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Insomnia? Drug effects Body Homeo- stasis Regulating body temperature Blood pressure Hunger Patterns Biological detectors Monitoring sewage waste? Fermentation production? Further research Understanding Circadian Rhythms
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Synchronizing Genetic Relaxation Oscillators by Inter-cell Signaling
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Modeling a synthetic multicellular clock: Repressilators coupled by quorum sensing
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Taattcgcggccgcttctagagattgtgagcggataacaattgacattgtgagcggataacaagatactgagcactactagagaaagaggagaaatactagatgactataatgataaaaaaat cggattttttggcaattccatcggaggagtataaaggtattctaagtcttcgttatcaagtgtttaagcaaagacttgagtgggacttagttgtagaaaataaccttgaatcagatgagtatgataactc aaatgcagaatatatttatgcttgtgatgatactgaaaatgtaagtggatgctggcgtttattacctacaacaggtgattatatgctgaaaagtgtttttcctgaattgcttggtcaacagagtgctcccaa agatcctaatatagtcgaattaagtcgttttgctgtaggtaaaaatagctcaaagataaataactctgctagtgaaattacaatgaaactatttgaagctatatataaacacgctgttagtcaaggtatt acagaatatgtaacagtaacatcaacagcaatagagcgatttttaaagcgtattaaagttccttgtcatcgtattggagacaaagaaattcatgtattaggtgatactaaatcggttgtattgtctatgc ctattaatgaacagtttaaaaaagcagtcttaaatgctgcaaacgacgaaaactacgctttagtagcttaataactctgatagtgctagtgtagatctctactagagaaagaggagaaatactagat ggcttcctccgaagacgttatcaaagagttcatgcgtttcaaagttcgtatggaaggttccgttaacggtcacgagttcgaaatcgaaggtgaaggtgaaggtcgtccgtacgaaggtacccaga 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Simulations predicted Oscillations Results were reproduced in the Lab Coupled vs. Uncoupled
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3D System Gillespie Algorithm Diffusion Transmembrane Transport Continuous: Continuum Approximations Discrete: Computationally Intensive & small number of molecules Developing a new algorithm directly used with novel hardware
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Thanks to everyone involved: Prof. Jay Nadeau Elvis Prandzic Adrian Kaats Hanmo Li Dongting Yu Stephanie Yee Alexandre David Allan Lim Jimmy Huynh Susan Westfall James Gabriels Ariq Emtenan Adam Katolik Alix Dudley Horia Vulpe Justin Ang Scott Gallagher Tim Johnstone Avi Biswas
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