1. Biostatistika: uvodna razmatranja
listopad, 2004.
Biostatistika: uvodna razmatranja
poslijediplomski studij “Medicinska biokemija”
Farmaceutsko-biokemijski
fakultet u Zagrebu
Prof. dr. sc. Mladen Petrovečki
Katedra za informatiku Medicinski fakultet, Rijeka
Zavod za laboratorijsku dijagnostiku KB Dubrava, Zagreb

2. Ovo predavanje... MS PowerPoint 500 KB listopad 2004. – pps
na adresi: mi.medri.hr (E-prilozi  predavanja)

3. Program MedCalc computer program for statistic in biomedicine
Copyright, Medcalc Software Mariakerke, Belgija

4. Program – postavljanje:
otvoriti mapu “C:\MCWin”
preslikavanje svih podataka sa diskete u zadanu mapu
otvoriti mapu
pokrenuti program “Install”
po završetku pokrenuti program “MedCalc”

5. Program

6. Nastava dan datum vrijeme šk. sati
ponedjeljak – 1715 h 3 P –
utorak – 1830 h 4 P 30
četvrtak – 1830 h 4 P 30
petak – 1630 h 4 P 30
ukupno

7. Raspored
Dan Tema
1. dan uvod, znanstveno istraživanje, MedCalc, unos podataka
2. dan prikaz podataka, odnos dvaju obilježja
3. dan usporedbe prosjeka
4. dan ROC, multivarijatni postupci

8. Literatura
B. Petz. Osnovne statističke metode za nematematičare. III. dopunjeno izd. Naklada Slap, Jastrebarsko, (novo izd.)
B. Dawson-Saunders, R. G. Trapp. Basic & Clinical Biostatistics. Prentice-Hall Int. Inc., London, 2000.
A. Petrie, C. Sabin. Medical statistics at a glance. Blackwell Science, Oxford, 2000.
D. Ivanković i sur. Osnovne statističke analize za medicinare. Udžbenici i priručnici Medicinskog fakulteta u Sveučilišta u Zagrebu, 1988.
M. Marušić i sur. Uvod u znanstveni rad u medicini. III. obnov. izd. Medicinska naklada, 2004.

9. Literatura

10. Ispit
kritička raščlamba statističkih postupaka objavljenog znanstvenog rada
pismeno
poslati 10 dana prije usmene obrane
časopis – citiran u Current Contents
rad:
cjelokupno istraživanje (ne osvrt na drugi objavljeni rad!)
najmanje dva priloga (tablica, slika)
jasan opis statističkih postupaka

11. Nastavak...

15. ?
nesreća… sreća…
svaki puta… desetak puta…
nemoguće… nevjerojatno…

16. Pregled metodologija znanstvenog istraživanja postupci istraživanja
neznanstveni i znanstveni postupci

17. Metodologija znanstvenog istraživanja
znanost kao način razmišljanja
znanstveno djelovanje
privremeno tumačenje
hipoteza
zaključak
provjerljivost
postavke ® činjenice ® znanje
TVRDNJA
OBRAZLOŽENJE
PROVJERA

18. Neznanstveni postupci istraživanja
ustrajnost (navika, stav, vjerovanje, inercija)
autoritet
intuicija (očiglednost)

19. Pokus pokus – istraživanje / dio istraživanja planiranje pokusa
maskiranje
randomizacija

20. Randomizacija RND (MedCalc)
funkcija slučajnog broja (uniformna raspodjela)
“RND(x) returns a computer-generated random number:
when x <= 1 then the result is a number between 0 and 1, or
when x > 1 then the result is a number between 1 and x.”
(usp. funkcija RNDNORM)

21. Randomizacija datoteka “FBF kardio” otvoriti pokazatelj “slucajan”
definirati tri skupine ispitanika po slučajnosti

22. Istraživačka logika deterministički model sustava
probabilistički model sustava
vjerojatnost događaja – p(D) 0  p(D)  1

23. Uzorak i populacija populacija mjereno obilježje
SPOZNAJA O
POPULACIJI
populacija mjereno obilježje
uzorak statistička obrada
podataka
UZORKOVANJE
PROCJENA
SPOZNAJA O
UZORKU

24. Mjerno obilježje Mjerne ljestvice NOMINALNA ORDINALNA INTERVALNA
OMJERNA

25. Jednostavni i složeni podaci
visina bolesnika 175 cm
pH krvi 7,42
sistolički tlak 85 mmHg
razina glukoze u krvi 5,14 mmol/L
brojnost CFU-GM u koštanoj srži 65 kolonija/105 stanica s jezgrom
količina citostatika 250 mg/m2 površine tijela

26. Uzorak reprezentativan mjerljiv ostvariv PROBABILISTIČKI SLUČAJAN
SUSTAVAN
STRATIFICIRAN

27. Uzorak – zavisnost
ZAVISNI
NEZAVISNI

28. Hipoteza
znanstvena hipoteza
statistička hipoteza

29. Statistička hipoteza elementarna tvrdnja
točna (istinita) ili netočna (neistinita)
provjera hipoteze = traženje istine
istina – stvarno, objektivno stanje
probabilistički sustav: istina  vjerojatnost
značajno – ono što se ostvaruje na svaki drugi način osim slučajno iskaz vjerojatnosti  razina značajnosti

30. Dokazivanje statističke hipteze
CD Kontrolna Ispitanici s Statistika
skupina PTSD H p
CD3 39,0 (15,1 – 61,1) 44 (32,3 – 57,7) 0,59 0,442
CD4 3,5 (2,1 – 5,8) 10,3 (6,5 – 17,4) 15,9 0,018
Razlikuje li se razina CD4 u ispitanika u istraživanju?
Škarpa I et al. Croat Med J 2001;42:551-5.

31. 1. postavljanje hipoteze
nulta – H0-hipoteza: razlike nema!
“Nema razlike u razinama CD4.”
suprotna – H1-hipoteza: razlike ima!
“Razine CD se razlikuju.”
samo jedna može biti istinita
samo jedna može biti prihvaćena, dok će ona druga biti odbačena

32. 2. Odabir testa testovi dokazivanja statističkih hipoteza ovisnost
osobine obilježja - mjerne ljestvice
osobine uzoraka
veličina
povezanost
osobine raspodjele
parametrijski
neparametrijski
broj obilježja - uni/bi/multivarijatni testovi

33. (nastavak) Ljestvica Jedan uzorak Dva uzorka Tri i više uzoraka
Ovisni Neovisni Ovisni Neovisni
Nominalna binomni test McNemara Cohran
hi-kvadrat Fisher hi-kvad
hi-kvadrat/
Ordinalna Kol/Smir. Wilcoxon Friedman
homologni MW p/medijan
Moses KW
Intervalna
Omjerna . . .

34. 3. Određivanje razine značajnostip
a ako se p određuje prije izračunavanja
a – vjerojatnost odbacivanja H0 kad je ona stvarno točna i istinita
tzv. a-pogrješka (pogrješka I. vrste)
što manja!
uobičajene vrijednosti, npr. p<0,05

35. (nastavak) zašto upravo to: p<0,05? POKUS
bacanje novčića: pismo/glava
2x isto uzastopce = 0,5
3x = 0,25
4x = 0,125
5x = 0,0625
...
zašto upravo to: p<0,05?

36. 4. Izračunavanje matematički račun
primjer: razlikuje li se dob ispitanika između skupina po vrsti operacije (normotermija i hipotermija)
MedCalc, “FBF Kardio.mc1”

37. 5. Zaključivanje
mala vrijednost “p” = mala vjerojatnost da ne prihvaćama ono što je istinito
zaključivanje:
p < a
vjerojatnost istinitosti H0 je mala
odbacujemo (ne prihvaćamo) nultu hipotezu
prihvaćamo alternativnu, H1
potvrdimo je, iskažemo, uz p=...

38. (nastavak – zaključak)
CD Kontrolna Ispitanici s Statistika
skupina PTSD H p
CD3 39,0 (15,1 – 61,1) 44 (32,3 – 57,7) 0,59 0,442
CD4 3,5 (2,1 – 5,8) 10,3 (6,5 – 17,4) 15,9 0,018
Razlikuje li se razina CD4 u ispitanika u istraživanju?
Škarpa I et al. Croat Med J 2001;42:551-5.

39. Pogrješke testiranja hipoteze
PRAVO STANJE ZAKLJUČENO
RAZLIKA RAZLIKA
POSTOJI (H1) NE POSTOJI (H0)
ISPRAVAN a pogrješka RAZLIKA
ZAKLJUČAK (I. vrste) POSTOJI
(H0 odbac.)
b pogrješka ISPRAVAN RAZLIKE
(II. vrste) ZAKLJUČAK NEMA
(H0 prihvat.)

40. Uzorak (nastavak) – veličina
uzorkovanje - MedCalc (engl. sampling)
primjer: sampling simple mean ...

41. Priopćavanje
E-pošta:
Klinička bolnica Dubrava
Zavod za laboratorijsku dijagnostiku
Avenija G. Šuška 6, Zagreb
( )
Katedra za informatiku
Medicinski fakultet Sveučilišta u Rijeci
Ulica braće Branchetta 20, Rijeka
( )