1. Poslijediplomski studij TRIBE Split, svibanj 2012.
Pronalaženje informacija: baze podataka i strategija njihova pretraživanja
Poslijediplomski studij TRIBE
Split, svibanj 2012.

2. Pretraživanje informacija na internetu
Opći pretraživači
Yahoo
Google
Specijalizirani pretraživači i portali
Google Scholar
Health on the Net
PlivaMedNet

3. BMJ http://bmj.com/ CMJ http://www.cmj.hr
Elektronički časopisi
BMJ
CMJ
Slobodno dostupni časopisi
Bibliografske baze podataka
MEDLINE/PubMed
Current Contents
Web of Science (WoS)
Scopus
Medicinske knjižnice

5. Objavljivanje - završna faza istraživanja
Objavljivanje rezultata znanstvenog istraživanja - stožerno značenje u širenju znanja.
Znanstveni rad poštuje niz pravila i uputa kako bi se tijek istraživanja i njegovi rezultati mogli shvatiti, provjeriti i uporabiti u daljnjim istraživanjima, a sve u svrhu povećavanja znanstvenog znanja.
Pronalaženje izvornih radova potrebnih za daljnji rad važna je zadaća svakog znanstvenika.

6. Znanstvena produktivnost
Sindrom “objavi ili nestani” (publish or perish) - akademska i profesionalna promocija
Po nekim procjenama broj radova raste godišnje po stopi od 10%, a svake se godine u području biomedicine pojavi novih časopisnih naslova.

7. Rast broja medicinskih časopisa
Stoljeće/godina
Broj časopisa
17. 10
18.
436
19.
1 147
1961.
~ 6 000
2000. ~

8. Gdje smo danas?
Znanstveni časopis još uvijek ima središnju ulogu u priopćavanju novih rezultata.
Većina časopisa ima elektroničke inačice.
Mrežni arhivi medicinskih časopisa i članaka
Open access
OA medicinski časopisi
Open Choice (Springer)
Pohrana rukopisa (NIH Public Access Policy)
Institucijski repozitoriji

9. Baze podataka
Osnovne značajke

10. Što su baze podataka? Organizirane zbirke podataka
Svaka se baza podataka sastoji od zapisa
Zapisi sadrže određena polja s točno određenim podatcima
Svako polje ima:
Nepromjenjivi naziv (npr. Authors)
Promjenjivi sadržaj (npr. Tomic S, Markotic A…)
Neka polja nose različite nazive u različitim bazama iako im je sadržaj isti

11. Primjeri strukture zapisa
Current Contents
MEDLINE/ PubMed
Web of Science

15. Kako nastaju?
Baze podataka izrađuju strukovna udruženja, knjižnice, profitne i neprofitne udruge…
Stvaraju ih stotine stručnjaka različitih profila:
Knjižničari – definiraju strukturu baze podataka kako bi bili uključeni svi potrebni elementi koji opisuju rad
Računalni stručnjaci – izrađuju bazu i sučelja te brinu o tehničkoj podršci
Indekseri – radovima pridodaju ključne riječi kojima opisuju sadržaj

16. Vrste baza podataka Osnovne vrste su: Bibliografske baze podataka
Citatne baze podataka
Baze podataka s cjelovitim tekstom
Postoje i druge (npr. tekstualno-numeričke), ali su tri navedene najvažnije za pronalaženje podataka o izvornim znanstvenim radovima
Mnoge baze podataka su kombinacija dviju ili više osnovnih vrsta

17. Bibliografske baze podataka
Temeljni sekundarni izvor podataka
Sadrže osnovne podatke o primarnim izvorima (objavljenim radovima): autor/i, naslov rada, naslov časopisa, godina/svezak/stranice, naziv ustanove i sl., ključne riječi, sažetak…
Razlikuju se prema znanstvenim područjima koja obuhvaćaju, broju časopisa, knjiga i drugih publikacija koje obrađuju, strukturi i opsegu bibliografskoga zapisa (neke baze opisuju svaki rad s desetak polja, a neke s tridesetak i više) te dodatnoj obradi (predmetnice)
Služe za stjecanje uvida u određeno znanstveno područje

18. Najvažnije bibliografske baze u području medicine
MEDLINE
EMBASE
Current Contents
Clinical Medicine
Life Sciences
PsycINFO
CINAHL

19. Citatne baze podataka
Pored osnovne strukture bibliografskih baza podataka one dodatno obrađuju popise korištene literature i prate citiranost radova unutar skupine publikacija koje obrađuju
Daju odgovor na pitanje koliko je puta citiran neki rad ili neki autor
Ne bilježe razliku između pozitivnih i negativnih citata
Tek je u novije vrijeme moguće razlikovati samocitate
Koriste se za stjecanje uvida u određeno znanstveno područje i za praćenje odjeka određenoga rada ili autora unutar znanstvenoga područja

20. Dostupne citatne baze Web of Science Scopus Google Scholar
Sve do godine jedina citatna baza
Scopus
Elsevier je objavljuje godine
Google Scholar
Googleova tražilica lansirana također godine
Prati citiranost radova unutar izvora koje pretražuje

21. Baze podataka s cjelovitim tekstom
Najčešće su to zbirke elektroničkih časopisa jednoga ili više izdavača
U pravilu sadrže i bibliografski opis svakoga rada
Potpuni tekst rada obično je dostupan u dva osnovna formata: HTML i PDF
HTML omogućuje laku navigaciju unutar samoga rada, hipertekstualne veze između pojedinih dijelova, povezivanje literaturnih navoda u samome tekstu s njihovim popisom na kraju itd.
PDF preslikava izgled rada iz tiskane inačice publikacije i stoga je pogodniji za pohranjivanje i tiskanje

22. Dostupne baze cjelovitoga teksta
ScienceDirect
Zbirka elektroničkih časopisa jednoga od najvećih izdavača znanstvenih časopisa Elseviera
Dostupan nam je samo dio časopisa, a ne svi i to najčešće od godine
Academic Search Complete
Zbirka od oko 7900 časopisa različitih izdavača; dostupna preko sučelja EBSCOhost
Core Biomedical Collection
Časopisi različitih izdavača; sučelje OvidSP
CINAHL with Full Text
Sučelje EBSCOhost
The Cochrane Database of Systematic Reviews
Sučelje OvidSP

23. Centar za online baze podataka
Kako pristupiti?
Centar za online baze podataka

25. Mogućnosti pristupa
S računala iz mreže ustanove koja je unutar sustava znanosti i visokoga školstva (unutar CARNetove mreže)
S bilo kojeg računala preko proxy servera za sve korisnike koji imaju elektronički identitet u sustavu
Preko CARNetovih modemskih ulaza
S bilo kojeg računala za ustanove članice biomedicinskoga konzorcija za dio baza dostupnih preko Ovida (potrebna lozinka)

26. Osnovne baze podataka
Pregled

27. Što je MEDLINE? Najveća i najpoznatija medicinska baza podataka
MEDLINE obuhvaća:
medicinu
stomatologiju
veterinarske znanosti
sestrinstvo
biološke znanosti
Dostupna nam je preko četiri različita sučelja:
OvidSP
Web of Knowledge
EBSCOhost
PubMed

28. Osnovni podatci
Stvara je i održava: National Library of Medicine, Washington, DC.
Pokriva razdoblje od 1940-ih do danas
Sažetke sadržava >75% uključenih bibliografskih zapisa
Obuhvaća časopise iz oko 80 zemalja (oko 50% iz
SAD-a) na 30-ak jezika
Indeksira oko časopisa
Trenutno ima oko 21 milijun zapisa
10 hrvatskih časopisa
Dnevno ažuriranje

29. PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
Servis koji pored baze MEDLINE sadrži i dodatne zapise iz bioloških časopisa zastupljenih u arhivu PubMedCentral
Poveznice s arhivom PubMed Central (PMC), OA časopisima i pretplaćenim časopisima na mrežnim sjedištima agregatora ili izdavača
Javno dostupan

32. MeSH - Medical Subject Headings
Kontrolirani rječnik (tezaurus) koji se koristi za indeksiranje i pretraživanje biomedicinske literature
Preko deskriptora (organizirani abecedno i hijerarhijski)
Glavne predmetnice (headings) i potpredmetnice (subheadings)
Javno, online dostupan MeSH Browser na adresi

33. Current Contents
Thomson Reuters, ranije Institute for Scientific Information (ISI)
Indeksira sadržaje oko znanstvenih časopisa i drugih publikacija
Dostupan preko dva sučelja:
OvidSP (
Web of Knowledge (
Većina članaka uključuje i autorske sažetke na engleskom jeziku
Dostupni podatci od druge polovice godine do danas (Ovid)
Baza se ažurira jednom tjedno

35. Web of Science (WoS) http://www.isiknowledge.com
Multidisciplinarna baza
Obuhvaća razdoblje od godine do danas
Indeksira preko najutjecajnijih znanstvenih časopisa
General Search – pretraživanje po zapisima
Cited Reference Search – pretraživanje po citatima
Pruža uvid u literaturu koja je prethodila objavljivanju rada i uvid u utjecaj toga rada na daljnja istraživanja
Časopisima koji su indeksirani u WoS-u, na temelju citiranosti objavljenih članaka, izračunava se svake godine čimbenik utjecaja (impact factor) u bazi
Journal Citation Reports

38. Web of Science sadrži Tri citatna indeksa:
Science Citation Index Expanded (SCIex)
Indeksira oko časopisa iz različitih znanstvenih područja
Social Sciences Citation Index (SSCI)
Indeksira oko časopisa s područja društvenih znanosti
Arts & Humanities Citation Index (AHCI)
Pokriva oko časopisa s područja humanističkih znanosti i umjetnosti

39. Journal Citation Reports
Sadrži čimbenike utjecaja (impact factore) časopisa koji su indeksirani u WoS-u.
Čimbenik utjecaja je omjer između broja citata koje su radovi u nekom časopisu dobili u toj godini i broja radova objavljenih u tom časopisu u prethodne dvije godine.
Ima dva izdanja:
JCR Science Edition
JCR Social Sciences Edition

40. Scopus http://www.scopus.com
Bibliografska baza nizozemskog izdavača Elseviera
Obuhvaća područja prirodnih, tehničkih, medicinskih i društvenih znanosti
Bibliografski zapisi imaju sažetke (od god.)
Svaki bibliografski zapis ima pretraživ popis literature (od god.)
Prati citiranost radova unutar baze
100 % MEDLINE, 100 % EMBASE

41. Što sve Scopus indeksira?
Različite vrste publikacija
Oko aktivnih naslova, izdavača
znanstvenih časopisa
300 zbornika skupova i sl.
400 publikacija tvrtki
Časopisi iz različitih zemalja
Više od 50% iz Europe, Afrike i s Bliskog istoka
Najveći broj hrvatskih časopisa indeksiran je upravo u Scopusu
Ukupno oko 47 milijuna zapisa

44. Medicina utemeljena na dokazima
Kritička primjena najboljega mogućeg dokaza

45. Klinička praksa utemeljena na dokazima: povezivanje osobnoga iskustva i sustava vrijednosti liječnika i bolesnika s najboljim mogućim dokazom iz medicinske literature
Pet koraka:
1. Postavljanje kliničkoga pitanja (oblikovanje problema)
2. Traženje dokaza
3. Kritička prosudba valjanosti i relevantnosti dokaza
4. Klinička primjena dokaza
(donošenje odluke, integriranje dokaza s kliničkim iskustvom i bolesnikovim osobnim vrijednostima)
5. Vrjednovanje rezultata

46. Postavljanje kliničkoga pitanja
Potrebu za informacijom treba pretvoriti u pitanje na koje se može naći odgovor
Pitanje mora biti specifično i ciljano
Dobro postavljeno pitanje ima 4 elementa
(tzv. model PICO)
Dva dodatna elementa dobro postavljenog pitanja uključuju:
vrstu pitanja (terapija, dijagnoza, etiologija, prognoza, prevencija, troškovi)
vrstu studije (npr. RCT, meta-analiza i sl.)

47. Model PICO Patient Intervention Comparison Outcome
Za kojega bolesnika, populaciju ili problem se traži informacija?
Intervention
O kojoj se medicinskoj intervenciji radi?
Comparison
Postoji li alternativna intervencija?
Outcome
Kakav je učinak intervencije?

48. Klinički scenarij
65-godišnji bolesnik oporavlja se od posljedica moždanoga udara. Ultrazvučno mu je potvrđeno blago suženje lijeve karotidne arterije.
Bi li uvođenje acetil-salicilne kiseline trebalo smanjiti rizik od pojave ponovnog moždanog udara?

49. Vrsta istraživanja: Ustroj istraživanja: Koncepti:
liječenje/prevencija
Ustroj istraživanja:
RCT/sustavni pregledni članak
Koncepti:
moždani udar
acetil-salicilna kiselina (aspirin)
Sustavni pregledni članci ili randomizirane kontrolirane studije

50. P Bolesnik: muškarac u dobi od 65 godina s moždanim udarom
I Intervencija: acetil-salicilna kiselina
C Usporedna intervencija: placebo
O Ishod: prevencija ponovljenog moždanog udara
Pitanje: Može li primjena acetil-salicilne kiseline u 65-godišnjeg muškarca koji je doživio jedan moždani udar smanjiti vjerojatnost pojave ponovljenog moždanog udara?

51. Postupak traženja izvora/dokaza
U svakodnevnoj liječničkoj praksi pronalaženje dokaza treba biti brzo i učinkovito
Različiti EBM izvori:
baze podataka (sustavni pregledi, strukturirani sažetci), časopisi, smjernice...
Odabir izvora ovisi o naravi kliničkoga pitanja i raspoloživome vremenu
Početi s izvorima koji sadržavaju već probrane podatke u sažetome obliku

52. The Cochrane Library
The Cochrane Collaboration (
Međunarodna neprofitna organizacija koja izrađuje, objavljuje i održava sustavne preglede (systematic reviews) o učincima intervencija u zdravstvu
Cochrane knjižnica je dostupna hrvatskoj akademskoj zajednici i zdravstvenim ustanovama preko Ovidovog sučelja (
Ostali je mogu pretraživati do razine sažetaka na adresi

53. Što sadrži Cochrane knjižnica?
Cochrane knjižnica sadrži različite baze podataka, najvažnije su:
The Cochrane Database of Systematic Reviews
sustavni pregledni članci i protokoli za članke koji su u postupku izrade
najbolji izvor podataka o učinkovitosti terapije
Database of Abstracts of Reviews of Effects (DARE)
strukturirani sažetci kvalitativno procijenjenih sustavnih pregleda koji nisu izrađeni u okviru Cochrane kolaboracije
The Cochrane Central Register of Controlled Trials (CENTRAL)
nezaobilazan izvor randomiziranih kontroliranih pokusa koji se preuzimaju iz različitih baza (MEDLINE, EMBASE…) ili su pronađeni ručnim pretraživanjem literature

54. Clinical Evidence – BMJ Publishing Group(
Pokriva više od 160 tema i nudi odgovor na preko 800 kliničkih pitanja
Evidence Based On-Call (
CAT (Critically appraised topic) - strukturirani sažetci izvornih znanstvenih radova objavljenih u medicinskim časopisima uz kritičku prosudbu
Vodiči kroz postupke
Pristup slobodan

55. PubMed Clinical Queries
Sadrži tri filtera:
Clinical Study Categories (terapija, dijagnoza, etiologija…; široko ili fokusirano pretraživanje)
Systematic Reviews (sustavni pregledi, meta-analize, smjernice…)
Medical Genetics
pristup besplatan

56. EBM časopisi
Strukturirani sažetci izabranih članaka uz komentar o vrijednosti pronađenih dokaza za kliničku praksu
Analiziraju najbolje kliničke časopise
ACP Journal Club
Evidence-Based Medicine
Evidence-Based Mental Health
Evidence-Based Oncology
Evidence-Based Cardiovascular Medicine
Bandolier
...

57. Info-sustavi (portali, metapretraživači, agregatori...)
SUMSearch (
Istovremeno pretražuje različite medicinske izvore (DARE, Medline, National Guideline Clearinghouse), pristup slobodan
TRIPDatabase (
Pretražuje veliki broj EBM-izvora, pristup slobodan
UpToDate (
Komercijalni servis koji daje odgovore na klinička pitanja

58. Smjernice Daju putokaz kako informaciju primijeniti u praksi
Izrađuju ih službena tijela, npr. vladine agencije, medicinska udruženja…
Kombinacija dokaza iz sustavnih pregleda i mišljenje stručnjaka za određeno područje

59. Izvori za smjernice
National Guideline Clearinghouse NGC
Agency for Health Care Research and Quality, AHRQ
National Institute for Clinical Excellence NICE

60. Koji izvor odabrati?
Mogući izbor za klinička pitanja o učinkovitosti intervencija:
The Cochrane Database of Systematic Reviews 
Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness (DARE)
PubMed Clinical Queries
TRIP Database, SUMSearch
PubMed/MEDLINE

61. Druge vrste kliničkih pitanja
Jedan od mogućih izbora:
PubMed Clinical Queries
TRIP Database
SUMSearch 
PubMed/MEDLINE

62. Pitanje Ustroj istraživanja
Dijagnoza Presječno istraživanje
Prognoza Kohortno istraživanje
Etiologija Kohortno istraživanje
Istraživanje parova
Liječenje Randomizirani kontrolirani pokus (RCT)
Kohortno istraživanje
Iskustva bolesnika Kvalitativna istraživanja