1. strokovni obisk učnih laboratorijev v Veliki Britaniji
Marko Dolinar, marec 2002
namen:
spoznati potek vaj iz tehnologije rDNA
videti opremljenost učnih laboratorijev
ugotoviti tematski koncept vaj
preveriti obseg pisnih gradiv za študente
spoznati način ocenjevanja praktičnega pouka
obiska:
Univ. of Newcastle (R. Pain / R. Virden)
Univ. of Manchester (K. Elliott)
praktični vaji:
Analiza izolatov HIV: ugotavljanje izvora infekcije (predmet Filogenija in evolucija)
Izolacija ssDNA vektorja M13; analiza PCR (predmet Genetsko inženirstvo)

2. University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics
študijske smeri:
biokemija
genetika
molekularna biologija
humana genetika
biokemija z imunologijo
biokemija z biotehnologijo
vpisani študenti:
biokemija ~50 v 3 letnikih
genetika ~90 v 3 letnikih
Molekularna biologija:
2. letnik, 30 kreditnih točk
Genetsko inženirstvo:
ni posebnega predmeta
osnove predavajo pri predmetu Genetika v 1. letniku, več pa pri predmetu Molekularna biologija v 2. letniku (14 predavanj od 30)

3. University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics
V začetku vsakega semestra študenti dobijo brošuro z opisi predavanj, vsemi navodili za vaje in splošnimi informacijami.
Poglavja v brošuri:
predmetnik
cilji študija po letnikih
navodila in pravila - roki za oddajo pisnih gradiv - naslovnice za pisna poročila in eseje - navodila za pripravo poročil z vaj - kriteriji za ocenjevanje esejev
študijski koledar
študijsko gradivo po predmetih
Ob vpisu v prvi letnik dobijo še:
Študijski priročnik (pravila in navodila za vsa 3 leta študija) priročnik Študijske veščine brošuro Informacije o laboratorijih in varnosti

4. University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics
biokemija -1. letnik - 6 dvojnih modulov:
biokemija
delovanje celice
biološke molekule in celična biologija
genetika
mikrobiologija
fiziologija ali farmakologija
biokemija -2. letnik:
molekularna biologija (nukl. kisline, genetsko inženirstvo, zgradba proteinov, laboratorijska in računalniška orodja)
celična organizacija (proteini in encimi, razmeščanje proteinov, biološke membrane)
bioenergetika in fotosinteza
kontrolni mehanizmi v celici (30 t.)
osnove imunologije ali sinteza in popravljanje DNA
vsi: + veščine (10 t. v 2 semestrih):
1. letnik: informacijske tehnologije ( , Word, internet, knjižnice)
2. letnik: biokemijsko računstvo, tabele in statistika, ustno poročanje, delo v skupini

5. University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics
biokemija -3. letnik:
proteinsko inženirstvo (10 t.)
združena biokemija (20 t.)
raziskovalni projekt (30 t.)
mehanizmi kataliznega delovanja encimov (10 t.)
+5 izbirnih predmetov izmed:
kontrolne poti v celici; (2002/3) biokemija bolezni interakcije med proteini in DNA molekularna biologija virusov imunsko prepoznavanje biotehnologija rak in genska terapija
‘raziskovalni projekt’ ~ diplomsko delo
skupaj formalno obremenitev, ki ustreza 30 delovnim dnem; običajno 8 tednov v laboratoriju ali po zahtevnosti ustrezno teoretično raziskovalno delo
opravljajo večinoma v raziskovalnih laboratorijih na oddelku v februarju in marcu, pišejo med velikonočnimi počitnicami in takoj oddajo

6. University of Newcastle-upon-Tyne Department of Biochemistry and Molecular Genetics
Molekularna biologija (2. letnik):
teoretični del: 30 predavanj (posamezni predavatelj 1-10)
seminarji: 4
problemska naloga z ustno predstavitvijo (skupine po 4, predstavitve po 15 minut, 5% končne ocene)
2 testa za utrjevanje snovi (vsak 5% končne ocene)
vaje (6 x 6 ur, poročila skupaj 15% ocene) Seminarji, praktično delo in testi skupaj prispevajo 30% končne ocene iz predmeta.
Laboratorijske vaje: - ekstrakcija kromosomske DNA iz rastlin - analiza rekombinantnega plazmida - PCR - sekvenciranje DNA - transkripcijski faktorji in regulacija genov - bioinformatika
Problemska naloga: Iskanje novega senzorja za kovine pri modri algi Synechocystis na osnovi določenega nukleotidnega zaporedja genoma
Seminarji: - uvod v spletne vire za praktično delo - uvod v temo problemske naloge - diskusijski seminar v zvezi s problemsko nalogo - kloniranje

7. University of Manchester School of Biological Sciences
študijske smeri (20):
biokemija
genetika
molekularna biologija
humana genetika
biokemija z biotehnologijo, znanosti o življenju, medicinska biokemija, biomedicina
anatomija, biologija, celična biologija, mikrobiologija, nevrologija, farmakologija, fiziologija, botanika, zoologija,...
vpisani študenti:
skupaj ~2000 v 3 letnikih
Molekularna biologija:
obvezni predmet 1. letnika za vse smeri (10 kred. točk)
Genetsko inženirstvo:
obvezni predmet v 2. letniku za 4 smeri, za biokemijo eden od izbirnih obveznih (10 kred. točk)

8. University of Manchester School of Biological Sciences
Ob vpisu v vsak letnik študenti dobijo brošuro s splošnimi informacijami.
Za vsak predmet dobijo še brošuro z opisom predmeta in brošuro z navodili za praktično delo, seminarje, ipd.
Poglavja v vpisni brošuri:
vpis
šolska uprava
cilji študija
vodje študijev in mentorji (z zemljevidom stavbe)
študentska pisarna
komisije, odbori in ocenjevanje učiteljev
pravila - prisotnost in delo - izpiti in ocenjevanje - postopki pri boleznih - varnost in zdravje - službe in nagrade - knjižnica - študentska združenja in pomoč študentom študijski koledar
predmetnik po smereh
pogoji za vpis predmetov višjih letnikov
vsebina posameznih predmetov (po 1 stran)

9. University of Manchester School of Biological Sciences
biokemija -1. letnik :
molekularna biologija
genetika
anorganska in fizikalna kemija
organska kemija
biokemija
celica
praktična biomatematika
fizikalna kemija
+ izbirni predmeti (skupaj 4 izmed 10)
+ mentorski seminar: osnove računalništva in informacijskih tehnologij; pisanje esejev, reševanje problemov, diskusijske skupine, ustno poročanje, skupinsko delo
praviloma 1 predmet = 10 kreditnih točk (100 ur študija)
1 letnik = 120 kreditnih točk (ustreza 30 tednom s po 5x8 h dela)
1 predmet = 24 predavanj po 50 min. + 5 vaj po 3 h
povprečna obremenitev s predavanji: 10 h/teden
povprečna obremenitev z vajami: do 9 h/teden
1 semester = 12 tednov; vaj ni 1. in 12. teden
izpitna obdobja: zimski semester 3. in 4. teden januarja poletni semester: zadnji 3 tedni v maju popravljalni termin: zadnji teden avgusta, 1. teden septembra

10. University of Manchester School of Biological Sciences
biokemija - 2. letnik :
biosinteza, pretvorbe in kontrola metabolizma
biofizikalna karakterizacija makromolekul
membrane, transport in bioenergetika
2 od naslednjih: ohranjanje in mobilnost genov izražanje genov genetsko inženirstvo
+ izbirni predmeti (skupaj 5 izmed 9 priporočenih)
+ mentorski seminar: pisanje esejev, reševanje problemov, diskusijske skupine, ustno poročanje, svetovanje o zaposlitvi, priprava življenjepisa
biokemija - 3. letnik :
3 od naslednjih: zgradba in delovanje bioloških makromolekul znotrajcelično sortiranje proteinov in biogeneza organel celično signaliziranje bioinformatika in zgradba/delovanje proteinov glikobiologija molekularna biologija raka
+ izbirni predmeti (skupaj 3 izmed 17 priporočenih)
+ biokemijski praktikum (10 vaj)
+ dizertacija iz literature ( besed; 10 kred. točk)
+ projektna naloga (30 dni; 7500 besed)

11. University of Manchester School of Biological Sciences
Molekularna biologija (1. letnik):
teoretični del: 24 predavanj (3 predavatelji)
vaje (4 x 6 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene)
- transformacija E. coli - fagna restrikcija pri E. coli - laktozni operon - restrikcijsko mapiranje plazmidov
Izražanje genov (2. letnik):
teoretični del: 24 predavanj (2 predavatelja)
- laktozni operon - namestitev nukleosoma na evkariontski DNA - izolacija in analiza RNA (2 vaji)
Ohranjanje in mobilnost genov (2. letnik):
teoretični del: 24 predavanj (1 predavatelj)
- določanje biosintezne poti Trp pri S. typhimurium z uporabo mutant - testi reverzne mutacije in delecijsko mapiranje mutant His- pri S. typhimurium - transformacija Streptococcus gordonii za uvedbo rezistence na antibiotik in določanje genske povezanosti - prenos konjugativnih plazmidov in mobilizacija nekonjugativnih plazmidov pri E. coli

12. University of Manchester School of Biological Sciences
Genetsko inženirstvo (2. letnik):
teoretični del: 24 predavanj (2 predavatelja): - klonirni vektorji in življenjski cikli - PCR - priprava in presejanje knjižnic - mutageneza in vitro - kloniranje v glivah in rastlinah - genomski projekti - multigenske okvare - elektroforeza v utripajočem polju - kloniranje preko lokusov in identifikacija genov - prenos genov pri živalih - gensko ciljanje pri živalih - genska terapija
vaje: 4 x 5 ur, kolokvij 20% končne skupne ocene - mestno-specifična mutageneza - PCR - življenjski cikel faga M13 - sekvenciranje DNA
Vaje se delno prekrivajo po dnevih. 3. dan: izolacija ssDNA (M13) analiza PCR s prejšnje vaje (elektroforeza) teoretična naloga: načrtovanje začetnih oligonukleotidov za detekcijo genskih napak pred vajo: infekcija bakterij s fagom

13. Gradiva, ki sem jih prinesel:
Newcastle:
Informacije o laboratorijih in varnosti
Brošura za 3. semester študija biokemije
kopije prosojnic Genetsko inženirstvo (1. let., Genetika)
navodila za vajo Newickova formula: distančne in diskretne metode (2. let., Filogenija in evolucija)
Manchester:
vpisne brošure za 1., 2. in 3. letnik
skripta za predmet Ohranjanje in mobilnost genov
skripta za vaje iz Ohranjanja in mobilnosti genov
skripta za vaje iz Genetskega inženirstva
skripta za vaje iz Molekularne biologije
skripta za vaje iz Genskega izražanja

14. Opažanja in predlogi:
Na voljo je samo po en izpitni rok pri vsakem predmetu z možnostjo popravljanja v jesenskem roku.
Varnost je poudarjena v skriptah in v praksi, čeprav npr. zaščitna očala uporabljajo samo takrat, ko delajo z nevarnimi snovmi, ki lahko poškodujejo oči. Halje se zapenjajo s pritiskači in imajo elastično manšeto.
V laboratorijih je ob umivalniku posoda z absorpcijskimi zrni za primer razlitja. Pipo odpiramo z nogo, ne z roko. Vsak laboratorij ima več izhodov.
Vsa študijska gradiva so brezplačna. Intranet ima veliko podatkov, ki pomagajo k bolj učinkovitemu študiju. Računalniških delovnih mest za študente je proporcionalno mnogo več kot na FKKT.
Vaje se ocenjujejo na osnovi poročil ALI kolokvija. Vsak predmet ima samo eno oceno (vaje + predavanja).
Predmet je opravljen s 40% znanjem, za najvišjo oceno zadošča 70% znanje; kriteriji so vnaprej znani, med predmeti izenačeni in objavljeni.
Čas med vajami, ko tečejo analize ali inkubacije, zapolnijo z reševanjem nalog; reagentov praviloma ne pripravljajo študenti.
Pričakovana prisotnost študentov v predavalnici/vajalnici je 2 x 12 x 18 h = 430 h v enem letu (FKKT: do 750 h), študij je za 2 leti krajši.
Vaje so manj obsežne in večinoma dobro delujejo kljub velikim skupinam študentov.