה מידה עולמי.

77. האפידמיולוגיה יכולה 5. לשלול גורמים שאינם גורמים למחלה.
6. הערכת טיפולים במחלות.
7. לתת הדרכה למשרדי בריאות הציבור וקביעת אסטרטגיות למניעת מחלות.

78. מחלת השפעת
בעצם, אנו קוראים למחלות רבות באותו שם בגלל התסמינים הזהים.

79. Influenza. Pathogenesis
Spread is by aerosols.
Primary infection involves the ciliated epithelial cells.
Necrosis of these cells results in the usual symptoms of the acute respiratory infection (fever, chills, muscular aching, headache, prostration, anorexia).

80. Influenza. Pathogenesis
Normally self-limited infection usually lasts 3-7 days (כולל החלמה).
Death from primary influenza infection is very rare and appears to be determined by host factors rather than 'virulence' of virus.
Damage to respiratory epithelium predisposes to secondary bacterial infections which accounts for most deaths.

81. אבולה HF – קדחת דימומית
Hemorrhagic fever

82. הנגיף הינו אחד משני ווירוסים חברי משפחת ווירוסי ה- RNA הקרויים filoviride (פילו-ווירידיי). הווירוס השני שזוהה כשייך למשפחה זו, הינו ווירוס מרבורג . שלושה מתוך ארבעה תת סוגי אבולה זוהו עד כה וגרמו למחלות בבני אדם, והם : "אבולה זאיר " , "אבולה סודן " ואבולה של חוף אייבורי" . תת הסוג הרביעי של הנגיף , "אבולה רסטון" אינו מדביק בני אדם, כי אם קופים בלבד.
אבולה זאיר , זוהה לראשונה בשנת 1976

83. מבנה הפילוווירוס : מבנה האבולה :
וירוסים ממשפחה זו יכולים להופיע במספר צורות , צורות אלו כוללות סליל ארוך , לפעמים מסועף בצורת 6 או האות U , או מעגל .אורכם יכול להגיע עד 140 אלף ננומטר וקוטר של 80 ננומטר . כל ויריון מכיל מולקולה אחת , חד גדילית של RNA .
ויריונים חדשים נוצרים ע"י בקיעה מהתא המאכסן .
מבנה האבולה :
ווירוס האבולה מכיל רנ"א חד גדילי שלילי , גנום הRNA , שלו , מכיל 7 גנים מבניים ומכוונים. האבולה מקודד 4 מבני וויריון שונים (VP30 VP35 נוקליאופרוטאין ופולימראז פרוטאין L ) , בנוסף ל 3 פרוטאינים הקשורים לממברנה , VP40 , גליקופרוטאין ו VP24 . גן ה- GP ממוקם רביעי מסוף הגן השלישי , מ7 הגנים הקווים .

84. מחלת שיתוק הילדים
Poliomyelitis

85. כיצד מתפתחת המחלה המחלה מאופיינת בעיקר בשיתוק גפיים אצל הילדים כלומר.
פגיעה במערכת העצבים המרכזית כתוצאה מהדבקות.
עצבים שנהרסים אינם יכולים לפעול ואינם יכולים להפעיל שרירים.
השרירים העיקרים שנפגעים הם רגליים וידיים.
האוכלוסייה העיקרית שנפגעת ממחלה זו- ילדים.

86. Hepatitis A Family Picornaviridae 1.Genus Enterovirus
Type Species poliovirus 1
2.Genus Rhinovirus
Type Species human rhinovirus 1A
3.Genus Hepatovirus
Type Species hepatitis A virus 1
4.Genus Cardiovirus
Type Species encephalomyocarditis viris
5.Genus Aphthovirus
Type Species foot-and-mouth disease virus
Hepatitis A

87. Hepatitis B
Hepatitis B virus is spread through body fluids, such as blood, semen, saliva and vaginal secretions.

88. Hepatitis B 12. Recirculation 14 Envelope acquiring 15 Exocytosis
Attachment
Uptake
Repair of (+) DNA strand
DNA translocation
(-) strand is transcribed
mRNAs transport
Pregenome translation to P
Pregenome translation to capsid protein
Packaging
RT to (-) DNA strand
12. Recirculation
14 Envelope acquiring 15 Exocytosis

89. Hepatitis C
Hepatitis C also spreads via body fluids. The most common routes of infection are sexual contact and using contaminated needles for intravenous drug abuse.

90. מחלות ויראליות בצמחים

91. השוואה בין נגיפים צמחיים לנגיפים אנימליים
הנגיפים הצמחיים והאנימליים שונים בצורתם ובגודלם.
הנגיפים הצמחיים והאנימליים דומים במבנה שלהם: חומצת גרעין בתוך קופסית חלבונית (רק למספר קטן של נגיפים צמחיים יש גם מעטפת).
קיים דמיון בין הנגיפים הצמחיים והאנימליים באופן ההתרבות בתוך תא המאכסן.

92. מבנה הנגיפים הצמחיים חומצת גרעין
- מעל 90% מנגיפי הצמחים הם נגיפי רנ"א. רובם בעלי רנ"א חד-גדילי ויתרם בעלי רנ"א דו-גדילי.
- לנגיפי צמחים רבים יש גנום מקוטע. כל אחד מהמקטעים נתון בקופסית נפרדת (בניגוד לנגיפים אנימליים בעלי גנום מקוטע).
- מספר הגנים בנגיפי צמחים נע מ- 1 (בנגיפים התלויים בנוכחות נגיף אחר באותו תא) ועד 12 גנים. רובם מקודדים ל- 7-4 חלבונים שונים.

93. דרכי העברה של נגיפים צמחיים
העברה מכאנית- קורית על-ידי העברה ישירה של נוזל התא (מוהל) מתא של צמח נגוע לצמח בריא. שכיחות נמוכה.
זרעים- בעיקר העברה מדור לדור, אולם לעתים העברה חיצונית באותו דור.
ריבוי וגטטיבי/ הרכבה- העברה בין דורית. שיטת רבוי פשוטה וזולה, אך קלה להתפשטות וירוסים.
וקטורים- חרקים, פטריות, נמטודות, אקריות, כנימות. העברה בין צמחים באותו דור.

94. Mechanisms of Survival of Viruses in Nature
Transmissibility: related to virion release from the patient and quantity
Seasonality: affects the survival of viruses
Community size: determines if acute or persistence infections are perpetuated
Effects of immunity types
Antigenic drift, shift and reassortment 

95. הישרדות נגיף פוליו
נגיף הפוליו שורד חוץ מפונדקאי (אפילו בביוב) חדשים ושנים.
הישרדות הרפס סימפלקס-1
נגיף ההרפס מסוג 1 שייך לנגיפי העור.
ההדבקות הראשונית בנגיף מתרחשת בדר”כ בילדות במגע עורי.
סימפטומים: הפצעים/אבעבועות מתפתחים בדר”כ בשפתיים ועוברים כאשר הזיהום עובר.
נגיף ההרפס לא שורד בחוץ זמן רב; אפילו בתנאי מעבדה לא יותר מכמה שעות.

96. תרומת הנגיפים לביולוגיה מולקולרית
בצד העניין שלנו בנגיפים גורמי מחלות, ראוי להדגיש שלחקר הנגיפים היה, ויש, חלק נכבד בפענוח תהליכים ביולוגיים בסיסיים, ובכללם מנגנוני התורשה בכל היצורים החיים, וכן בהנדסה הגנטית.
נגיפי החיידקים – הבקטריופאז'ים – היו היצורים הראשונים שבהם נקבע הרצף המדויק של כל הנוקלאוטידים המרכיבים את מלוא הגנום של יצור חי.

97. היסטוריה - TMV
הווירולוג פרנקל-קונרט חקר במשך שנים את מבנהו הכימי של נגיף המוזאיקה של הטבק, והוכיח, שחומצת הגרעין היא הקובעת את התכונות התורשתיות.
בשנת 1954 פרנקל-קונרט השתמש בידע הקיים במטרה לברר מהו הגורם הקובע את התכונות התורשתיות- החלבון או חומצת הגרעין?
מהלך הניסוי:
פרנקל-קונרט לקח שני זנים שונים של TMV (א ו- ב), שכל אחד מהם גורם לנזקים נראים לעין האופייניים רק לו.
מכל זן הכין שני תרחיפים, חלבון לחוד ורנ”א לחוד.

98. הסטוריה - TMV
ערבב את הרנ”א של זן א עם החלבון של זן ב, ואת הרנ”א של זן ב עם החלבון של זן א.
פרנקל-קונרט הדביק צמחי טבק בנגיפים המשוחזרים שיצר, ועקב אחרי התפתחות הנזקים האופייניים.
תוצאות:
נגיף מדביק משוחזר הרכב הצאצאים טיב הנזק
רנ”א א+ חלבון ב רנ”א א+ חלבון א אופייני לזן א
רנ”א ב+ חלבון א רנ”א ב+ חלבון ב אופייני לזן ב

99. מחלות סרטן הנגרמות על ידי נגיפים

100. Cancer סרטן
סרטן-) Cancer ממאירות( שם כולל לקבוצה של כ מחלות, המאופיינות:
בגידול ובהתפשטות בלתי מבוקרים של תאים
ביכולת לפלוש ולהזיק לרקמה נורמלית באותו אזור או באתר מרוחק יותר בגוף

101. תאים מותמרים לעומת תאים נורמליים
תאים כדוריים שבורים
אורינטציה אקראית
ממברנה צמיגה פחות מתא נורמלי
שטח פנים נושא קולטנים אנטיגנים שאינם מצויים על פני התא
תאים נורמליים
תאים בעלי צורה האופינית הרגילה לסוג התא
אורינטציה קבועה
ממברנה צמיגה יותר מתא סרטני
שטח פנים נושא קולטנים אנטיגנים שמצויים על פני התא

102. P53

104. שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
1.הנגיפים משתייכים ל:
א. אאוקריוטים
ב. פרוקריוטים
ג. מיקרואורגניזמים
ד. אף אחת מהתשובות איננה נכונה
2. תהליך השיעתוק והתרגום הנפוץ בעולם החי:
א.חלבון ----->רנ"א--->דנ"א
ב. דנ"א ----->רנ"א--->חלבון
ג. רנ:א ----->דנ"א--->רנ"א---->חלבון
ד. רנ"א ----->דנ"א--->חלבון

105. שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
3. במחלת החזרת :
א. דרכי החדירה: מערכת העיכול ; איבר המטרה: מערכת העיכול
ב. דרכי החדירה: מערכת הנשימה; איבר המטרה: שרירי הלסת
ג. דרכי החדירה: מערכת הנשימה; איבר המטרה: מערכת העיכול
ד. דרכי החדירה: מערכת העיכול ; איבר המטרה: מערכת הנשימה

106. שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
4. תאי TH (תאי T מסייעים) מסייעים ל:
א. לתאי T ציטוטוקסים להרוס אנטיגנים
ב.לתאי B לייצר נוגדנים
ג. לתאי B לזהות את האנטיגן (על מנת שיוכל לייצר נוגדנים)
ד. לנגיף הפולש לחדור לתא
5. שיטת סווג הנגיפים הנהוגה כיום:
א. לפי הפונדקאי
ב. לפי המבנה המורפולוגי
ג. לפי החומר התורשתי
ד. ב+ג נכונות

107. שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
5.ההבדל בין נגיפים צמחיים לנגיפים אנימליים:
א. לנגיפים צמחיים אין מעטפת
ב. לנגיפים צמחיים יש גנים מחולק (כל מקטע נתון בקופסית נפרדת)
ג. בנגיפים צמחיים החומר התורשתי הוא רנ"א
ד. כל התשובות הנן נכונות

108. שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
שאלות לדוגמה קורס עולם הנגיפים
6.איזה נגיף מאלה הוא נגיף דנ"א:
הפטיטיס A
הפטיטיס B
הפטיטיס C
הפטיטיס D
אף אחד