1. طبقه بندی باکتریهای بیماریزا

2. هدف قرار دادن باكتريها در طبقات يا Taxa هاي مختلف نامگذاري آنها تعيين هويت (Identification)

3. مشكلات طبقه بندي باكتريها سادگي ساختمان – كمي تنوع عدم شناسائي روابط فيلوژنيك ونامشخص بودن تاريخچه تكاملي آنها تغييرات سريع ژنتيكي باكتريها نگهداري در مراكز ويژه بصورت ليوفيليزه پيدايش انواع جديد

4. روشهاي طبقه بندي Phylogenic classification: شواهد تكاملي و فسيل Phenotypic taxonomy: Numerical : به هر خصوصيت امتيازي داده ميشود و امتيازات كلي با هم مقايسه ميشود شواهد ژنتيكي و ملكولي : درصد G+C هيبريداسيون DNA توالي بازها كاملترين سيستم در كتاب Bergey ارائه ميشود Type Culture Collection ATCC-PTCC

5. طبقات در باكتري شناسي (Taxa) 7 طبقه اصلي وجود دارد سلسله (Kingdom)-Domain شاخه (Phyla -Division) رده (Class) راسته (Order):al خانواده (Family):aceae جنس (Genus) گونه (Species)

6. همه در سلسله Procaryotae قرار دارند يا در دو Domain archea,Bacteria: در 4 شاخه طبقه بندي ميشوند : Firmicutes: گرم مثبت Firmibacteria Thalobacteria : Gracilicutes گرم منفي Scotobacteria Oxyphotobacteria Anoxy photobacteria

7. Tenericutes: بدون ديواره Mollicutes :Mendosicutes ديواره غير معمول ( آرشي باكتر ) Archeobacteria

9. تكامل آرشي باكترها از 4 دسته بزرگ تشكيل شده اند : Crenarcheota Euryarcheota Korarcheota: خيلي قديمي ولي قابل كشت نيست Nanoarcheota

11. جنس : تعدادي گونه كه با هم شبيه و با بقيه متفاوت باشند. گونه : تعدادي سويه كه با هم شبيه بوده ولي با بقيه متفاوت باشند سويه ( سوش -Strain): باكترئي كه از يك مخزن يا محيط جدا شود.

12. بيوتيپ : سويه هاي يك گونه از باكتريها كه عليرغم تشابه در يك يا چند خصوصيت بيولوژيك يا بيوشيميائي با هم فرق دارند. سروتيپ : تعدادي سويه يك گونه كه از نظر آنتي ژنيك با هم تفاوت دارند. فاگوتيپ : تعدادي سويه يك گونه كه از نظر حساسيت به فاژها با هم تفاوت دارند.

13. نامگذاري سليقه اي است اسم كاشف ،نام شهر يا كشور ،علامتي از بيماري و... دو اسمي است اول نام جنس ،دوم نام گونه نام جنس با حروف بزرگ انگليسي و نام گونه با حروف كوچك شروع ميشود Staphylococcus aureus گاهي كل اسم را با حروف ايتاليك مشخص مكنند گاهي فقط كلمه اول جنس را مي نويسند S.aureus

14. گاهي اسامي گروهي است كلي فرم ( باكتريهاي مشابه اشرشيا كلي ) استافيلوكوك هاي كواگولاز منفي ( استافيلوكوكهايي كه S - اورئوس نيستند ) اسامي ممكن است تغيير كند با افزايش اطلاعات گروههاي باكتري دائما در حال تغيير است

15. انواع مهم باكتري‌هاي بيماري‌زا I. كوكسي ها ، باسيلهاو باكتري‌هاي شاخه دار گرم مثبت باكتري‌هاي اسيدفاست II. كوكسي ها ، باسيلها و باكتري‌هاي ويرگولي شكل گرم منفي III. باكتري‌هاي مارپيچي IV. باكتري‌هاي فاقد ديواره سلولي