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第九章 核糖体 Robinson & Brown ( 1953 )发现于植物细胞, Palacle ( 1955 )发现于动物细胞, Roberts ( 1958 )建 议命名为核糖核蛋白体( ribosome ),简称核糖体。核糖 体是所有类型的细胞内合成蛋白质的工厂,在一个旺盛生 长的细菌中,大约有 20000 个核糖体,其蛋白占细胞总蛋 白的 10% , RNA 占细胞总 RNA 的 80% 。
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核糖体是颗粒结构,没有被膜,直径为 25 nm 。核糖体 含 40% 的蛋白质、 60% 的 RNA ,蛋白按照一定的顺序与 RNA 结合,组成两个核糖体亚单体,其中 RNAs 是骨架结 构,有些蛋白质不直接与 RNA 结合,而是结合在其它蛋白 质组分上。核糖体中的蛋白质, rRNA 以及其他一些辅助因 子在一起提供了翻译过程所需的全部酶活性,这些酶活性 只有在核糖体整体结构存在的情况下才具备。
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一、核糖体的类型与成分 类型: 70S 核糖体(原核细胞、线粒体、叶绿体),相对分子 量 2500 ×10 3 ; 80S 核糖体(真核细胞),相对分子量 4800 ×10 3 , 含两个亚基。 成分: 70S 50S (其中 RNA23S 和 5S ) 30S (其中 RNA16S ) 60S (其中 RNA28S 、 5.8S 和 5S ) 40S (其中 RNA18S ) 80S 核糖体大小亚基常游离于细胞基质中,当小亚基结合 mRNA 后,大亚基才与其结合,形成完整的核糖体。
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原核生物与真核生物核糖体成分的比较
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二 、核糖体结构 蛋白质的结构 E.coli 核糖体的 52 种蛋白质,几乎所有蛋白质的一级结构 都不同,在免疫学上也没有同源性。而在不同种的原核生物 核糖体蛋白质之间却有很高的同源性,序列分析和免疫反应 都证明了这一点,说明不同物种细胞中的核糖体可能来源于 共同的祖先,在进化上非常保守。在氨基酸选择上应当是随 机的,由于核糖体的功能具有普遍意义,所以不同种的原核 生物核糖体蛋白质之间具有很高的同源性。
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RNA 的结构 对 500 多个不同种生物的研究表明, rRNA 是高度保守的 ,有些序列是完全一致的。尽管不同种的 rRNA 一级结构可 能有所不同,但它们都折叠成相似的二级结构(由多个臂 环组成的结构)。 通过中子衍射技术分析可获得 rRNA 臂环结构的三级结构 ,再根据与蛋白质结合的 rRNA 序列及蛋白质与蛋白质之间 的关系,提出了 70S 核糖体的小亚单位中 rRNA 与全部 r 蛋白 关系的空间模型。
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三 三、核糖体蛋白质和 rRNA 的功能 核糖体上具有一系列与蛋白质合成有关的结合位点与催 化位点: 1 、与 mRNA 的结合位点; 2 、 A 位点 (氨酰基位点,与新掺入的氨酰 tRNA 结合); 3 、 P 位点(肽酰基位点,与延伸中的酰肽 tRNA 结合); 4 、 E 位点(肽酰转移后与即将释放的 tRNA 结合); 5 、与肽酰 tRNA 从 A 位点转移到 P 位点有关的转移酶的结合 位点; 6 、肽酰转移酶的催化位点; 核糖体中最主要的活性部位是肽酰转移酶的催化位点
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过去一直认为在核糖体中一定有某种或某类蛋白质在催 化蛋白质合成中起重要作用。但目前认为,在核糖体中 rRNA 是起主要作用的结构成分,主要功能为: ( 1 )具有肽酰转移酶活性; ( 2 )为 tRNA 提供结合位点( A 位点、 P 位点和 E 位点); ( 3 )为多种蛋白质合成因子提供结合位点; ( 4 )在蛋白质合成起始时参与同 mRNA 选择性地结合以及 肽链延伸时与 mRNA 结合。 对核糖体蛋白的功能有多种推测,( 1 )对 rRNA 折叠成有 功能地三维结构十分重要;( 2 )对核糖体的构象变化起到 微调作用;( 3 )在核糖体的结合位点及催化位点上与 rRNA 共同作用。
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四、多聚核糖体 核糖体常几个或几十个串联在一条 mRNA 分子上高效 地进行肽链合成,形成多聚核糖体。核糖体的数目与 mRNA 的长度正相关。在真核生物中每个核糖体每秒能合 成两个氨基酸残基,合成一条完整的多肽链平均需要 20s- 几分钟,相邻核糖体间一般有 80 个核苷酸的距离。 原核生物在 mRNA 合成的同时,核糖体就结合到 mRNA 上,基因转录和蛋白质翻译同步进行。
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五、蛋白质合成 以原核生物为例: ( 1 ) mRNA 上 AUG 上游有 6 个碱基的核糖体结合序列,可 与 16S rRNA 的 3‘ 端碱基配对,使 mRNA 与 30S 的核糖体小亚 基结合,甲酰甲硫氨酸 tRNA 的反密码子与 mRNA 的 AUG 配 对,形成起始复合物。 ( 2 ) 50S 大亚基与复合物中的 30S 亚基结合,形成完整复合 物, GTP 水解, IF1 、 IF2 和 IF3 释放,甲酰甲硫氨酸分子占 据 P 位点,确定读码框架。
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( 3 )肽链延伸:氨酰 tRNA 与延伸因子 EF-Tu 和 GTP 形成的 复合物结合;延伸因子将氨酰 tRNA 放在 A 位点, mRNA 上的 密码子决定酰氨 tRNA 的种类;肽链生成与移位由肽酰转移酶 完成,肽酰 tRNA 从 A 位转移至 P 位。 ( 4 )蛋白质合成终止 A 位点是 UAA 、 UGA 、 UAG 时,氨基酰 tRNA 不能结合到核 糖体上。
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六、 RNA 在生命起源中的地位 RNA 即具有信息载体的功能又具有酶的催化功能,可能是 生命起源中最早的生物大分子。 信息功能: mRNA 是信使 RNA ;许多病毒的基因载体是 RNA 。 催化功能:近 20 年才发现,把一系列具有催化作用的 RNA 称为核酶 (ribozyme) ,不仅可催化 RNA 和 DNA 水解、连接、 mRNA 的剪切,某些 RNA 还可在体外催化 RNA 聚合反应、 RNA 的磷酸化、氨基化和烷基化等, rRNA 具有肽酰转移 酶活性。
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