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第三节 群体遗传学基础
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第一节 基因频率与基因型频率 一、群体 (population) 概念:是指一个种、一个亚种、一个变 种、一个品种或一个其他同类生物类群 的所有成员的总和。 群体中的每一个成员称为个体。不同类 群生物个体的总和不能叫群体。
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Another Animal Population- 动物界 - 脊索动物门 - 哺乳纲 - 灵长目 - 人科 - 人亚科 - 人 属 -Homo sapiens 智人 -Homo sapiens sapiens 人
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二、孟德尔群体 (Mendelian population) 孟德尔群体:是指具有共同的基因库, 并由有性交配个体所组成的繁殖群体。 这里所说的基因库,是指一个群体中全 部个体所共有的全部基因。
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三、基因频率与基因型频率 可以表示群体的遗传组成,不同基因组 合体系反映了各群体性状的表现特点。
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1 、基因型频率 (genotype frequency) 基因型频率:群体中某一基因型个体数 占群体总数的比率。 例 1 :某牛群 ( 总数 N) 的有角和无角是由一对等 位基因 P 和 p 控制,它们组成 3 种基因型: PP( 个 体数 n 1, 基因型频率 D) , Pp ( 个体数 n 2, 基因型频 率 H) 和 pp ( 个体数 n 3, 基因型频率 R) 。
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2 、基因频率 (gene frequency) 基因频率:群体中某一基因占其同一位点全部 基因的比率。 不同群体间的差异是由基因频率不同所引起的, 品种间的差异实际就是基因频率的差异。
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3 、基因型频率与基因频率的性质 ⑴同一位点的各基因频率之和等于 1 ,即: p+q=1 ⑵群体中同一性状的各种基因型频率之 和等于 1 ,即: D + H + R = 1 ⑶基因频率的范围为 0≤p ( q ) ≤1 ⑷基因型频率的范围为 0≤D ( H , R ) ≤1
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4 、基因频率与基因型频率的关系 ⑴位于常染色体上的基因
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①对性染色体同型群体 (XX , ZZ) 与常染色体上基因频率和基因型频率的关系相同,即: ⑵位于性染色体上的基因 ②对性染色体异型群体 (XY , ZW) 因为基因的数量和基因型的数量相等,所以基因频率 等于基因型频率,即: p=D q=R
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第二节 遗传平衡定律 英国数学家哈代 (Hardy) 和德国医生温伯 格 (Weinberg) ,于 1908 年发现了有关基 因频率和基因型频率的重要规律,称为 哈代-温伯格定律,或叫基因平衡定律。
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1 、哈代-温伯格定律的要点 ⑴在随机交配的大群体中,若没有其他 因素的影响,基因频率世代不变。 ⑵任何一个大群体,无论基因频率如何, 只要经过一代随机交配,一对常染色体 基因的基因型频率就达到平衡状态。 ⑶在平衡群体中,基因频率和基因型频 率的关系为:
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2 、定律适用的前提条件 ⑴必须是大群体 ⑵随机交配 ⑶无迁移、突变和选择现象 一个有性繁殖的生物群体中, 每个雌雄个体间具有同样的交 配概率。
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3 、哈代-温伯格定律的证明 ⑴数学证明 ①基因型频率的恒定性 ②基因频率的恒定性 ⑵生物学证明 人的 MN 血型
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( 1 )数学证明 假设 0 世代的 A 基因、 a 基因的基因频率为: p 0 和 q 0 ,基因型频率为 D 0 , H 0 和 R 0 ; 一世代的基因频率为: p 1 和 q 1 ,基因型 频率为 D 1 , H 1 和 R 1 ; 二世代的基因频率为: p 2 和 q 2 ,基因型 频率为 D 2 , H 2 和 R 2 ;
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数学证明 0 世代的个体所产生的配子带有 A 基因或 a 基因的概率各为多少呢? 在任何一个大群体中,任何一个配子带 有某一基因的概率等于该基因在这个群 体中的频率。即:
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一世代个体的各基因型频率 配子精 子 卵 子 卵 子 基因 Aa A 频率 p0p0 q0q0 p0p0 AA Aa a q0q0 aa
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①基因频率的恒定性 由上表可知: ∴一世代的基因频率为: ∴同样可证明: …
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一世代雌雄配子随机结合结果 ♂ ♀ Ap1Ap1 a q 1 A p 1 a q 1 AA Aa aa 由上表可知: 同理可得:
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②基因型频率的恒定性 由上面的证明可以看出: 基因型频率虽然 D1≠D0 , H1≠H0 , R1≠R0 ,但经地一代随机交配,基因型 频率就达到平衡,基因频率也始终保持 不变。
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( 2 )生物学证明 人的 MN 血型 这个性状的基因型与表型一致,易于分辨基 因型(从而便于计算基因频率)。 这个性状在婚配时是不加选择的,且与适应 性无关,也就不受自然选择的影响。就此性 状来说,一般都是随机交配的。 人的群体很大,有可能在相当大的群体中进 行调查。
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香港一千多个中国人的 MN 血型 血型 MMNN 总计 基因型 LMLMLMLM LMLNLMLN LNLNLNLN 观察数 3425001871029 频率 0.33240.48590.18171 p=0.3324+0.24295=0.57535 q=0.24295+0.1817=0.42465
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平衡状态检验 就此性状来说,基本上是随机交配的而且群体 较大,应处于平衡状态。 ∴ D = p 2 H=2pq R=q 2 计算出的血型理论分布 为: 血型 MMNN 总计 平衡时的 理论频率 p 2 =0.33102pq=0.4887q 2 =0.18031 平衡时的 理论个数 340.6520.9185.51029
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统计分析 理论值与观察数比较: χ 2 = 0.031 , p=0.85 由此可见: 实际值与理论值是一致的(没有显著差 异), MN 血型在人群中处于平衡状态。
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第三节 基因频率的计算 1 、无显性或显性不完全时 例:短角牛有白色、红色和沙色三种, 而沙色是红、白牛的杂交后代。在牛群 中白、沙、红 3 种色分别占 35% 、 50% 和 15% ,计算基因频率
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第三节 基因频率的计算 2 、完全显性时 例:一个随机交配的牛群中,黑色对红 色为显性,黑牛 (BB 、 Bb) 占 96% ,红牛 (bb) 占 4% ,求基因频率
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第三节 基因频率的计算 3 、伴性基因 男人中色盲者所占的比率就是色盲 基因在整个群体(男人)中所占的频率。 女性群体中的色盲基因计算:
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第三节 基因频率的计算 4 、复等位基因 例:人的 ABO 血型
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人 ABO 血型随机交配下一代的基因型 及其频率 ♂ ♀ pq irir p q i r
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人 ABO 血型随机交配下一代的 表现型与基因型频率 表现型基因型基因型频率表现型频率 A 型A 型 B 型B 型 AB 型 O 型O 型
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复等位基因的计算方法 首先从隐性个体频率计算 I 基因的频率:
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实例 Fan C. S. 1944 年在昆明调查了 6000 个中 国人的 ABO 血型,其中 O 型 1846 人, A 型 1920 人, B 型 1672 人, AB 型 607 人,求各 基因的基因频率
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习题 1 安达鲁西鸡有三种毛色:黑色、蓝色和 白花。 它们是由一对基因控制的,黑色的基因 型为 BB ,蓝色的基因型为 Bb ,白花的 基因型为 bb 。 大群调查结果:黑色鸡占 49% ,蓝色鸡 占 42% ,白花鸡占 9% 。 求各 B 、 b 基因的基因频率
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习题 2 能够品尝某一特殊化学药物的能力归因 于某一特定显性基因的存在。在一个 l 000 人的群体中,有 16 人是不能品尝者。 试估算隐性基因之频率。
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习题 3 某一特定常染色体隐性基因决定某遗传 疾病。发现这种疾病以万分之一的频率 出现。 在这个群体中预期该基因的携带者的频 率是多少?
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习题 4 对于等位基因 A 和 a ,下列群体哪一个处 于哈代一温伯格平衡 ? A . 50AA , 2Aa , 48aa B . 49AA , 42Aa , 9aa C . 100AA , 10aa D . 50AA . 50aa E . 75AA , 1Aa , 30aa
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习题 5 有人在 190 177 人中进行 ABO 血型分析, 发现 O 型有 88 783 人, A 型有 7 933 人。 计算 i A 基因频率 p , i B 基因频率 q 和 i 基因 频率 r 。
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