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Compactación del DNA Física: Molécula larga ubicada en espacios
pequeños 2) Fisiológica: Regulación de la expresión
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Compactación de DNA en procariotes
DNA E. coli: 1 mm (1 cromosoma) Tamaño de E.coli: 2 m largo, m ancho Poliaminas Proteínas asociadas H-NS, HU, IHF (similares a histonas) → formación de nucleoides Enzimas Topoisomerasa I (Lk +1 ó -1) DNA girasa (Topoisomerasa tipo II, introduce superenrollamiento a expensas de ATP, Lk -2) Cromosoma E.coli extendido
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Superenrollamiento de DNA circular
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- M: marcador PM re → se → +
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Empaquetamiento del DNA en la bacteria
DNA en solución DNA en la célula Papel de topoisomerasas en empaquetamiento de cromosoma bacteriano
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Cromosoma E.coli parcialmente empaquetado
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Compactación de DNA en eucariotes
DNA humano: 2 m Tamaño de núcleo: 10 m diámetro Cromatina (DNA + proteínas) → Empaquetamiento Primer orden de empaquetamiento: Formación de nucleosomas Histonas: Proteínas básicas (ricas en Lys y Arg) DNA extraído a baja concentración salina
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Empaquetamiento de 7 veces
10 nm Octámero: 146 pb Octámero + H1 : 168 pb Empaquetamiento de 7 veces
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Segundo orden de empaquetamiento: fibra de 30 nm (solenoide o espiral)
DNA extraído a concentración salina fisiológica Empaquetamiento de 100 veces
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FISH: hibridación in situ fluorescente
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Ordenes superiores de empaquetamiento: asas ancladas en “scaffold” o
andamiaje → cromosomas en interfase Proteínas del “scaffold” o andamiaje: Histona H1 Topoisomerasa II
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Cromosomas en interfase, no visibles por microscopía regular,
pueden ser visualizados por FISH Cromosomas 18 y 19 de linfocitos humanos en interfase
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Máxima compactación: cromosomas en mitosis (metafase)
Cromosoma: 1 molécula de DNA
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Tinción de cromosomas en metafase → Bandas características para
identificación de cromosomas (cariotipo) y detección de anormalidades Tinción de Giemsa: Bandas G en cromosomas humanos Translocación cromosómica Detección de translocación por FISH
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Grado de compactación y regulación de la expresión genética
relajado compacto
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Factores de transcripción inducen la remodelación de la cromatina
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Regulación positiva por acetilación
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Regulación negativa por desacetilación
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Silenciamiento de genes por metilación del DNA
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Identificación de regiones acetiladas en el genoma
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Modelo de silenciamiento
Cromatina Eucromatina: transcripción activa Heterocromatina: baja actividad transcripcional Modelo de silenciamiento en la heterocromatina
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