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Molecular Typing of Salmonella enterica Serovars using Two PFGE Systems Geraldine Doran Martin Cormican Interim Salmonella Reference Laboratory Ireland
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Serovars S. Kedougou S. Bredeney Systems Pharmacia Gene Navigator Bio-Rad CHEF Mapper (PulseNet) Molecular Typing of S.enterica Serovars using two PFGE Systems
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Pharmacia: 4 Subtypes CHEF Mapper:7 Subtypes S. Kedougou Results
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Molecular Typing of S.enterica Serovars using two PFGE Systems Comparison of 2 Systems TimePharmacia6 Days CHEF Mapper4 Days (3) ReproducibilityBoth reproducible Result QualityCHEF MapperEasier to intrepret Standardised
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PFGE of S. Kedougou using Pharmacia λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ ? A4 A4 A1 λ 48.5 97.0 145 194 242 291 339 kb
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PFGE of S. Kedougou using CHEF Mapper λ A1 A6 A2 λ A3 A3 A5 A4 λ A5 A5 A7 A1 λ 48 97 145 194 242 291 339 kb
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PFGE of S. Kedougou CHEF MapperPharmacia 48 97 145 242 339 kb Λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ A4 A4 A4 A1 λ λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ A4 A4 A4 A1 λ
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S Kedougou Pharmacia Reproducibility λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ ? A4 A4 A1 λ λ A1 A1 A2 λ A3 A3 A3 A4 λ A4 A4 A4 A1 λ Run 1Run 2 48 97 145 194 242 291 339 kb
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PFGE of S. Bredeney 48 97 145 194 242 291 kb λ A A2 A3 λ B C D E λ F G λ A A2 A3 B C D E F G λ CHEF MapperPharmacia
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Dendogram of S. Kedougou using Bionumerics Software
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CHEF MapperQuicker Easier to Intrepret More Reproducible Standardised (PulseNet) Conclusions
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