3. Diphtheria toxin deconstruction

4. Motivos: módulos simples de combinaciones de estructura secundaria ( a veces se asocian a una función) Dominios: agrupación de motivos de plegado característico (pueden o no ser unidades de plegado autónomo; pueden o no estar asociados a una función) Estructura terciaria: combinación de dominios

5. Tipos de dominios alfa beta alfa+beta alfa/beta

6. Motivo: alfa-loop-alfa

9. Figure 17: The complexation of calcium in EF hands

10. Conservation of calcium binding loop in EF-hand motifs

12. Figure 24: Effects of calcium binding of the structure of the EF-hand domain of spectrin

14. CRO repressor Motivo: alfa-turn-alfa

18. trp repressor

20. Leucine_rich repeat

23. i···i+4 + i···i+4 i···i+4 + i···i+3

24. Human growth hormone Dominio manojo de hélices

26. Dominio globina

28. myoglobin Dominio globina

29. Motivo beta hairpin

30. streptococcal protein G 3 motivos, un dominio, una proteína

37. HLA DQ, una molécula del MHC

38. Porine

56. Motivo beta-alfa-beta

59. TIM barrel:closed Rosmann fold

61. fosforibosil antranilato isomerasa +indol glicerol fosfato sintasa

65. Flavodoxina: open Rossman fold

69. Class Number of folds Number of superfamilies Number of families All alpha proteins202342550 All beta proteins141280529 Alpha and beta proteins (a/b)130213593 Alpha and beta proteins (a+b)260386650 Multi-domain proteins40 55 Membrane and cell surface proteins 428291 Small proteins72104162 Total88714472630 SCOP: Structural Classification of Proteins. 1.67 release 24037 PDB Entries (15 May 2004). 65122 Domains. 1 Literature Reference (excluding nucleic acids and theoretical models) Familias: homología de secuencia >30% (común origen evolutivo), o menor homología pero similar estructura y función. Superfamilias: baja homología secuencial pero similar estructura (probable común origen evolutivo)

73. Residue name      Atomos: 27 parametros (9 atomos) Ángulos torsionales: 6 parámetros

74. Distribuición de  1 en una proteína con 500 residuos

75. Distribuición de  2 en una proteína con 500 residuos